RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587663.1

ACTBP9-201, Transcript of actin, beta pseudogene 9, humanhuman

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Gene ACTBP9, Length 1,099 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP9-201ENST00000587663 PLCH2O75038 1416 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTBP9-201ENST00000587663 FMN1Q68DA7 1419 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTBP9-201ENST00000587663 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTBP9-201ENST00000587663 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTBP9-201ENST00000587663 RICTORQ6R327 1708 aa20.83■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 AFAP1Q8N556 730 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 ATP10AO60312 1499 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 HECW1Q76N89 1606 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTBP9-201ENST00000587663 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTBP9-201ENST00000587663 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTBP9-201ENST00000587663 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTBP9-201ENST00000587663 MAP3K1Q13233 1512 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTBP9-201ENST00000587663 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.71■□□□□ 0.91
ACTBP9-201ENST00000587663 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTBP9-201ENST00000587663 TIAM1Q13009 1591 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTBP9-201ENST00000587663 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTBP9-201ENST00000587663 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 APLP2Q06481 763 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTBP9-201ENST00000587663 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 KIF14Q15058 1648 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 ILDR2Q71H61 639 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 KDM5CP41229 1560 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTBP9-201ENST00000587663 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 PTPRTO14522 1441 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 STRCQ7RTU9 1775 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 AGLP35573 1532 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTBP9-201ENST00000587663 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 REREQ9P2R6 1566 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 ZMYM3Q14202 1370 aa20.44■□□□□ 0.86
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ACTBP9-201ENST00000587663 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 ABCA6Q8N139 1617 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
ACTBP9-201ENST00000587663 ABCC1P33527 1531 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 C3P01024 1663 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 NCOA1Q15788 1441 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 GGT6Q6P531 493 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 NCOA2Q15596 1464 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 NPATQ14207 1427 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 PREX2Q70Z35 1606 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTBP9-201ENST00000587663 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 PKD2Q13563 968 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTBP9-201ENST00000587663 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.27■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 A2MP01023 1474 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 PTPRKQ15262 1439 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 ATP7AQ04656 1500 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTBP9-201ENST00000587663 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTBP9-201ENST00000587663 MROH2AA6NES4 1674 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTBP9-201ENST00000587663 MIA2Q96PC5 1412 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTBP9-201ENST00000587663 PLA2R1Q13018 1463 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTBP9-201ENST00000587663 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
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