RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623772.1

C17orf82-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 82, humanhuman

BASIC

Gene C17orf82, Length 1,530 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf82-201ENST00000623772 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
C17orf82-201ENST00000623772 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.33■■■■□ 3.25
C17orf82-201ENST00000623772 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
C17orf82-201ENST00000623772 NCOA2Q15596 1464 aa35.33■■■■□ 3.25
C17orf82-201ENST00000623772 AKNAQ7Z591 1439 aa35.3■■■■□ 3.24
C17orf82-201ENST00000623772 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.3■■■■□ 3.24
C17orf82-201ENST00000623772 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.29■■■■□ 3.24
C17orf82-201ENST00000623772 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.27■■■■□ 3.24
C17orf82-201ENST00000623772 ADGRL1O94910 1474 aa35.22■■■■□ 3.23
C17orf82-201ENST00000623772 RICTORQ6R327 1708 aa35.19■■■■□ 3.22
C17orf82-201ENST00000623772 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.18■■■■□ 3.22
C17orf82-201ENST00000623772 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.17■■■■□ 3.22
C17orf82-201ENST00000623772 ABCC1P33527 1531 aa35.16■■■■□ 3.22
C17orf82-201ENST00000623772 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
C17orf82-201ENST00000623772 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
C17orf82-201ENST00000623772 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.14■■■■□ 3.22
C17orf82-201ENST00000623772 RAPGEF3O95398 923 aa35.11■■■■□ 3.21
C17orf82-201ENST00000623772 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.09■■■■□ 3.21
C17orf82-201ENST00000623772 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.08■■■■□ 3.21
C17orf82-201ENST00000623772 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
C17orf82-201ENST00000623772 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.07■■■■□ 3.2
C17orf82-201ENST00000623772 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.05■■■■□ 3.2
C17orf82-201ENST00000623772 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.04■■■■□ 3.2
C17orf82-201ENST00000623772 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.04■■■■□ 3.2
C17orf82-201ENST00000623772 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.02■■■■□ 3.2
C17orf82-201ENST00000623772 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.02■■■■□ 3.2
C17orf82-201ENST00000623772 MIA2Q96PC5 1412 aa35.01■■■■□ 3.19
C17orf82-201ENST00000623772 KDM5CP41229 1560 aa35■■■■□ 3.19
C17orf82-201ENST00000623772 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.99■■■■□ 3.19
C17orf82-201ENST00000623772 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
C17orf82-201ENST00000623772 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.97■■■■□ 3.19
C17orf82-201ENST00000623772 AFAP1Q8N556 730 aa34.93■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 MBD5Q9P267 1494 aa34.93■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.92■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.91■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.91■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.9■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.9■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.9■■■■□ 3.18
C17orf82-201ENST00000623772 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.87■■■■□ 3.17
C17orf82-201ENST00000623772 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.86■■■■□ 3.17
C17orf82-201ENST00000623772 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.86■■■■□ 3.17
C17orf82-201ENST00000623772 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
C17orf82-201ENST00000623772 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.83■■■■□ 3.17
C17orf82-201ENST00000623772 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.83■■■■□ 3.17
C17orf82-201ENST00000623772 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.81■■■■□ 3.16
C17orf82-201ENST00000623772 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
C17orf82-201ENST00000623772 ABCA6Q8N139 1617 aa34.77■■■■□ 3.16
C17orf82-201ENST00000623772 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.76■■■■□ 3.16
C17orf82-201ENST00000623772 ATP7AQ04656 1500 aa34.76■■■■□ 3.16
C17orf82-201ENST00000623772 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.76■■■■□ 3.16
C17orf82-201ENST00000623772 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
C17orf82-201ENST00000623772 ATP10AO60312 1499 aa34.7■■■■□ 3.15
C17orf82-201ENST00000623772 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.7■■■■□ 3.15
C17orf82-201ENST00000623772 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
C17orf82-201ENST00000623772 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.69■■■■□ 3.14
C17orf82-201ENST00000623772 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.69■■■■□ 3.14
C17orf82-201ENST00000623772 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.68■■■■□ 3.14
C17orf82-201ENST00000623772 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.67■■■■□ 3.14
C17orf82-201ENST00000623772 REREQ9P2R6 1566 aa34.67■■■■□ 3.14
C17orf82-201ENST00000623772 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.67■■■■□ 3.14
C17orf82-201ENST00000623772 ABCC5O15440 1437 aa34.64■■■■□ 3.14
C17orf82-201ENST00000623772 DAPK1P53355 1430 aa34.63■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.62■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.61■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 TSPY4P0CV99 314 aa34.61■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 TSPY10P0CW01 314 aa34.61■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
C17orf82-201ENST00000623772 PLXNC1O60486 1568 aa34.56■■■■□ 3.12
C17orf82-201ENST00000623772 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.54■■■■□ 3.12
C17orf82-201ENST00000623772 A2MP01023 1474 aa34.52■■■■□ 3.12
C17orf82-201ENST00000623772 AGLP35573 1532 aa34.52■■■■□ 3.12
C17orf82-201ENST00000623772 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
C17orf82-201ENST00000623772 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.46■■■■□ 3.11
C17orf82-201ENST00000623772 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.44■■■■□ 3.1
C17orf82-201ENST00000623772 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
C17orf82-201ENST00000623772 PTPRKQ15262 1439 aa34.43■■■■□ 3.1
C17orf82-201ENST00000623772 ADGRL2O95490 1459 aa34.42■■■■□ 3.1
C17orf82-201ENST00000623772 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.39■■■■□ 3.1
C17orf82-201ENST00000623772 NCOA1Q15788 1441 aa34.38■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.38■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.38■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 MADDQ8WXG6 1647 aa34.37■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 KIF15Q9NS87 1388 aa34.37■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.34■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 MLECQ14165 292 aa34.33■■■■□ 3.09
C17orf82-201ENST00000623772 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.31■■■■□ 3.08
C17orf82-201ENST00000623772 ITGAEP38570 1179 aa34.3■■■■□ 3.08
C17orf82-201ENST00000623772 ROCK1Q13464 1354 aa34.3■■■■□ 3.08
C17orf82-201ENST00000623772 ERBINQ96RT1 1412 aa34.28■■■■□ 3.08
C17orf82-201ENST00000623772 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
C17orf82-201ENST00000623772 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
C17orf82-201ENST00000623772 KIF3BO15066 747 aa34.23■■■■□ 3.07
C17orf82-201ENST00000623772 PTPRMP28827 1452 aa34.18■■■■□ 3.06
C17orf82-201ENST00000623772 GGT6Q6P531 493 aa34.18■■■■□ 3.06
C17orf82-201ENST00000623772 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms