RNA–Protein interactions for RNA: HRA1

HRA1, Non-protein-coding RNA, yeast

Gene HRA1, Length 564 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRA1	HRA1	YRF1-2	P40105	1681 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HRA1	HRA1	YBL086C	P38177	466 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HRA1	HRA1	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HRA1	HRA1	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HRA1	HRA1	RTC1	Q08281	1341 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HRA1	HRA1	UGA2	P38067	497 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HRA1	HRA1	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
HRA1	HRA1	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
HRA1	HRA1	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
HRA1	HRA1	GTT3	P39996	337 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HRA1	HRA1	CPS1	P27614	576 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HRA1	HRA1	DOT5	P40553	215 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HRA1	HRA1	YJL181W	P46987	611 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HRA1	HRA1	RCM1	P53972	490 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HRA1	HRA1	IES2	P40154	320 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	ALD2	P47771	506 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	EDE1	P34216	1381 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	TAF8	Q03750	510 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	PSK1	P31374	1356 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	NPR2	P39923	615 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HRA1	HRA1	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	TCB1	Q12466	1186 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	PPH3	P32345	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	ESL2	P36168	1195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	LAM6	Q08001	693 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HRA1	HRA1	RSF2	P46974	1380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	TY4B-J	P47024	1803 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	CTH1	P47976	325 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	SLM3	Q12093	417 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	YKL133C	P36066	463 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HRA1	HRA1	COB	P00163	385 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HRA1	HRA1	CSE4	P36012	229 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HRA1	HRA1	YKR075C	P36155	307 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HRA1	HRA1	FKS3	Q04952	1785 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HRA1	HRA1	SPT7	P35177	1332 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	XKS1	P42826	600 aa		11	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	SPE2	P21182	396 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	ALD3	P54114	506 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	YRF1-4	O13559	1382 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	BDF1	P35817	686 aa		10.98	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	YRF1-6	P53819	1859 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HRA1	HRA1	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
HRA1	HRA1	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
HRA1	HRA1	MEC3	Q02574	474 aa		10.92	□□□□□ -0.66
HRA1	HRA1	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
HRA1	HRA1	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
HRA1	HRA1	MSB4	Q12317	492 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HRA1	HRA1	SAP155	P43612	1002 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HRA1	HRA1	EAF6	P47128	113 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HRA1	HRA1	BUG1	Q12191	341 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HRA1	HRA1	FAP1	P53971	965 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	APC1	P53886	1748 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	RCR1	P38212	213 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	MSN5	P52918	1224 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	ATG13	Q06628	738 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	HPC2	Q01448	625 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	CTT1	P06115	562 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	TOS1	P38288	455 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	SCT1	P32784	759 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	GAS4	Q08271	471 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	SNF2	P22082	1703 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	SIR4	P11978	1358 aa		10.77	□□□□□ -0.68
HRA1	HRA1	RAD4	P14736	754 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	PEX21	P50091	288 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	RRT14	P40470	206 aa		10.75	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	YIL177C	P40434	1758 aa		10.75	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	YJL225C	P40889	1758 aa		10.75	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	RTF1	P53064	558 aa		10.74	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	YKL222C	P35995	705 aa		10.73	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
HRA1	HRA1	MHP1	P43638	1398 aa		10.71	□□□□□ -0.69

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