RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	HECW1	Q76N89	1606 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	GGT6	Q6P531	493 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPY4	P0CV99	314 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPY10	P0CW01	314 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	NEUROD1	Q13562	356 aa		10.71	□□□□□ -0.69
LETMD1-238	ENST00000623495	FANCA	O15360	1455 aa		10.71	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		10.71	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF14	Q15058	1648 aa		10.7	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	NCOA2	Q15596	1464 aa		10.69	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		10.69	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPKBP1	O60336	1514 aa		10.69	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	DIP2B	Q9P265	1576 aa		10.68	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	AKNA	Q7Z591	1439 aa		10.67	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRL1	O94910	1474 aa		10.67	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		10.66	□□□□□ -0.7
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF3B	O15066	747 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	PLCH2	O75038	1416 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	TIAM1	Q13009	1591 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM52	Q96A61	297 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM6B	O15054	1643 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB22	O15209	634 aa		10.58	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		10.58	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		10.58	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		10.58	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		10.56	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		10.56	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		10.54	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		10.54	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	HSPA2	P54652	639 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	NEO1	Q92859	1461 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF15	Q9NS87	1388 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	GLI2	P10070	1586 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCC5	O15440	1437 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPRK	Q15262	1439 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	DAPK1	P53355	1430 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LETMD1-238	ENST00000623495	MBD5	Q9P267	1494 aa		10.46	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	MIA2	Q96PC5	1412 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	NUP155	O75694	1391 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCC1	P33527	1531 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	PREX2	Q70Z35	1606 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	RGL3	Q3MIN7	710 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP3K1	Q13233	1512 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP10A	O60312	1499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	A2M	P01023	1474 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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