RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574895.1

DNAJA3-210, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A3, humanhuman

TSL 4

Gene DNAJA3, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3-210ENST00000574895 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.94■■■■□ 3.5
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DNAJA3-210ENST00000574895 MADDQ8WXG6 1647 aa36.87■■■■□ 3.49
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DNAJA3-210ENST00000574895 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.86■■■■□ 3.49
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DNAJA3-210ENST00000574895 AFAP1Q8N556 730 aa36.83■■■■□ 3.49
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DNAJA3-210ENST00000574895 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.76■■■■□ 3.48
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DNAJA3-210ENST00000574895 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.59■■■■□ 3.45
DNAJA3-210ENST00000574895 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
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DNAJA3-210ENST00000574895 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.46■■■■□ 3.43
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DNAJA3-210ENST00000574895 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.43
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DNAJA3-210ENST00000574895 AGLP35573 1532 aa36.39■■■■□ 3.42
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DNAJA3-210ENST00000574895 FBXO41Q8TF61 875 aa36.37■■■■□ 3.41
DNAJA3-210ENST00000574895 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.35■■■■□ 3.41
DNAJA3-210ENST00000574895 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.34■■■■□ 3.41
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DNAJA3-210ENST00000574895 ZMYM3Q14202 1370 aa36.11■■■■□ 3.37
DNAJA3-210ENST00000574895 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
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DNAJA3-210ENST00000574895 MAP3K1Q13233 1512 aa35.82■■■■□ 3.32
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DNAJA3-210ENST00000574895 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.77■■■■□ 3.32
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DNAJA3-210ENST00000574895 PKD2Q13563 968 aa35.74■■■■□ 3.31
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DNAJA3-210ENST00000574895 MIA2Q96PC5 1412 aa35.72■■■■□ 3.31
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