RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626716.1

R3HDM4-208, Transcript of R3H domain containing 4, human

TSL 5 BASIC

Gene R3HDM4, Length 138 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
R3HDM4-208	ENST00000626716	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.41	■■■■■ 4.22
R3HDM4-208	ENST00000626716	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.4	■■■■■ 4.22
R3HDM4-208	ENST00000626716	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.38	■■■■■ 4.22
R3HDM4-208	ENST00000626716	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.36	■■■■■ 4.21
R3HDM4-208	ENST00000626716	KIF14	Q15058	1648 aa		41.35	■■■■■ 4.21
R3HDM4-208	ENST00000626716	CLIP1	P30622	1438 aa		41.33	■■■■■ 4.21
R3HDM4-208	ENST00000626716	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.31	■■■■■ 4.2
R3HDM4-208	ENST00000626716	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.3	■■■■■ 4.2
R3HDM4-208	ENST00000626716	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.26	■■■■■ 4.2
R3HDM4-208	ENST00000626716	MLEC	Q14165	292 aa		41.26	■■■■■ 4.2
R3HDM4-208	ENST00000626716	ATP10A	O60312	1499 aa		41.25	■■■■■ 4.19
R3HDM4-208	ENST00000626716	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.24	■■■■■ 4.19
R3HDM4-208	ENST00000626716	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.23	■■■■■ 4.19
R3HDM4-208	ENST00000626716	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.22	■■■■■ 4.19
R3HDM4-208	ENST00000626716	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.21	■■■■■ 4.19
R3HDM4-208	ENST00000626716	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.19	■■■■■ 4.18
R3HDM4-208	ENST00000626716	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.18	■■■■■ 4.18
R3HDM4-208	ENST00000626716	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.17	■■■■■ 4.18
R3HDM4-208	ENST00000626716	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.17	■■■■■ 4.18
R3HDM4-208	ENST00000626716	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.13	■■■■■ 4.17
R3HDM4-208	ENST00000626716	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.12	■■■■■ 4.17
R3HDM4-208	ENST00000626716	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.1	■■■■■ 4.17
R3HDM4-208	ENST00000626716	KDM5C	P41229	1560 aa		41.09	■■■■■ 4.17
R3HDM4-208	ENST00000626716	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		41.07	■■■■■ 4.16
R3HDM4-208	ENST00000626716	HSPA2	P54652	639 aa		41.06	■■■■■ 4.16
R3HDM4-208	ENST00000626716	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.03	■■■■■ 4.16
R3HDM4-208	ENST00000626716	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.02	■■■■■ 4.16
R3HDM4-208	ENST00000626716	FBXO41	Q8TF61	875 aa		41.01	■■■■■ 4.16
R3HDM4-208	ENST00000626716	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.98	■■■■■ 4.15
R3HDM4-208	ENST00000626716	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.96	■■■■■ 4.15
R3HDM4-208	ENST00000626716	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.95	■■■■■ 4.15
R3HDM4-208	ENST00000626716	ABCC1	P33527	1531 aa		40.94	■■■■■ 4.14
R3HDM4-208	ENST00000626716	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.93	■■■■■ 4.14
R3HDM4-208	ENST00000626716	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
R3HDM4-208	ENST00000626716	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.9	■■■■■ 4.14
R3HDM4-208	ENST00000626716	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.89	■■■■■ 4.14
R3HDM4-208	ENST00000626716	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.87	■■■■■ 4.13
R3HDM4-208	ENST00000626716	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
R3HDM4-208	ENST00000626716	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
R3HDM4-208	ENST00000626716	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
R3HDM4-208	ENST00000626716	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.8	■■■■■ 4.12
R3HDM4-208	ENST00000626716	AGL	P35573	1532 aa		40.79	■■■■■ 4.12
R3HDM4-208	ENST00000626716	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.79	■■■■■ 4.12
R3HDM4-208	ENST00000626716	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
R3HDM4-208	ENST00000626716	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.74	■■■■■ 4.11
R3HDM4-208	ENST00000626716	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.73	■■■■■ 4.11
R3HDM4-208	ENST00000626716	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
R3HDM4-208	ENST00000626716	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.69	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.69	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.68	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.67	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.66	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	C3	P01024	1663 aa		40.65	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.64	■■■■■ 4.1
R3HDM4-208	ENST00000626716	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.6	■■■■■ 4.09
R3HDM4-208	ENST00000626716	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.6	■■■■■ 4.09
R3HDM4-208	ENST00000626716	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.59	■■■■■ 4.09
R3HDM4-208	ENST00000626716	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.55	■■■■■ 4.08
R3HDM4-208	ENST00000626716	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.53	■■■■■ 4.08
R3HDM4-208	ENST00000626716	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.5	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.47	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	A2M	P01023	1474 aa		40.45	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.45	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.45	■■■■■ 4.07
R3HDM4-208	ENST00000626716	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.43	■■■■■ 4.06
R3HDM4-208	ENST00000626716	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.4	■■■■■ 4.06
R3HDM4-208	ENST00000626716	NPAT	Q14207	1427 aa		40.4	■■■■■ 4.06
R3HDM4-208	ENST00000626716	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.38	■■■■■ 4.05
R3HDM4-208	ENST00000626716	GGT6	Q6P531	493 aa		40.37	■■■■■ 4.05
R3HDM4-208	ENST00000626716	PTPRT	O14522	1441 aa		40.36	■■■■■ 4.05
R3HDM4-208	ENST00000626716	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.33	■■■■■ 4.05
R3HDM4-208	ENST00000626716	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.32	■■■■■ 4.05
R3HDM4-208	ENST00000626716	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
R3HDM4-208	ENST00000626716	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.31	■■■■■ 4.04
R3HDM4-208	ENST00000626716	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.27	■■■■■ 4.04
R3HDM4-208	ENST00000626716	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.26	■■■■■ 4.03
R3HDM4-208	ENST00000626716	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.23	■■■■■ 4.03
R3HDM4-208	ENST00000626716	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
R3HDM4-208	ENST00000626716	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.21	■■■■■ 4.03
R3HDM4-208	ENST00000626716	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.2	■■■■■ 4.03
R3HDM4-208	ENST00000626716	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.19	■■■■■ 4.02
R3HDM4-208	ENST00000626716	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.17	■■■■■ 4.02
R3HDM4-208	ENST00000626716	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.16	■■■■■ 4.02
R3HDM4-208	ENST00000626716	KIF3B	O15066	747 aa		40.12	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.12	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.1	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.1	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.08	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.07	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.07	■■■■■ 4.01
R3HDM4-208	ENST00000626716	PKD2	Q13563	968 aa		40.06	■■■■■ 4
R3HDM4-208	ENST00000626716	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.06	■■■■■ 4
R3HDM4-208	ENST00000626716	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.06	■■■■■ 4
R3HDM4-208	ENST00000626716	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.03	■■■■■ 4
R3HDM4-208	ENST00000626716	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.01	■■■■■ 4

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