RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588337.5

KDM4B-205, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 5

Gene KDM4B, Length 504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-205	ENST00000588337	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.48	■■■■■ 4.55
KDM4B-205	ENST00000588337	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.46	■■■■■ 4.55
KDM4B-205	ENST00000588337	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.45	■■■■■ 4.55
KDM4B-205	ENST00000588337	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43.45	■■■■■ 4.55
KDM4B-205	ENST00000588337	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.44	■■■■■ 4.54
KDM4B-205	ENST00000588337	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.43	■■■■■ 4.54
KDM4B-205	ENST00000588337	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.43	■■■■■ 4.54
KDM4B-205	ENST00000588337	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.4	■■■■■ 4.54
KDM4B-205	ENST00000588337	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.38	■■■■■ 4.53
KDM4B-205	ENST00000588337	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.38	■■■■■ 4.53
KDM4B-205	ENST00000588337	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.34	■■■■■ 4.53
KDM4B-205	ENST00000588337	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
KDM4B-205	ENST00000588337	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.29	■■■■■ 4.52
KDM4B-205	ENST00000588337	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.29	■■■■■ 4.52
KDM4B-205	ENST00000588337	KDM5C	P41229	1560 aa		43.28	■■■■■ 4.52
KDM4B-205	ENST00000588337	ABCC1	P33527	1531 aa		43.26	■■■■■ 4.52
KDM4B-205	ENST00000588337	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.24	■■■■■ 4.51
KDM4B-205	ENST00000588337	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.23	■■■■■ 4.51
KDM4B-205	ENST00000588337	PTPRM	P28827	1452 aa		43.22	■■■■■ 4.51
KDM4B-205	ENST00000588337	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.17	■■■■■ 4.5
KDM4B-205	ENST00000588337	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
KDM4B-205	ENST00000588337	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.15	■■■■■ 4.5
KDM4B-205	ENST00000588337	ATP10A	O60312	1499 aa		43.14	■■■■■ 4.5
KDM4B-205	ENST00000588337	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.14	■■■■■ 4.5
KDM4B-205	ENST00000588337	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.14	■■■■■ 4.5
KDM4B-205	ENST00000588337	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.14	■■■■■ 4.5
KDM4B-205	ENST00000588337	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.13	■■■■■ 4.49
KDM4B-205	ENST00000588337	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.12	■■■■■ 4.49
KDM4B-205	ENST00000588337	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.11	■■■■■ 4.49
KDM4B-205	ENST00000588337	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.1	■■■■■ 4.49
KDM4B-205	ENST00000588337	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.08	■■■■■ 4.49
KDM4B-205	ENST00000588337	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.06	■■■■■ 4.48
KDM4B-205	ENST00000588337	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.05	■■■■■ 4.48
KDM4B-205	ENST00000588337	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.04	■■■■■ 4.48
KDM4B-205	ENST00000588337	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.02	■■■■■ 4.48
KDM4B-205	ENST00000588337	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.02	■■■■■ 4.48
KDM4B-205	ENST00000588337	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.01	■■■■■ 4.48
KDM4B-205	ENST00000588337	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.99	■■■■■ 4.47
KDM4B-205	ENST00000588337	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.98	■■■■■ 4.47
KDM4B-205	ENST00000588337	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
KDM4B-205	ENST00000588337	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.96	■■■■■ 4.47
KDM4B-205	ENST00000588337	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.96	■■■■■ 4.47
KDM4B-205	ENST00000588337	MLEC	Q14165	292 aa		42.95	■■■■■ 4.47
KDM4B-205	ENST00000588337	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
KDM4B-205	ENST00000588337	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.9	■■■■■ 4.46
KDM4B-205	ENST00000588337	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
KDM4B-205	ENST00000588337	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.88	■■■■■ 4.45
KDM4B-205	ENST00000588337	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.82	■■■■■ 4.45	3e-8	■■■□□ 15.7
KDM4B-205	ENST00000588337	AGL	P35573	1532 aa		42.81	■■■■■ 4.44
KDM4B-205	ENST00000588337	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
KDM4B-205	ENST00000588337	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.8	■■■■■ 4.44
KDM4B-205	ENST00000588337	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.77	■■■■■ 4.44
KDM4B-205	ENST00000588337	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.77	■■■■■ 4.44
KDM4B-205	ENST00000588337	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
KDM4B-205	ENST00000588337	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.74	■■■■■ 4.43
KDM4B-205	ENST00000588337	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.72	■■■■■ 4.43
KDM4B-205	ENST00000588337	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
KDM4B-205	ENST00000588337	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.68	■■■■■ 4.42
KDM4B-205	ENST00000588337	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.68	■■■■■ 4.42
KDM4B-205	ENST00000588337	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.64	■■■■■ 4.42
KDM4B-205	ENST00000588337	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.62	■■■■■ 4.41
KDM4B-205	ENST00000588337	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.6	■■■■■ 4.41
KDM4B-205	ENST00000588337	C3	P01024	1663 aa		42.58	■■■■■ 4.41
KDM4B-205	ENST00000588337	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.57	■■■■■ 4.41
KDM4B-205	ENST00000588337	A2M	P01023	1474 aa		42.56	■■■■■ 4.4
KDM4B-205	ENST00000588337	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
KDM4B-205	ENST00000588337	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.52	■■■■■ 4.4
KDM4B-205	ENST00000588337	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
KDM4B-205	ENST00000588337	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.5	■■■■■ 4.39
KDM4B-205	ENST00000588337	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.47	■■■■■ 4.39
KDM4B-205	ENST00000588337	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.46	■■■■■ 4.39
KDM4B-205	ENST00000588337	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.46	■■■■■ 4.39
KDM4B-205	ENST00000588337	HSPA2	P54652	639 aa		42.45	■■■■■ 4.39
KDM4B-205	ENST00000588337	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
KDM4B-205	ENST00000588337	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
KDM4B-205	ENST00000588337	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.38
KDM4B-205	ENST00000588337	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.37	■■■■■ 4.37
KDM4B-205	ENST00000588337	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.37	■■■■■ 4.37
KDM4B-205	ENST00000588337	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.33	■■■■■ 4.37
KDM4B-205	ENST00000588337	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.32	■■■■■ 4.37
KDM4B-205	ENST00000588337	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
KDM4B-205	ENST00000588337	APLP2	Q06481	763 aa		42.29	■■■■■ 4.36
KDM4B-205	ENST00000588337	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.27	■■■■■ 4.36
KDM4B-205	ENST00000588337	GGT6	Q6P531	493 aa		42.26	■■■■■ 4.36
KDM4B-205	ENST00000588337	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.25	■■■■■ 4.35
KDM4B-205	ENST00000588337	NPAT	Q14207	1427 aa		42.2	■■■■■ 4.35
KDM4B-205	ENST00000588337	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.2	■■■■■ 4.35
KDM4B-205	ENST00000588337	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.2	■■■■■ 4.35
KDM4B-205	ENST00000588337	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
KDM4B-205	ENST00000588337	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.18	■■■■■ 4.34
KDM4B-205	ENST00000588337	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.17	■■■■■ 4.34
KDM4B-205	ENST00000588337	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.16	■■■■■ 4.34
KDM4B-205	ENST00000588337	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.13	■■■■■ 4.34
KDM4B-205	ENST00000588337	KIF3B	O15066	747 aa		42.11	■■■■■ 4.33
KDM4B-205	ENST00000588337	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.1	■■■■■ 4.33
KDM4B-205	ENST00000588337	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.1	■■■■■ 4.33
KDM4B-205	ENST00000588337	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.09	■■■■■ 4.33
KDM4B-205	ENST00000588337	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.08	■■■■■ 4.33
KDM4B-205	ENST00000588337	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.06	■■■■■ 4.32
KDM4B-205	ENST00000588337	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32

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