RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596378.1

SRRM1-222, Transcript of serine and arginine repetitive matrix 1, human

TSL 1 (best)

Gene SRRM1, Length 2,314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM1-222	ENST00000596378	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SRRM1-222	ENST00000596378	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SRRM1-222	ENST00000596378	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SRRM1-222	ENST00000596378	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SRRM1-222	ENST00000596378	KIF14	Q15058	1648 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SRRM1-222	ENST00000596378	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SRRM1-222	ENST00000596378	FOXD1	Q16676	465 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SRRM1-222	ENST00000596378	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SRRM1-222	ENST00000596378	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SRRM1-222	ENST00000596378	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SRRM1-222	ENST00000596378	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SRRM1-222	ENST00000596378	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SRRM1-222	ENST00000596378	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SRRM1-222	ENST00000596378	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SRRM1-222	ENST00000596378	ABCA8	O94911	1581 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SRRM1-222	ENST00000596378	ATP10B	O94823	1461 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SRRM1-222	ENST00000596378	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SRRM1-222	ENST00000596378	CHD1	O14646	1710 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SRRM1-222	ENST00000596378	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SRRM1-222	ENST00000596378	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SRRM1-222	ENST00000596378	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SRRM1-222	ENST00000596378	ANP32C	O43423	234 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SRRM1-222	ENST00000596378	PZP	P20742	1482 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SRRM1-222	ENST00000596378	PTPRG	P23470	1445 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SRRM1-222	ENST00000596378	ADGRL2	O95490	1459 aa		32	■■■□□ 2.71
SRRM1-222	ENST00000596378	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SRRM1-222	ENST00000596378	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SRRM1-222	ENST00000596378	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SRRM1-222	ENST00000596378	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SRRM1-222	ENST00000596378	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SRRM1-222	ENST00000596378	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7
SRRM1-222	ENST00000596378	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SRRM1-222	ENST00000596378	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.85	■■■□□ 2.69	1e-9	■■■■■ 32.3
SRRM1-222	ENST00000596378	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	PKD2	Q13563	968 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.82	■■■□□ 2.69
SRRM1-222	ENST00000596378	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SRRM1-222	ENST00000596378	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SRRM1-222	ENST00000596378	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SRRM1-222	ENST00000596378	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SRRM1-222	ENST00000596378	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SRRM1-222	ENST00000596378	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SRRM1-222	ENST00000596378	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SRRM1-222	ENST00000596378	NUP155	O75694	1391 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SRRM1-222	ENST00000596378	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SRRM1-222	ENST00000596378	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SRRM1-222	ENST00000596378	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SRRM1-222	ENST00000596378	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SRRM1-222	ENST00000596378	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SRRM1-222	ENST00000596378	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SRRM1-222	ENST00000596378	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SRRM1-222	ENST00000596378	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SRRM1-222	ENST00000596378	ABCC2	Q92887	1545 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SRRM1-222	ENST00000596378	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.64	■■■□□ 2.66
SRRM1-222	ENST00000596378	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.64	■■■□□ 2.65
SRRM1-222	ENST00000596378	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SRRM1-222	ENST00000596378	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SRRM1-222	ENST00000596378	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SRRM1-222	ENST00000596378	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
SRRM1-222	ENST00000596378	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SRRM1-222	ENST00000596378	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SRRM1-222	ENST00000596378	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	USP47	Q96K76	1375 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	FKBP8	Q14318	412 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.46	■■■□□ 2.63
SRRM1-222	ENST00000596378	KDM5C	P41229	1560 aa		31.45	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	BCAN	Q96GW7	911 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	31.41	■■■□□ 2.62	7e-7	■■■□□ 15.5
SRRM1-222	ENST00000596378	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SRRM1-222	ENST00000596378	UNC13B	O14795	1591 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SRRM1-222	ENST00000596378	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SRRM1-222	ENST00000596378	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SRRM1-222	ENST00000596378	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SRRM1-222	ENST00000596378	PLCH2	O75038	1416 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SRRM1-222	ENST00000596378	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SRRM1-222	ENST00000596378	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SRRM1-222	ENST00000596378	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6

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