RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-215ENST00000626257 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
CCZ1B-215ENST00000626257 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.3■■■■□ 3.56
CCZ1B-215ENST00000626257 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
CCZ1B-215ENST00000626257 NUP160Q12769 1436 aa37.29■■■■□ 3.56
CCZ1B-215ENST00000626257 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
CCZ1B-215ENST00000626257 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.25■■■■□ 3.55
CCZ1B-215ENST00000626257 JPH4Q96JJ6 628 aa37.24■■■■□ 3.55
CCZ1B-215ENST00000626257 ANP32CO43423 234 aa37.18■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 CCER2I3L3R5 266 aa37.16■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 FOXD1Q16676 465 aa37.16■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.15■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.15■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.15■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
CCZ1B-215ENST00000626257 KIF14Q15058 1648 aa37.13■■■■□ 3.53
CCZ1B-215ENST00000626257 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.1■■■■□ 3.53
CCZ1B-215ENST00000626257 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
CCZ1B-215ENST00000626257 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.08■■■■□ 3.53
CCZ1B-215ENST00000626257 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCA8O94911 1581 aa37.03■■■■□ 3.52
CCZ1B-215ENST00000626257 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CCZ1B-215ENST00000626257 NCOA1Q15788 1441 aa37.02■■■■□ 3.52
CCZ1B-215ENST00000626257 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
CCZ1B-215ENST00000626257 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.51
CCZ1B-215ENST00000626257 ADGBQ8N7X0 1667 aa37■■■■□ 3.51
CCZ1B-215ENST00000626257 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.97■■■■□ 3.51
CCZ1B-215ENST00000626257 ADGRL2O95490 1459 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1B-215ENST00000626257 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.96■■■■□ 3.51
CCZ1B-215ENST00000626257 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.95■■■■□ 3.51
CCZ1B-215ENST00000626257 ATP10BO94823 1461 aa36.95■■■■□ 3.51
CCZ1B-215ENST00000626257 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.94■■■■□ 3.5
CCZ1B-215ENST00000626257 PZPP20742 1482 aa36.94■■■■□ 3.5
CCZ1B-215ENST00000626257 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.94■■■■□ 3.5
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.89■■■■□ 3.5
CCZ1B-215ENST00000626257 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.88■■■■□ 3.49
CCZ1B-215ENST00000626257 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.87■■■■□ 3.49
CCZ1B-215ENST00000626257 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.86■■■■□ 3.49
CCZ1B-215ENST00000626257 CHD1O14646 1710 aa36.83■■■■□ 3.49
CCZ1B-215ENST00000626257 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.77■■■■□ 3.48
CCZ1B-215ENST00000626257 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.77■■■■□ 3.48
CCZ1B-215ENST00000626257 PTPRGP23470 1445 aa36.77■■■■□ 3.48
CCZ1B-215ENST00000626257 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.76■■■■□ 3.48
CCZ1B-215ENST00000626257 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.73■■■■□ 3.47
CCZ1B-215ENST00000626257 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CCZ1B-215ENST00000626257 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.73■■■■□ 3.47
CCZ1B-215ENST00000626257 CCDC7Q96M83 1385 aa36.71■■■■□ 3.47
CCZ1B-215ENST00000626257 PKD2Q13563 968 aa36.7■■■■□ 3.47
CCZ1B-215ENST00000626257 SHROOM2Q13796 1616 aa36.69■■■■□ 3.46
CCZ1B-215ENST00000626257 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.68■■■■□ 3.46
CCZ1B-215ENST00000626257 MBD5Q9P267 1494 aa36.64■■■■□ 3.46
CCZ1B-215ENST00000626257 TSPY4P0CV99 314 aa36.63■■■■□ 3.46
CCZ1B-215ENST00000626257 TSPY10P0CW01 314 aa36.63■■■■□ 3.46
CCZ1B-215ENST00000626257 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.61■■■■□ 3.45
CCZ1B-215ENST00000626257 NUP155O75694 1391 aa36.59■■■■□ 3.45
CCZ1B-215ENST00000626257 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
CCZ1B-215ENST00000626257 FKBP8Q14318 412 aa36.59■■■■□ 3.45
CCZ1B-215ENST00000626257 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.55■■■■□ 3.44
CCZ1B-215ENST00000626257 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.54■■■■□ 3.44
CCZ1B-215ENST00000626257 KIF15Q9NS87 1388 aa36.54■■■■□ 3.44
CCZ1B-215ENST00000626257 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CCZ1B-215ENST00000626257 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.53■■■■□ 3.44
CCZ1B-215ENST00000626257 PREX2Q70Z35 1606 aa36.53■■■■□ 3.44
CCZ1B-215ENST00000626257 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.52■■■■□ 3.44
CCZ1B-215ENST00000626257 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.49■■■■□ 3.43
CCZ1B-215ENST00000626257 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
CCZ1B-215ENST00000626257 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
CCZ1B-215ENST00000626257 BCANQ96GW7 911 aa36.47■■■■□ 3.43
CCZ1B-215ENST00000626257 NEFLP07196 543 aa36.47■■■■□ 3.43
CCZ1B-215ENST00000626257 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
CCZ1B-215ENST00000626257 CCDC184Q52MB2 194 aa36.43■■■■□ 3.42
CCZ1B-215ENST00000626257 USP47Q96K76 1375 aa36.42■■■■□ 3.42
CCZ1B-215ENST00000626257 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.42■■■■□ 3.42
CCZ1B-215ENST00000626257 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.41■■■■□ 3.42
CCZ1B-215ENST00000626257 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.38■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.38■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.37■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.37■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.36■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 KDM5CP41229 1560 aa36.35■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 ABCC2Q92887 1545 aa36.35■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.35■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.34■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.34■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.33■■■■□ 3.41
CCZ1B-215ENST00000626257 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.31■■■■□ 3.4
CCZ1B-215ENST00000626257 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa36.3■■■■□ 3.4
CCZ1B-215ENST00000626257 MRS2Q9HD23 443 aa36.29■■■■□ 3.4
CCZ1B-215ENST00000626257 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.29■■■■□ 3.4
CCZ1B-215ENST00000626257 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CCZ1B-215ENST00000626257 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.23■■■■□ 3.39
CCZ1B-215ENST00000626257 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CCZ1B-215ENST00000626257 FAM9BQ8IZU0 186 aa36.23■■■■□ 3.39
CCZ1B-215ENST00000626257 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.22■■■■□ 3.39
CCZ1B-215ENST00000626257 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.22■■■■□ 3.39
CCZ1B-215ENST00000626257 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.2■■■■□ 3.39
CCZ1B-215ENST00000626257 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.19■■■■□ 3.38
CCZ1B-215ENST00000626257 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.19■■■■□ 3.38
CCZ1B-215ENST00000626257 UNC13BO14795 1591 aa36.18■■■■□ 3.38
CCZ1B-215ENST00000626257 PLXNC1O60486 1568 aa36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms