RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.88■■■■□ 3.01
TIMM50-216ENST00000601358 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.82■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.81■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.81■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.79■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.78■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.78■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.77■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.76■■■■□ 3
TIMM50-216ENST00000601358 AFAP1Q8N556 730 aa33.74■■■□□ 2.99
TIMM50-216ENST00000601358 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.74■■■□□ 2.99
TIMM50-216ENST00000601358 PREX2Q70Z35 1606 aa33.74■■■□□ 2.99
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.71■■■□□ 2.99
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
TIMM50-216ENST00000601358 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.7■■■□□ 2.99
TIMM50-216ENST00000601358 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.7■■■□□ 2.99
TIMM50-216ENST00000601358 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.69■■■□□ 2.98
TIMM50-216ENST00000601358 MLECQ14165 292 aa33.63■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.63■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 ATP10AO60312 1499 aa33.63■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 PTPRMP28827 1452 aa33.62■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 MADDQ8WXG6 1647 aa33.61■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 ABCC1P33527 1531 aa33.6■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.58■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 KDM5CP41229 1560 aa33.58■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.58■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.57■■■□□ 2.97
TIMM50-216ENST00000601358 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.56■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.55■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.55■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.54■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.53■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.53■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.51■■■□□ 2.96
TIMM50-216ENST00000601358 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.5■■■□□ 2.95
TIMM50-216ENST00000601358 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.5■■■□□ 2.95
TIMM50-216ENST00000601358 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.46■■■□□ 2.95
TIMM50-216ENST00000601358 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.45■■■□□ 2.95
TIMM50-216ENST00000601358 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.45■■■□□ 2.95
TIMM50-216ENST00000601358 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 TIAM1Q13009 1591 aa33.42■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.42■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 ABCA6Q8N139 1617 aa33.42■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.41■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.39■■■□□ 2.94
TIMM50-216ENST00000601358 NCOA2Q15596 1464 aa33.37■■■□□ 2.93
TIMM50-216ENST00000601358 REREQ9P2R6 1566 aa33.35■■■□□ 2.93
TIMM50-216ENST00000601358 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
TIMM50-216ENST00000601358 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.3■■■□□ 2.92
TIMM50-216ENST00000601358 APLP2Q06481 763 aa33.29■■■□□ 2.92
TIMM50-216ENST00000601358 AGLP35573 1532 aa33.27■■■□□ 2.92
TIMM50-216ENST00000601358 ATP7AQ04656 1500 aa33.27■■■□□ 2.92
TIMM50-216ENST00000601358 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
TIMM50-216ENST00000601358 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
TIMM50-216ENST00000601358 MAP3K1Q13233 1512 aa33.24■■■□□ 2.91
TIMM50-216ENST00000601358 MBD5Q9P267 1494 aa33.22■■■□□ 2.91
TIMM50-216ENST00000601358 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.21■■■□□ 2.91
TIMM50-216ENST00000601358 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
TIMM50-216ENST00000601358 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.19■■■□□ 2.9
TIMM50-216ENST00000601358 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.18■■■□□ 2.9
TIMM50-216ENST00000601358 A2MP01023 1474 aa33.18■■■□□ 2.9
TIMM50-216ENST00000601358 HSPA2P54652 639 aa33.16■■■□□ 2.9
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.12■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.12■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 TSPY4P0CV99 314 aa33.11■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 TSPY10P0CW01 314 aa33.11■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 GGT6Q6P531 493 aa33.11■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.1■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.09■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
TIMM50-216ENST00000601358 PLXNC1O60486 1568 aa33.06■■■□□ 2.88
TIMM50-216ENST00000601358 C3P01024 1663 aa33.06■■■□□ 2.88
TIMM50-216ENST00000601358 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.05■■■□□ 2.88
TIMM50-216ENST00000601358 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.04■■■□□ 2.88
TIMM50-216ENST00000601358 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
TIMM50-216ENST00000601358 MIA2Q96PC5 1412 aa33.02■■■□□ 2.88
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.01■■■□□ 2.88
TIMM50-216ENST00000601358 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.99■■■□□ 2.87
TIMM50-216ENST00000601358 ZMYM3Q14202 1370 aa32.99■■■□□ 2.87
TIMM50-216ENST00000601358 KIF3BO15066 747 aa32.97■■■□□ 2.87
TIMM50-216ENST00000601358 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.97■■■□□ 2.87
TIMM50-216ENST00000601358 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.86
TIMM50-216ENST00000601358 MROH2AA6NES4 1674 aa32.94■■■□□ 2.86
TIMM50-216ENST00000601358 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
TIMM50-216ENST00000601358 NPATQ14207 1427 aa32.85■■■□□ 2.85
TIMM50-216ENST00000601358 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.83■■■□□ 2.85
TIMM50-216ENST00000601358 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.83■■■□□ 2.85
TIMM50-216ENST00000601358 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.82■■■□□ 2.84
TIMM50-216ENST00000601358 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.8■■■□□ 2.84
TIMM50-216ENST00000601358 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.8■■■□□ 2.84
TIMM50-216ENST00000601358 PTPRKQ15262 1439 aa32.77■■■□□ 2.84
TIMM50-216ENST00000601358 ABCC5O15440 1437 aa32.75■■■□□ 2.83
TIMM50-216ENST00000601358 STRCQ7RTU9 1775 aa32.73■■■□□ 2.83
TIMM50-216ENST00000601358 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.73■■■□□ 2.83
TIMM50-216ENST00000601358 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms