RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619962.1

C1orf109-214, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf109, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-214ENST00000619962 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.47■■■□□ 2.31
C1orf109-214ENST00000619962 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.46■■■□□ 2.31
C1orf109-214ENST00000619962 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.46■■■□□ 2.31
C1orf109-214ENST00000619962 PREX2Q70Z35 1606 aa29.43■■■□□ 2.3
C1orf109-214ENST00000619962 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.39■■■□□ 2.3
C1orf109-214ENST00000619962 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.38■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.36■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 ABCC1P33527 1531 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.33■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.33■■■□□ 2.29
C1orf109-214ENST00000619962 KDM5CP41229 1560 aa29.32■■■□□ 2.28
C1orf109-214ENST00000619962 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
C1orf109-214ENST00000619962 AFAP1Q8N556 730 aa29.27■■■□□ 2.28
C1orf109-214ENST00000619962 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.26■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 TIAM1Q13009 1591 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.22■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
C1orf109-214ENST00000619962 ATP10AO60312 1499 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.16■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 NCOA2Q15596 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 MAP3K1Q13233 1512 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 MADDQ8WXG6 1647 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 PTPRMP28827 1452 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf109-214ENST00000619962 ABCA6Q8N139 1617 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf109-214ENST00000619962 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
C1orf109-214ENST00000619962 REREQ9P2R6 1566 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf109-214ENST00000619962 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
C1orf109-214ENST00000619962 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
C1orf109-214ENST00000619962 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.06■■■□□ 2.24
C1orf109-214ENST00000619962 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
C1orf109-214ENST00000619962 MBD5Q9P267 1494 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf109-214ENST00000619962 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf109-214ENST00000619962 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
C1orf109-214ENST00000619962 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
C1orf109-214ENST00000619962 AGLP35573 1532 aa29■■■□□ 2.23
C1orf109-214ENST00000619962 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
C1orf109-214ENST00000619962 MLECQ14165 292 aa29■■■□□ 2.23
C1orf109-214ENST00000619962 ATP7AQ04656 1500 aa28.99■■■□□ 2.23
C1orf109-214ENST00000619962 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.98■■■□□ 2.23
C1orf109-214ENST00000619962 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.92■■■□□ 2.22
C1orf109-214ENST00000619962 PLXNC1O60486 1568 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf109-214ENST00000619962 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf109-214ENST00000619962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.89■■■□□ 2.22
C1orf109-214ENST00000619962 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.87■■■□□ 2.21
C1orf109-214ENST00000619962 A2MP01023 1474 aa28.86■■■□□ 2.21
C1orf109-214ENST00000619962 MIA2Q96PC5 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
C1orf109-214ENST00000619962 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.85■■■□□ 2.21
C1orf109-214ENST00000619962 APLP2Q06481 763 aa28.84■■■□□ 2.21
C1orf109-214ENST00000619962 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.82■■■□□ 2.2
C1orf109-214ENST00000619962 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.81■■■□□ 2.2
C1orf109-214ENST00000619962 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.78■■■□□ 2.2
C1orf109-214ENST00000619962 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.77■■■□□ 2.2
C1orf109-214ENST00000619962 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
C1orf109-214ENST00000619962 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.74■■■□□ 2.19
C1orf109-214ENST00000619962 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
C1orf109-214ENST00000619962 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.71■■■□□ 2.19
C1orf109-214ENST00000619962 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.7■■■□□ 2.19
C1orf109-214ENST00000619962 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
C1orf109-214ENST00000619962 TSPY4P0CV99 314 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf109-214ENST00000619962 TSPY10P0CW01 314 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf109-214ENST00000619962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf109-214ENST00000619962 C3P01024 1663 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf109-214ENST00000619962 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
C1orf109-214ENST00000619962 ABCC5O15440 1437 aa28.63■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 MROH2AA6NES4 1674 aa28.63■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 GGT6Q6P531 493 aa28.62■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.61■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 ZMYM3Q14202 1370 aa28.61■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.61■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 HSPA2P54652 639 aa28.6■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.6■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 KIF3BO15066 747 aa28.58■■■□□ 2.17
C1orf109-214ENST00000619962 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 DAPK1P53355 1430 aa28.57■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 NPATQ14207 1427 aa28.57■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.56■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.56■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.53■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 PTPRKQ15262 1439 aa28.52■■■□□ 2.16
C1orf109-214ENST00000619962 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms