RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590551.1

U2AF2-206, Transcript of U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene U2AF2, Length 1,104 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2-206ENST00000590551 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
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U2AF2-206ENST00000590551 KIF14Q15058 1648 aa42.34■■■■■ 4.37
U2AF2-206ENST00000590551 MADDQ8WXG6 1647 aa42.32■■■■■ 4.37
U2AF2-206ENST00000590551 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.32■■■■■ 4.37
U2AF2-206ENST00000590551 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.27■■■■■ 4.36
U2AF2-206ENST00000590551 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.27■■■■■ 4.36
U2AF2-206ENST00000590551 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.23■■■■■ 4.35
U2AF2-206ENST00000590551 ATP10AO60312 1499 aa42.23■■■■■ 4.35
U2AF2-206ENST00000590551 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.2■■■■■ 4.35
U2AF2-206ENST00000590551 MLECQ14165 292 aa42.16■■■■■ 4.34
U2AF2-206ENST00000590551 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.16■■■■■ 4.34
U2AF2-206ENST00000590551 AFAP1Q8N556 730 aa42.15■■■■■ 4.34
U2AF2-206ENST00000590551 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
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U2AF2-206ENST00000590551 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.11■■■■■ 4.33
U2AF2-206ENST00000590551 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.1■■■■■ 4.33
U2AF2-206ENST00000590551 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.08■■■■■ 4.33
U2AF2-206ENST00000590551 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.06■■■■■ 4.32
U2AF2-206ENST00000590551 KDM5CP41229 1560 aa42.05■■■■■ 4.32
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U2AF2-206ENST00000590551 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42■■■■■ 4.31
U2AF2-206ENST00000590551 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.98■■■■■ 4.31
U2AF2-206ENST00000590551 PREX2Q70Z35 1606 aa41.96■■■■■ 4.31
U2AF2-206ENST00000590551 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.96■■■■■ 4.31
U2AF2-206ENST00000590551 ABCC1P33527 1531 aa41.93■■■■■ 4.3
U2AF2-206ENST00000590551 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.93■■■■■ 4.3
U2AF2-206ENST00000590551 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.9■■■■■ 4.3
U2AF2-206ENST00000590551 HSPA2P54652 639 aa41.89■■■■■ 4.3
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U2AF2-206ENST00000590551 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.86■■■■■ 4.29
U2AF2-206ENST00000590551 FBXO41Q8TF61 875 aa41.84■■■■■ 4.29
U2AF2-206ENST00000590551 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
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U2AF2-206ENST00000590551 AGLP35573 1532 aa41.78■■■■■ 4.28
U2AF2-206ENST00000590551 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.78■■■■■ 4.28
U2AF2-206ENST00000590551 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
U2AF2-206ENST00000590551 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.77■■■■■ 4.28
U2AF2-206ENST00000590551 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
U2AF2-206ENST00000590551 ABCA6Q8N139 1617 aa41.76■■■■■ 4.28
U2AF2-206ENST00000590551 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.76■■■■■ 4.27
U2AF2-206ENST00000590551 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.74■■■■■ 4.27
U2AF2-206ENST00000590551 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.72■■■■■ 4.27
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U2AF2-206ENST00000590551 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.71■■■■■ 4.27
U2AF2-206ENST00000590551 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.273e-7■■■■■ 35.8
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U2AF2-206ENST00000590551 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.64■■■■■ 4.26
U2AF2-206ENST00000590551 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.64■■■■■ 4.26
U2AF2-206ENST00000590551 CEP162Q5TB80 1403 aa41.61■■■■■ 4.25
U2AF2-206ENST00000590551 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.61■■■■■ 4.25
U2AF2-206ENST00000590551 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.61■■■■■ 4.25
U2AF2-206ENST00000590551 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.6■■■■■ 4.25
U2AF2-206ENST00000590551 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.57■■■■■ 4.25
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U2AF2-206ENST00000590551 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
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U2AF2-206ENST00000590551 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.06■■■■■ 4.16
U2AF2-206ENST00000590551 PKD2Q13563 968 aa41.04■■■■■ 4.16
U2AF2-206ENST00000590551 MAP3K1Q13233 1512 aa41.03■■■■■ 4.16
U2AF2-206ENST00000590551 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.01■■■■■ 4.16
U2AF2-206ENST00000590551 PLA2R1Q13018 1463 aa40.99■■■■■ 4.15
U2AF2-206ENST00000590551 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.98■■■■■ 4.15
U2AF2-206ENST00000590551 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.98■■■■■ 4.15
U2AF2-206ENST00000590551 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
U2AF2-206ENST00000590551 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.96■■■■■ 4.15
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