RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 KDM6BO15054 1643 aa21.88■■□□□ 1.09
GGA3-216ENST00000583282 PLCH2O75038 1416 aa21.88■■□□□ 1.09
GGA3-216ENST00000583282 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GGA3-216ENST00000583282 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GGA3-216ENST00000583282 NEO1Q92859 1461 aa21.84■■□□□ 1.09
GGA3-216ENST00000583282 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.83■■□□□ 1.09
GGA3-216ENST00000583282 ABCC1P33527 1531 aa21.81■■□□□ 1.08
GGA3-216ENST00000583282 ADGRL1O94910 1474 aa21.81■■□□□ 1.08
GGA3-216ENST00000583282 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.8■■□□□ 1.08
GGA3-216ENST00000583282 AKNAQ7Z591 1439 aa21.8■■□□□ 1.08
GGA3-216ENST00000583282 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.79■■□□□ 1.08
GGA3-216ENST00000583282 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.78■■□□□ 1.08
GGA3-216ENST00000583282 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.78■■□□□ 1.08
GGA3-216ENST00000583282 RICTORQ6R327 1708 aa21.76■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.76■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.75■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.73■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.72■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.71■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.71■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.7■■□□□ 1.07
GGA3-216ENST00000583282 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.69■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 MIA2Q96PC5 1412 aa21.68■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.65■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 RAPGEF3O95398 923 aa21.65■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 KDM5CP41229 1560 aa21.65■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.65■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.64■■□□□ 1.06
GGA3-216ENST00000583282 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.64■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.63■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.62■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.61■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.61■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.6■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 MBD5Q9P267 1494 aa21.59■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.59■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
GGA3-216ENST00000583282 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 ABCA6Q8N139 1617 aa21.56■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 ATP7AQ04656 1500 aa21.55■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 AFAP1Q8N556 730 aa21.55■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.55■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.54■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.53■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.53■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 DAPK1P53355 1430 aa21.52■■□□□ 1.04
GGA3-216ENST00000583282 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.5■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.5■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.5■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.49■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 ABCC5O15440 1437 aa21.48■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.48■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.48■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.46■■□□□ 1.03
GGA3-216ENST00000583282 PLXNC1O60486 1568 aa21.44■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 ITGAEP38570 1179 aa21.42■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.41■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 TSPY4P0CV99 314 aa21.4■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 TSPY10P0CW01 314 aa21.4■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.4■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 ATP10AO60312 1499 aa21.39■■□□□ 1.02
GGA3-216ENST00000583282 REREQ9P2R6 1566 aa21.39■■□□□ 1.01
GGA3-216ENST00000583282 PTPRKQ15262 1439 aa21.38■■□□□ 1.01
GGA3-216ENST00000583282 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.38■■□□□ 1.01
GGA3-216ENST00000583282 A2MP01023 1474 aa21.37■■□□□ 1.01
GGA3-216ENST00000583282 ADGRL2O95490 1459 aa21.36■■□□□ 1.01
GGA3-216ENST00000583282 KIF15Q9NS87 1388 aa21.34■■□□□ 1.01
GGA3-216ENST00000583282 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.32■■□□□ 1
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GGA3-216ENST00000583282 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.31■■□□□ 1
GGA3-216ENST00000583282 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.31■■□□□ 1
GGA3-216ENST00000583282 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.3■■□□□ 1
GGA3-216ENST00000583282 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
GGA3-216ENST00000583282 AGLP35573 1532 aa21.29■■□□□ 1
GGA3-216ENST00000583282 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.28■■□□□ 1
GGA3-216ENST00000583282 NCOA1Q15788 1441 aa21.28■■□□□ 1
GGA3-216ENST00000583282 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.26■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 ROCK1Q13464 1354 aa21.25■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 MADDQ8WXG6 1647 aa21.25■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 ERBINQ96RT1 1412 aa21.24■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 MLECQ14165 292 aa21.24■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.22■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
GGA3-216ENST00000583282 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.2■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.2■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 DEPDC5O75140 1603 aa21.18■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
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