RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601356.1

AP2A1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit alpha 1, human

Gene AP2A1, Length 2,238 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AP2A1-208	ENST00000601356	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
AP2A1-208	ENST00000601356	ABCC5	O15440	1437 aa		33.13	■■■□□ 2.89
AP2A1-208	ENST00000601356	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
AP2A1-208	ENST00000601356	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AP2A1-208	ENST00000601356	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.08	■■■□□ 2.89
AP2A1-208	ENST00000601356	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.08	■■■□□ 2.89
AP2A1-208	ENST00000601356	KIF14	Q15058	1648 aa		33.07	■■■□□ 2.88
AP2A1-208	ENST00000601356	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.07	■■■□□ 2.88
AP2A1-208	ENST00000601356	FOXD1	Q16676	465 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AP2A1-208	ENST00000601356	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.01	■■■□□ 2.87
AP2A1-208	ENST00000601356	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.01	■■■□□ 2.87
AP2A1-208	ENST00000601356	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.01	■■■□□ 2.87
AP2A1-208	ENST00000601356	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
AP2A1-208	ENST00000601356	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
AP2A1-208	ENST00000601356	ABCA8	O94911	1581 aa		32.94	■■■□□ 2.86
AP2A1-208	ENST00000601356	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
AP2A1-208	ENST00000601356	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.88	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.87	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.86	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.86	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	ATP10B	O94823	1461 aa		32.85	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.83	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.83	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	ANP32C	O43423	234 aa		32.83	■■■□□ 2.85
AP2A1-208	ENST00000601356	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
AP2A1-208	ENST00000601356	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
AP2A1-208	ENST00000601356	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
AP2A1-208	ENST00000601356	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.79	■■■□□ 2.84
AP2A1-208	ENST00000601356	PZP	P20742	1482 aa		32.78	■■■□□ 2.84
AP2A1-208	ENST00000601356	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.78	■■■□□ 2.84
AP2A1-208	ENST00000601356	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.77	■■■□□ 2.84
AP2A1-208	ENST00000601356	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.76	■■■□□ 2.83
AP2A1-208	ENST00000601356	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.75	■■■□□ 2.83
AP2A1-208	ENST00000601356	CHD1	O14646	1710 aa		32.74	■■■□□ 2.83
AP2A1-208	ENST00000601356	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.72	■■■□□ 2.83
AP2A1-208	ENST00000601356	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
AP2A1-208	ENST00000601356	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.82
AP2A1-208	ENST00000601356	PTPRG	P23470	1445 aa		32.69	■■■□□ 2.82
AP2A1-208	ENST00000601356	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.69	■■■□□ 2.82
AP2A1-208	ENST00000601356	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.68	■■■□□ 2.82
AP2A1-208	ENST00000601356	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.61	■■■□□ 2.81
AP2A1-208	ENST00000601356	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.61	■■■□□ 2.81
AP2A1-208	ENST00000601356	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.59	■■■□□ 2.81
AP2A1-208	ENST00000601356	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.59	■■■□□ 2.81
AP2A1-208	ENST00000601356	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
AP2A1-208	ENST00000601356	PKD2	Q13563	968 aa		32.55	■■■□□ 2.8
AP2A1-208	ENST00000601356	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.54	■■■□□ 2.8
AP2A1-208	ENST00000601356	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.53	■■■□□ 2.8
AP2A1-208	ENST00000601356	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.52	■■■□□ 2.8
AP2A1-208	ENST00000601356	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.5	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.48	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	NUP155	O75694	1391 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AP2A1-208	ENST00000601356	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AP2A1-208	ENST00000601356	MYT1	Q01538	1121 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AP2A1-208	ENST00000601356	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.41	■■■□□ 2.78
AP2A1-208	ENST00000601356	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
AP2A1-208	ENST00000601356	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.4	■■■□□ 2.78
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.39	■■■□□ 2.78
AP2A1-208	ENST00000601356	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
AP2A1-208	ENST00000601356	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.36	■■■□□ 2.77
AP2A1-208	ENST00000601356	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.35	■■■□□ 2.77
AP2A1-208	ENST00000601356	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.34	■■■□□ 2.77
AP2A1-208	ENST00000601356	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.33	■■■□□ 2.77
AP2A1-208	ENST00000601356	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.32	■■■□□ 2.76
AP2A1-208	ENST00000601356	FKBP8	Q14318	412 aa		32.3	■■■□□ 2.76
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.29	■■■□□ 2.76
AP2A1-208	ENST00000601356	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.27	■■■□□ 2.76
AP2A1-208	ENST00000601356	USP47	Q96K76	1375 aa		32.26	■■■□□ 2.76
AP2A1-208	ENST00000601356	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.26	■■■□□ 2.76
AP2A1-208	ENST00000601356	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.26	■■■□□ 2.76
AP2A1-208	ENST00000601356	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	KDM5C	P41229	1560 aa		32.24	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.23	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.23	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.22	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.21	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.2	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.2	■■■□□ 2.75
AP2A1-208	ENST00000601356	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.18	■■■□□ 2.74
AP2A1-208	ENST00000601356	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
AP2A1-208	ENST00000601356	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.15	■■■□□ 2.74
AP2A1-208	ENST00000601356	UNC13B	O14795	1591 aa		32.13	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	NEFL	P07196	543 aa		32.12	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.11	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.11	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.11	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.1	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.09	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.08	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.08	■■■□□ 2.73
AP2A1-208	ENST00000601356	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms