RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588337.5

KDM4B-205, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM4B, Length 504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-205ENST00000588337 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.48■■■■■ 4.55
KDM4B-205ENST00000588337 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.46■■■■■ 4.55
KDM4B-205ENST00000588337 PREX2Q70Z35 1606 aa43.45■■■■■ 4.55
KDM4B-205ENST00000588337 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.45■■■■■ 4.55
KDM4B-205ENST00000588337 CEP162Q5TB80 1403 aa43.44■■■■■ 4.54
KDM4B-205ENST00000588337 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.43■■■■■ 4.54
KDM4B-205ENST00000588337 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.43■■■■■ 4.54
KDM4B-205ENST00000588337 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.4■■■■■ 4.54
KDM4B-205ENST00000588337 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.38■■■■■ 4.53
KDM4B-205ENST00000588337 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.38■■■■■ 4.53
KDM4B-205ENST00000588337 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.34■■■■■ 4.53
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KDM4B-205ENST00000588337 KDM5CP41229 1560 aa43.28■■■■■ 4.52
KDM4B-205ENST00000588337 ABCC1P33527 1531 aa43.26■■■■■ 4.52
KDM4B-205ENST00000588337 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.24■■■■■ 4.51
KDM4B-205ENST00000588337 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.23■■■■■ 4.51
KDM4B-205ENST00000588337 PTPRMP28827 1452 aa43.22■■■■■ 4.51
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KDM4B-205ENST00000588337 AFAP1Q8N556 730 aa43.14■■■■■ 4.5
KDM4B-205ENST00000588337 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.14■■■■■ 4.5
KDM4B-205ENST00000588337 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.13■■■■■ 4.49
KDM4B-205ENST00000588337 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.12■■■■■ 4.49
KDM4B-205ENST00000588337 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.11■■■■■ 4.49
KDM4B-205ENST00000588337 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.1■■■■■ 4.49
KDM4B-205ENST00000588337 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.08■■■■■ 4.49
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KDM4B-205ENST00000588337 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.05■■■■■ 4.48
KDM4B-205ENST00000588337 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.04■■■■■ 4.48
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KDM4B-205ENST00000588337 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.02■■■■■ 4.48
KDM4B-205ENST00000588337 TIAM1Q13009 1591 aa43.01■■■■■ 4.48
KDM4B-205ENST00000588337 REREQ9P2R6 1566 aa42.99■■■■■ 4.47
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KDM4B-205ENST00000588337 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
KDM4B-205ENST00000588337 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.96■■■■■ 4.47
KDM4B-205ENST00000588337 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.96■■■■■ 4.47
KDM4B-205ENST00000588337 MLECQ14165 292 aa42.95■■■■■ 4.47
KDM4B-205ENST00000588337 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
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KDM4B-205ENST00000588337 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
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KDM4B-205ENST00000588337 A2MP01023 1474 aa42.56■■■■■ 4.4
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KDM4B-205ENST00000588337 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.5■■■■■ 4.39
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KDM4B-205ENST00000588337 MROH2AA6NES4 1674 aa42.46■■■■■ 4.39
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KDM4B-205ENST00000588337 TSPY4P0CV99 314 aa42.2■■■■■ 4.35
KDM4B-205ENST00000588337 TSPY10P0CW01 314 aa42.2■■■■■ 4.35
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KDM4B-205ENST00000588337 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.17■■■■■ 4.34
KDM4B-205ENST00000588337 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.16■■■■■ 4.34
KDM4B-205ENST00000588337 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.13■■■■■ 4.34
KDM4B-205ENST00000588337 KIF3BO15066 747 aa42.11■■■■■ 4.33
KDM4B-205ENST00000588337 PTPRKQ15262 1439 aa42.1■■■■■ 4.33
KDM4B-205ENST00000588337 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.1■■■■■ 4.33
KDM4B-205ENST00000588337 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.09■■■■■ 4.33
KDM4B-205ENST00000588337 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.08■■■■■ 4.33
KDM4B-205ENST00000588337 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.06■■■■■ 4.32
KDM4B-205ENST00000588337 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
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