RNA–Protein interactions for RNA: YBR003W

COQ1, Transcript of Hexaprenyl pyrophosphate synthetase, yeastyeast

Gene COQ1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COQ1YBR003W OXP1P28273 1286 aa8.97□□□□□ -0.97
COQ1YBR003W ESL2P36168 1195 aa8.96□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W BCK1Q01389 1478 aa8.93□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W UBP9P39967 754 aa8.91□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W RAD9P14737 1309 aa8.91□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W EPS1P40557 701 aa8.9□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W KIP3P53086 805 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W MAK10Q02197 733 aa8.9□□□□□ -0.98
COQ1YBR003W USO1P25386 1790 aa8.89□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W ALD4P46367 519 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W MHP1P43638 1398 aa8.88□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W BDF1P35817 686 aa8.88□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W CAB1Q04430 367 aa8.88□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W KRE5P22023 1365 aa8.86□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W TAF8Q03750 510 aa8.86□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W SPE2P21182 396 aa8.85□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W MRX12P47084 519 aa8.85□□□□□ -0.99
COQ1YBR003W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP8.84□□□□□ -1
COQ1YBR003W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
COQ1YBR003W NAP1P25293 417 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
COQ1YBR003W RIA1P53893 1110 aa8.82□□□□□ -1
COQ1YBR003W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
COQ1YBR003W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
COQ1YBR003W SPT7P35177 1332 aa8.81□□□□□ -1
COQ1YBR003W PTP3P40048 928 aa8.8□□□□□ -1
COQ1YBR003W SCT1P32784 759 aa8.8□□□□□ -1
COQ1YBR003W PDS5Q04264 1277 aa8.78□□□□□ -1
COQ1YBR003W MIF2P35201 549 aa8.77□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W LEU3P08638 886 aa8.73□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W RCM1P53972 490 aa8.72□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W ENP1P38333 483 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
COQ1YBR003W MST1P07236 462 aa8.71□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.71□□□□□ -1.02not detected
COQ1YBR003W RTG3P38165 486 aa8.71□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W YMR196WQ04336 1088 aa8.7□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W PSK1P31374 1356 aa8.69□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W PPH3P32345 308 aa8.69□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W FKH1P40466 484 aa8.69□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W NST1P53935 1240 aa8.68□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W YML133CQ03099 1374 aa8.68□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W YLL067CQ07888 1374 aa8.68□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W YLL066CQ99208 1374 aa8.68□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W CPS1P27614 576 aa8.67□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W THI12P42883 340 aa8.67□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W THI5P43534 340 aa8.67□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W RSM7P47150 247 aa8.67□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W THI11P47183 340 aa8.67□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W THI13Q07748 340 aa8.67□□□□□ -1.02
COQ1YBR003W AI2P03876 854 aa8.63□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W YOR238WQ08634 303 aa8.63□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.63□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W TY4B-HP0C2J7 1802 aa8.63□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W TY4B-JP47024 1803 aa8.63□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W BBC1P47068 1157 aa8.63□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
COQ1YBR003W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W TRK1P12685 1235 aa8.57□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W PDI1P17967 522 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W SNF2P22082 1703 aa8.56□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W CSE4P36012 229 aa8.54□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W YFR006WP43590 535 aa8.54□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W RTF1P53064 558 aa8.54□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W TAP42Q04372 366 aa8.54□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W YIL177CP40434 1758 aa8.53□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W YJL225CP40889 1758 aa8.53□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W KAR2P16474 682 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W PRS1P32895 427 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W YAP5P40574 245 aa8.53□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W PRP43P53131 767 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
COQ1YBR003W AUS1Q08409 1394 aa8.52□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W VNX1P42839 908 aa8.52□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W HIM1Q06674 414 aa8.51□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W GRX4P32642 244 aa8.5□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W IOC4Q04213 475 aa8.49□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W GAS4Q08271 471 aa8.49□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W YRF1-2P40105 1681 aa8.49□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W YLR271WQ06152 274 aa8.48□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W FKS3Q04952 1785 aa8.48□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W PAP2P53632 584 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W URB1P34241 1764 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
COQ1YBR003W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
COQ1YBR003W YDL144CQ07589 356 aa8.46□□□□□ -1.06
COQ1YBR003W RPP0P05317 312 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COQ1YBR003W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
COQ1YBR003W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.1 ms