RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.3	■■■■□ 3.88
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.08	■■■■□ 3.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ABCC9	O60706	1549 aa		34.62	■■■■□ 3.13
EFTUD2-215	ENST00000589825	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.19	■■■□□ 2.9
EFTUD2-215	ENST00000589825	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.13	■■■□□ 2.89
EFTUD2-215	ENST00000589825	NACAD	O15069	1562 aa		33.06	■■■□□ 2.88
EFTUD2-215	ENST00000589825	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.72	■■■□□ 2.83
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
EFTUD2-215	ENST00000589825	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.48	■■■□□ 2.79
EFTUD2-215	ENST00000589825	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.37	■■■□□ 2.77
EFTUD2-215	ENST00000589825	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76
EFTUD2-215	ENST00000589825	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.09	■■■□□ 2.73
EFTUD2-215	ENST00000589825	SCRIB	Q14160	1630 aa		32	■■■□□ 2.71
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.95	■■■□□ 2.71
EFTUD2-215	ENST00000589825	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.79	■■■□□ 2.68
EFTUD2-215	ENST00000589825	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
EFTUD2-215	ENST00000589825	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.28	■■■□□ 2.6
EFTUD2-215	ENST00000589825	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.14	■■■□□ 2.57
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.56	■■■□□ 2.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.52	■■■□□ 2.48
EFTUD2-215	ENST00000589825	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.48	■■■□□ 2.47
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.45	■■■□□ 2.47
EFTUD2-215	ENST00000589825	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.45	■■■□□ 2.47
EFTUD2-215	ENST00000589825	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.31	■■■□□ 2.44
EFTUD2-215	ENST00000589825	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.27	■■■□□ 2.44
EFTUD2-215	ENST00000589825	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.25	■■■□□ 2.43
EFTUD2-215	ENST00000589825	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.23	■■■□□ 2.43
EFTUD2-215	ENST00000589825	WIZ	O95785	1651 aa		29.95	■■■□□ 2.39
EFTUD2-215	ENST00000589825	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.93	■■■□□ 2.38
EFTUD2-215	ENST00000589825	NES	P48681	1621 aa		29.83	■■■□□ 2.37
EFTUD2-215	ENST00000589825	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.76	■■■□□ 2.35
EFTUD2-215	ENST00000589825	CUX2	O14529	1486 aa		29.65	■■■□□ 2.34
EFTUD2-215	ENST00000589825	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
EFTUD2-215	ENST00000589825	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.61	■■■□□ 2.33
EFTUD2-215	ENST00000589825	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.61	■■■□□ 2.33
EFTUD2-215	ENST00000589825	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.5	■■■□□ 2.31
EFTUD2-215	ENST00000589825	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
EFTUD2-215	ENST00000589825	CFTR	P13569	1480 aa		29.35	■■■□□ 2.29
EFTUD2-215	ENST00000589825	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.29	■■■□□ 2.28
EFTUD2-215	ENST00000589825	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.28	■■■□□ 2.28
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.28	■■■□□ 2.28
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.27	■■■□□ 2.28
EFTUD2-215	ENST00000589825	WDR62	O43379	1518 aa		29.16	■■■□□ 2.26
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.14	■■■□□ 2.25
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.79	■■■□□ 2.2
EFTUD2-215	ENST00000589825	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.71	■■■□□ 2.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.67	■■■□□ 2.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
EFTUD2-215	ENST00000589825	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
EFTUD2-215	ENST00000589825	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
EFTUD2-215	ENST00000589825	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.43	■■■□□ 2.14
EFTUD2-215	ENST00000589825	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
EFTUD2-215	ENST00000589825	SOGA1	O94964	1423 aa		28.42	■■■□□ 2.14
EFTUD2-215	ENST00000589825	CUX1	P39880	1505 aa		28.41	■■■□□ 2.14
EFTUD2-215	ENST00000589825	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.4	■■■□□ 2.14
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.38	■■■□□ 2.13
EFTUD2-215	ENST00000589825	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.36	■■■□□ 2.13	2e-11	■■□□□ 13.5
EFTUD2-215	ENST00000589825	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
EFTUD2-215	ENST00000589825	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EFTUD2-215	ENST00000589825	FBLN2	P98095	1184 aa		28.2	■■■□□ 2.1
EFTUD2-215	ENST00000589825	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.18	■■■□□ 2.1
EFTUD2-215	ENST00000589825	CHD1	O14646	1710 aa		28.13	■■■□□ 2.09
EFTUD2-215	ENST00000589825	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.12	■■■□□ 2.09
EFTUD2-215	ENST00000589825	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.11	■■■□□ 2.09
EFTUD2-215	ENST00000589825	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.11	■■■□□ 2.09
EFTUD2-215	ENST00000589825	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EFTUD2-215	ENST00000589825	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.08	■■■□□ 2.09
EFTUD2-215	ENST00000589825	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.07	■■■□□ 2.08
EFTUD2-215	ENST00000589825	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.07	■■■□□ 2.08
EFTUD2-215	ENST00000589825	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
EFTUD2-215	ENST00000589825	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
EFTUD2-215	ENST00000589825	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.03	■■■□□ 2.08
EFTUD2-215	ENST00000589825	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.99	■■■□□ 2.07
EFTUD2-215	ENST00000589825	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.95	■■■□□ 2.06
EFTUD2-215	ENST00000589825	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.93	■■■□□ 2.06
EFTUD2-215	ENST00000589825	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.93	■■■□□ 2.06
EFTUD2-215	ENST00000589825	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.93	■■■□□ 2.06
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EFTUD2-215	ENST00000589825	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.77	■■■□□ 2.04
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.77	■■■□□ 2.04
EFTUD2-215	ENST00000589825	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.75	■■■□□ 2.03
EFTUD2-215	ENST00000589825	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.74	■■■□□ 2.03
EFTUD2-215	ENST00000589825	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.73	■■■□□ 2.03
EFTUD2-215	ENST00000589825	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.72	■■■□□ 2.03
EFTUD2-215	ENST00000589825	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.64	■■■□□ 2.02
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.63	■■■□□ 2.01
EFTUD2-215	ENST00000589825	NUP160	Q12769	1436 aa		27.58	■■■□□ 2
EFTUD2-215	ENST00000589825	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.57	■■■□□ 2
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGF1R	P08069	1367 aa		27.5	■■□□□ 1.99
EFTUD2-215	ENST00000589825	CUL7	Q14999	1698 aa		27.49	■■□□□ 1.99
EFTUD2-215	ENST00000589825	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.4	■■□□□ 1.98
EFTUD2-215	ENST00000589825	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.38	■■□□□ 1.97
EFTUD2-215	ENST00000589825	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.38	■■□□□ 1.97
EFTUD2-215	ENST00000589825	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.36	■■□□□ 1.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms