RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597369.1

IRF3-218, Transcript of interferon regulatory factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene IRF3, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3-218ENST00000597369 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
IRF3-218ENST00000597369 HECW1Q76N89 1606 aa22.63■■□□□ 1.21
IRF3-218ENST00000597369 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.63■■□□□ 1.21
IRF3-218ENST00000597369 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
IRF3-218ENST00000597369 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
IRF3-218ENST00000597369 ATP10AO60312 1499 aa22.6■■□□□ 1.21
IRF3-218ENST00000597369 P3H3Q8IVL6 736 aa22.59■■□□□ 1.21
IRF3-218ENST00000597369 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.56■■□□□ 1.2
IRF3-218ENST00000597369 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.55■■□□□ 1.2
IRF3-218ENST00000597369 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
IRF3-218ENST00000597369 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
IRF3-218ENST00000597369 PRXQ9BXM0 1461 aa22.53■■□□□ 1.2
IRF3-218ENST00000597369 SAMD9Q5K651 1589 aa22.51■■□□□ 1.19
IRF3-218ENST00000597369 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.51■■□□□ 1.19
IRF3-218ENST00000597369 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.5■■□□□ 1.19
IRF3-218ENST00000597369 NCOA1Q15788 1441 aa22.49■■□□□ 1.19
IRF3-218ENST00000597369 C3P01024 1663 aa22.47■■□□□ 1.19
IRF3-218ENST00000597369 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
IRF3-218ENST00000597369 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
IRF3-218ENST00000597369 PLCH2O75038 1416 aa22.42■■□□□ 1.18
IRF3-218ENST00000597369 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
IRF3-218ENST00000597369 REREQ9P2R6 1566 aa22.37■■□□□ 1.17
IRF3-218ENST00000597369 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.36■■□□□ 1.17
IRF3-218ENST00000597369 HSPA1LP34931 641 aa22.34■■□□□ 1.17
IRF3-218ENST00000597369 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.34■■□□□ 1.17
IRF3-218ENST00000597369 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.33■■□□□ 1.17
IRF3-218ENST00000597369 AGLP35573 1532 aa22.32■■□□□ 1.16
IRF3-218ENST00000597369 KDM5CP41229 1560 aa22.32■■□□□ 1.16
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IRF3-218ENST00000597369 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.29■■□□□ 1.16
IRF3-218ENST00000597369 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.28■■□□□ 1.16
IRF3-218ENST00000597369 PKD2Q13563 968 aa22.27■■□□□ 1.16
IRF3-218ENST00000597369 NPATQ14207 1427 aa22.27■■□□□ 1.16
IRF3-218ENST00000597369 AFAP1Q8N556 730 aa22.27■■□□□ 1.16
IRF3-218ENST00000597369 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.27■■□□□ 1.16
IRF3-218ENST00000597369 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
IRF3-218ENST00000597369 PLA2R1Q13018 1463 aa22.24■■□□□ 1.15
IRF3-218ENST00000597369 TOM1O60784 492 aa22.23■■□□□ 1.15
IRF3-218ENST00000597369 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.22■■□□□ 1.15
IRF3-218ENST00000597369 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IRF3-218ENST00000597369 ABCA6Q8N139 1617 aa22.21■■□□□ 1.15
IRF3-218ENST00000597369 MROH2AA6NES4 1674 aa22.21■■□□□ 1.15
IRF3-218ENST00000597369 PIP4K2BP78356 416 aa22.2■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.19■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 ZMYM3Q14202 1370 aa22.15■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.15■■□□□ 1.14
IRF3-218ENST00000597369 CPS1P31327 1500 aa22.12■■□□□ 1.13
IRF3-218ENST00000597369 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.11■■□□□ 1.13
IRF3-218ENST00000597369 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.1■■□□□ 1.13
IRF3-218ENST00000597369 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
IRF3-218ENST00000597369 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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IRF3-218ENST00000597369 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.07■■□□□ 1.12
IRF3-218ENST00000597369 KIF14Q15058 1648 aa22.06■■□□□ 1.12
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IRF3-218ENST00000597369 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.05■■□□□ 1.12
IRF3-218ENST00000597369 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.04■■□□□ 1.12
IRF3-218ENST00000597369 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
IRF3-218ENST00000597369 ALKQ9UM73 1620 aa22.03■■□□□ 1.12
IRF3-218ENST00000597369 ABCC1P33527 1531 aa22■■□□□ 1.11
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IRF3-218ENST00000597369 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
IRF3-218ENST00000597369 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
IRF3-218ENST00000597369 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
IRF3-218ENST00000597369 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.96■■□□□ 1.11
IRF3-218ENST00000597369 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.95■■□□□ 1.1
IRF3-218ENST00000597369 CLIP1P30622 1438 aa21.94■■□□□ 1.1
IRF3-218ENST00000597369 PREX2Q70Z35 1606 aa21.93■■□□□ 1.1
IRF3-218ENST00000597369 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.92■■□□□ 1.1
IRF3-218ENST00000597369 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IRF3-218ENST00000597369 FMN1Q68DA7 1419 aa21.89■■□□□ 1.1
IRF3-218ENST00000597369 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.89■■□□□ 1.09
IRF3-218ENST00000597369 PLXNC1O60486 1568 aa21.87■■□□□ 1.09
IRF3-218ENST00000597369 POTEAQ6S8J7 498 aa21.84■■□□□ 1.09
IRF3-218ENST00000597369 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.83■■□□□ 1.09
IRF3-218ENST00000597369 MED14O60244 1454 aa21.83■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 GGT6Q6P531 493 aa21.82■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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IRF3-218ENST00000597369 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.8■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.8■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.8■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 EEA1Q15075 1411 aa21.8■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 DEPDC5O75140 1603 aa21.79■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 ATP7AQ04656 1500 aa21.78■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.78■■□□□ 1.08
IRF3-218ENST00000597369 SYNMO15061 1565 aa21.76■■□□□ 1.07
IRF3-218ENST00000597369 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
IRF3-218ENST00000597369 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
IRF3-218ENST00000597369 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
IRF3-218ENST00000597369 TNRQ92752 1358 aa21.74■■□□□ 1.07
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