RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
EFTUD2-215ENST00000589825 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.63■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.62■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 PREX2Q70Z35 1606 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.59■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.59■■□□□ 1.69
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD2-215ENST00000589825 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
EFTUD2-215ENST00000589825 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.53■■□□□ 1.68
EFTUD2-215ENST00000589825 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.53■■□□□ 1.68
EFTUD2-215ENST00000589825 AFAP1Q8N556 730 aa25.51■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.51■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.5■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCC1P33527 1531 aa25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.46■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP10AO60312 1499 aa25.46■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.45■■□□□ 1.67
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM5CP41229 1560 aa25.45■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.43■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 TIAM1Q13009 1591 aa25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.41■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 MLECQ14165 292 aa25.41■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 MADDQ8WXG6 1647 aa25.4■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.4■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPRMP28827 1452 aa25.39■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.37■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 APLP2Q06481 763 aa25.37■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.35■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.34■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 NCOA2Q15596 1464 aa25.34■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.34■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.32■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCA6Q8N139 1617 aa25.31■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.31■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 MAP3K1Q13233 1512 aa25.3■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.3■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.29■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 REREQ9P2R6 1566 aa25.28■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
EFTUD2-215ENST00000589825 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP7AQ04656 1500 aa25.24■■□□□ 1.63
EFTUD2-215ENST00000589825 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
EFTUD2-215ENST00000589825 AGLP35573 1532 aa25.21■■□□□ 1.63
EFTUD2-215ENST00000589825 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.2■■□□□ 1.62
EFTUD2-215ENST00000589825 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.2■■□□□ 1.62
EFTUD2-215ENST00000589825 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
EFTUD2-215ENST00000589825 MBD5Q9P267 1494 aa25.18■■□□□ 1.62
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.15■■□□□ 1.62
EFTUD2-215ENST00000589825 A2MP01023 1474 aa25.15■■□□□ 1.62
EFTUD2-215ENST00000589825 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.13■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 TSPY4P0CV99 314 aa25.13■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 TSPY10P0CW01 314 aa25.13■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.13■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.12■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 MIA2Q96PC5 1412 aa25.1■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.08■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.08■■□□□ 1.61
EFTUD2-215ENST00000589825 PLXNC1O60486 1568 aa25.06■■□□□ 1.6
EFTUD2-215ENST00000589825 GGT6Q6P531 493 aa25.06■■□□□ 1.6
EFTUD2-215ENST00000589825 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.06■■□□□ 1.6
EFTUD2-215ENST00000589825 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
EFTUD2-215ENST00000589825 C3P01024 1663 aa25.01■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.01■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 HSPA2P54652 639 aa24.99■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.99■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF3BO15066 747 aa24.98■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 MROH2AA6NES4 1674 aa24.97■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.97■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.96■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 ZMYM3Q14202 1370 aa24.95■■□□□ 1.59
EFTUD2-215ENST00000589825 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
EFTUD2-215ENST00000589825 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.94■■□□□ 1.58
EFTUD2-215ENST00000589825 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.93■■□□□ 1.58
EFTUD2-215ENST00000589825 NPATQ14207 1427 aa24.87■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.86■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCC5O15440 1437 aa24.85■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.85■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.84■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 DAPK1P53355 1430 aa24.84■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms