RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614025.4

LANCL3-203, Transcript of LanC like 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LANCL3, Length 1,469 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL3-203ENST00000614025 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.24■■■■■ 4.35
LANCL3-203ENST00000614025 ADGRL1O94910 1474 aa42.22■■■■■ 4.35
LANCL3-203ENST00000614025 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.22■■■■■ 4.35
LANCL3-203ENST00000614025 RICTORQ6R327 1708 aa42.2■■■■■ 4.35
LANCL3-203ENST00000614025 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.18■■■■■ 4.34
LANCL3-203ENST00000614025 MAP3K1Q13233 1512 aa42.18■■■■■ 4.34
LANCL3-203ENST00000614025 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
LANCL3-203ENST00000614025 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.12■■■■■ 4.33
LANCL3-203ENST00000614025 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.1■■■■■ 4.33
LANCL3-203ENST00000614025 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.08■■■■■ 4.33
LANCL3-203ENST00000614025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
LANCL3-203ENST00000614025 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
LANCL3-203ENST00000614025 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.03■■■■■ 4.32
LANCL3-203ENST00000614025 NCOA2Q15596 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
LANCL3-203ENST00000614025 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
LANCL3-203ENST00000614025 APLP2Q06481 763 aa42.02■■■■■ 4.32
LANCL3-203ENST00000614025 ABCC1P33527 1531 aa42■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.97■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.97■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.97■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.96■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 AFAP1Q8N556 730 aa41.96■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.95■■■■■ 4.31
LANCL3-203ENST00000614025 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.92■■■■■ 4.3
LANCL3-203ENST00000614025 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.92■■■■■ 4.3
LANCL3-203ENST00000614025 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.9■■■■■ 4.3
LANCL3-203ENST00000614025 KDM5CP41229 1560 aa41.89■■■■■ 4.3
LANCL3-203ENST00000614025 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.88■■■■■ 4.29
LANCL3-203ENST00000614025 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.88■■■■■ 4.29
LANCL3-203ENST00000614025 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.86■■■■■ 4.29
LANCL3-203ENST00000614025 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.85■■■■■ 4.29
LANCL3-203ENST00000614025 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.84■■■■■ 4.29
LANCL3-203ENST00000614025 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
LANCL3-203ENST00000614025 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
LANCL3-203ENST00000614025 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
LANCL3-203ENST00000614025 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.78■■■■■ 4.28
LANCL3-203ENST00000614025 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.77■■■■■ 4.28
LANCL3-203ENST00000614025 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.73■■■■■ 4.27
LANCL3-203ENST00000614025 ATP10AO60312 1499 aa41.72■■■■■ 4.27
LANCL3-203ENST00000614025 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
LANCL3-203ENST00000614025 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.69■■■■■ 4.27
LANCL3-203ENST00000614025 MBD5Q9P267 1494 aa41.69■■■■■ 4.27
LANCL3-203ENST00000614025 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.69■■■■■ 4.26
LANCL3-203ENST00000614025 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.67■■■■■ 4.26
LANCL3-203ENST00000614025 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.66■■■■■ 4.26
LANCL3-203ENST00000614025 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
LANCL3-203ENST00000614025 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.64■■■■■ 4.26
LANCL3-203ENST00000614025 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.64■■■■■ 4.26
LANCL3-203ENST00000614025 MIA2Q96PC5 1412 aa41.63■■■■■ 4.26
LANCL3-203ENST00000614025 ABCA6Q8N139 1617 aa41.63■■■■■ 4.25
LANCL3-203ENST00000614025 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.61■■■■■ 4.25
LANCL3-203ENST00000614025 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.56■■■■■ 4.24
LANCL3-203ENST00000614025 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.55■■■■■ 4.24
LANCL3-203ENST00000614025 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
LANCL3-203ENST00000614025 ATP7AQ04656 1500 aa41.55■■■■■ 4.24
LANCL3-203ENST00000614025 REREQ9P2R6 1566 aa41.54■■■■■ 4.24
LANCL3-203ENST00000614025 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.52■■■■■ 4.24
LANCL3-203ENST00000614025 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.51■■■■■ 4.24
LANCL3-203ENST00000614025 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.46■■■■■ 4.23
LANCL3-203ENST00000614025 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.46■■■■■ 4.23
LANCL3-203ENST00000614025 MLECQ14165 292 aa41.44■■■■■ 4.22
LANCL3-203ENST00000614025 MADDQ8WXG6 1647 aa41.43■■■■■ 4.22
LANCL3-203ENST00000614025 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.43■■■■■ 4.22
LANCL3-203ENST00000614025 AGLP35573 1532 aa41.4■■■■■ 4.22
LANCL3-203ENST00000614025 TSPY4P0CV99 314 aa41.39■■■■■ 4.22
LANCL3-203ENST00000614025 TSPY10P0CW01 314 aa41.39■■■■■ 4.22
LANCL3-203ENST00000614025 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
LANCL3-203ENST00000614025 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.35■■■■■ 4.21
LANCL3-203ENST00000614025 A2MP01023 1474 aa41.34■■■■■ 4.21
LANCL3-203ENST00000614025 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
LANCL3-203ENST00000614025 PTPRMP28827 1452 aa41.34■■■■■ 4.21
LANCL3-203ENST00000614025 PLXNC1O60486 1568 aa41.31■■■■■ 4.2
LANCL3-203ENST00000614025 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
LANCL3-203ENST00000614025 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.29■■■■■ 4.2
LANCL3-203ENST00000614025 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.28■■■■■ 4.2
LANCL3-203ENST00000614025 ABCC5O15440 1437 aa41.24■■■■■ 4.19
LANCL3-203ENST00000614025 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
LANCL3-203ENST00000614025 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
LANCL3-203ENST00000614025 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.2■■■■■ 4.19
LANCL3-203ENST00000614025 DAPK1P53355 1430 aa41.19■■■■■ 4.18
LANCL3-203ENST00000614025 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.17■■■■■ 4.18
LANCL3-203ENST00000614025 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
LANCL3-203ENST00000614025 GGT6Q6P531 493 aa41.08■■■■■ 4.17
LANCL3-203ENST00000614025 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
LANCL3-203ENST00000614025 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.06■■■■■ 4.16
LANCL3-203ENST00000614025 KIF3BO15066 747 aa41.05■■■■■ 4.16
LANCL3-203ENST00000614025 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.02■■■■■ 4.16
LANCL3-203ENST00000614025 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.02■■■■■ 4.16
LANCL3-203ENST00000614025 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
LANCL3-203ENST00000614025 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41■■■■■ 4.15
LANCL3-203ENST00000614025 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.99■■■■■ 4.15
LANCL3-203ENST00000614025 KIF15Q9NS87 1388 aa40.99■■■■■ 4.15
LANCL3-203ENST00000614025 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.99■■■■■ 4.15
LANCL3-203ENST00000614025 C3P01024 1663 aa40.95■■■■■ 4.15
LANCL3-203ENST00000614025 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.95■■■■■ 4.15
LANCL3-203ENST00000614025 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.14
LANCL3-203ENST00000614025 NCOA1Q15788 1441 aa40.94■■■■■ 4.14
LANCL3-203ENST00000614025 MROH2AA6NES4 1674 aa40.93■■■■■ 4.14
LANCL3-203ENST00000614025 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms