RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-208ENST00000586312 CEP162Q5TB80 1403 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-208ENST00000586312 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.19■■□□□ 1.14
PSME3-208ENST00000586312 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.18■■□□□ 1.14
PSME3-208ENST00000586312 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.17■■□□□ 1.14
PSME3-208ENST00000586312 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.16■■□□□ 1.14
PSME3-208ENST00000586312 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.16■■□□□ 1.14
PSME3-208ENST00000586312 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.15■■□□□ 1.14
PSME3-208ENST00000586312 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.14■■□□□ 1.13
PSME3-208ENST00000586312 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.13■■□□□ 1.13
PSME3-208ENST00000586312 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.12■■□□□ 1.13
PSME3-208ENST00000586312 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.11■■□□□ 1.13
PSME3-208ENST00000586312 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.11■■□□□ 1.13
PSME3-208ENST00000586312 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.08■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 KDM5CP41229 1560 aa22.08■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 MADDQ8WXG6 1647 aa22.07■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 ABCC1P33527 1531 aa22.06■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.06■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.02■■□□□ 1.12
PSME3-208ENST00000586312 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.01■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 AFAP1Q8N556 730 aa22.01■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.99■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 ABCA6Q8N139 1617 aa21.99■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 PTPRMP28827 1452 aa21.99■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.99■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.99■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 ATP10AO60312 1499 aa21.98■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 TIAM1Q13009 1591 aa21.98■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.97■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.97■■□□□ 1.11
PSME3-208ENST00000586312 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.95■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.95■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.94■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 REREQ9P2R6 1566 aa21.91■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.91■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PSME3-208ENST00000586312 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 MLECQ14165 292 aa21.87■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 NCOA2Q15596 1464 aa21.86■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.86■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.83■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.83■■□□□ 1.09
PSME3-208ENST00000586312 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.83■■□□□ 1.08
PSME3-208ENST00000586312 AGLP35573 1532 aa21.82■■□□□ 1.08
PSME3-208ENST00000586312 MAP3K1Q13233 1512 aa21.81■■□□□ 1.08
PSME3-208ENST00000586312 MBD5Q9P267 1494 aa21.81■■□□□ 1.08
PSME3-208ENST00000586312 ATP7AQ04656 1500 aa21.8■■□□□ 1.08
PSME3-208ENST00000586312 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PSME3-208ENST00000586312 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PSME3-208ENST00000586312 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
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PSME3-208ENST00000586312 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.76■■□□□ 1.07
PSME3-208ENST00000586312 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.76■■□□□ 1.07
PSME3-208ENST00000586312 PLXNC1O60486 1568 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME3-208ENST00000586312 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME3-208ENST00000586312 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME3-208ENST00000586312 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.7■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.7■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 A2MP01023 1474 aa21.69■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 MROH2AA6NES4 1674 aa21.67■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.67■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.66■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PSME3-208ENST00000586312 APLP2Q06481 763 aa21.64■■□□□ 1.05
PSME3-208ENST00000586312 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.63■■□□□ 1.05
PSME3-208ENST00000586312 HSPA2P54652 639 aa21.61■■□□□ 1.05
PSME3-208ENST00000586312 MIA2Q96PC5 1412 aa21.6■■□□□ 1.05
PSME3-208ENST00000586312 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.59■■□□□ 1.05
PSME3-208ENST00000586312 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.59■■□□□ 1.05
PSME3-208ENST00000586312 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.58■■□□□ 1.05
PSME3-208ENST00000586312 STRCQ7RTU9 1775 aa21.58■■□□□ 1.04
PSME3-208ENST00000586312 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PSME3-208ENST00000586312 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.57■■□□□ 1.04
PSME3-208ENST00000586312 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.56■■□□□ 1.04
PSME3-208ENST00000586312 ZMYM3Q14202 1370 aa21.53■■□□□ 1.04
PSME3-208ENST00000586312 GGT6Q6P531 493 aa21.53■■□□□ 1.04
PSME3-208ENST00000586312 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PSME3-208ENST00000586312 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.5■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 TSPY4P0CV99 314 aa21.49■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 TSPY10P0CW01 314 aa21.49■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.47■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 KIF3BO15066 747 aa21.47■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 ABCC5O15440 1437 aa21.46■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 NPATQ14207 1427 aa21.46■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 PTPRKQ15262 1439 aa21.46■■□□□ 1.03
PSME3-208ENST00000586312 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.46■■□□□ 1.03
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