RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574895.1

DNAJA3-210, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A3, humanhuman

TSL 4

Gene DNAJA3, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3-210ENST00000574895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.44■■■■■ 6.63
DNAJA3-210ENST00000574895 ABCC9O60706 1549 aa50.46■■■■■ 5.67
DNAJA3-210ENST00000574895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.43■■■■■ 5.66
DNAJA3-210ENST00000574895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.04■■■■■ 5.28
DNAJA3-210ENST00000574895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.79■■■■■ 5.24
DNAJA3-210ENST00000574895 NACADO15069 1562 aa47.77■■■■■ 5.24
DNAJA3-210ENST00000574895 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.28■■■■■ 5.16
DNAJA3-210ENST00000574895 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.17■■■■■ 5.14
DNAJA3-210ENST00000574895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.12■■■■■ 5.13
DNAJA3-210ENST00000574895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
DNAJA3-210ENST00000574895 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.74■■■■■ 5.07
DNAJA3-210ENST00000574895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.62■■■■■ 5.05
DNAJA3-210ENST00000574895 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.59■■■■■ 5.05
DNAJA3-210ENST00000574895 SCRIBQ14160 1630 aa46.03■■■■■ 4.96
DNAJA3-210ENST00000574895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.03■■■■■ 4.96
DNAJA3-210ENST00000574895 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.51■■■■■ 4.88
DNAJA3-210ENST00000574895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
DNAJA3-210ENST00000574895 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.45■■■■■ 4.87
DNAJA3-210ENST00000574895 NCAPD3P42695 1498 aa44.17■■■■■ 4.66
DNAJA3-210ENST00000574895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.03■■■■■ 4.64
DNAJA3-210ENST00000574895 SMARCA4P51532 1647 aa43.92■■■■■ 4.62
DNAJA3-210ENST00000574895 SMARCA2P51531 1590 aa43.88■■■■■ 4.61
DNAJA3-210ENST00000574895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
DNAJA3-210ENST00000574895 HMGXB3Q12766 1538 aa43.75■■■■■ 4.59
DNAJA3-210ENST00000574895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
DNAJA3-210ENST00000574895 ERCC6Q03468 1493 aa43.57■■■■■ 4.57
DNAJA3-210ENST00000574895 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.51■■■■■ 4.56
DNAJA3-210ENST00000574895 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.49■■■■■ 4.55
DNAJA3-210ENST00000574895 CUX2O14529 1486 aa43.41■■■■■ 4.54
DNAJA3-210ENST00000574895 NESP48681 1621 aa43.37■■■■■ 4.53
DNAJA3-210ENST00000574895 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.34■■■■■ 4.53
DNAJA3-210ENST00000574895 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.05■■■■■ 4.48
DNAJA3-210ENST00000574895 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.92■■■■■ 4.46
DNAJA3-210ENST00000574895 WIZO95785 1651 aa42.9■■■■■ 4.46
DNAJA3-210ENST00000574895 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.87■■■■■ 4.45
DNAJA3-210ENST00000574895 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
DNAJA3-210ENST00000574895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
DNAJA3-210ENST00000574895 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.66■■■■■ 4.42
DNAJA3-210ENST00000574895 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.47■■■■■ 4.39
DNAJA3-210ENST00000574895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
DNAJA3-210ENST00000574895 CFTRP13569 1480 aa42.36■■■■■ 4.37
DNAJA3-210ENST00000574895 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.33■■■■■ 4.37
DNAJA3-210ENST00000574895 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.32■■■■■ 4.37
DNAJA3-210ENST00000574895 WDR62O43379 1518 aa42.3■■■■■ 4.36
DNAJA3-210ENST00000574895 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.01■■■■■ 4.32
DNAJA3-210ENST00000574895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
DNAJA3-210ENST00000574895 PRDM2Q13029 1718 aa41.66■■■■■ 4.26
DNAJA3-210ENST00000574895 OSCARQ8IYS5 282 aa41.61■■■■■ 4.25
DNAJA3-210ENST00000574895 TOPBP1Q92547 1522 aa41.51■■■■■ 4.24
DNAJA3-210ENST00000574895 IFT140Q96RY7 1462 aa41.51■■■■■ 4.24
DNAJA3-210ENST00000574895 TRIM41Q8WV44 630 aa41.5■■■■■ 4.23
DNAJA3-210ENST00000574895 ABCC8Q09428 1581 aa41.49■■■■■ 4.23
DNAJA3-210ENST00000574895 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
DNAJA3-210ENST00000574895 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.33■■■■■ 4.21
DNAJA3-210ENST00000574895 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.1■■■■■ 4.172e-10■■■■■ 41.2
DNAJA3-210ENST00000574895 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
DNAJA3-210ENST00000574895 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
DNAJA3-210ENST00000574895 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
DNAJA3-210ENST00000574895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
DNAJA3-210ENST00000574895 SOGA1O94964 1423 aa41.01■■■■■ 4.15
DNAJA3-210ENST00000574895 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.98■■■■■ 4.15
DNAJA3-210ENST00000574895 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
DNAJA3-210ENST00000574895 FBLN2P98095 1184 aa40.9■■■■■ 4.14
DNAJA3-210ENST00000574895 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.87■■■■■ 4.13
DNAJA3-210ENST00000574895 CUX1P39880 1505 aa40.83■■■■■ 4.13
DNAJA3-210ENST00000574895 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
DNAJA3-210ENST00000574895 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
DNAJA3-210ENST00000574895 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
DNAJA3-210ENST00000574895 ARHGEF11O15085 1522 aa40.77■■■■■ 4.12
DNAJA3-210ENST00000574895 CHD1O14646 1710 aa40.67■■■■■ 4.1
DNAJA3-210ENST00000574895 WDR97A6NE52 1622 aa40.66■■■■■ 4.1
DNAJA3-210ENST00000574895 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
DNAJA3-210ENST00000574895 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.63■■■■■ 4.09
DNAJA3-210ENST00000574895 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.62■■■■■ 4.09
DNAJA3-210ENST00000574895 GRIN2BQ13224 1484 aa40.58■■■■■ 4.09
DNAJA3-210ENST00000574895 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
DNAJA3-210ENST00000574895 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.46■■■■■ 4.07
DNAJA3-210ENST00000574895 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
DNAJA3-210ENST00000574895 SYNJ2O15056 1496 aa40.41■■■■■ 4.06
DNAJA3-210ENST00000574895 ARAP1Q96P48 1450 aa40.38■■■■■ 4.05
DNAJA3-210ENST00000574895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.05
DNAJA3-210ENST00000574895 SYNJ1O43426 1573 aa40.34■■■■■ 4.05
DNAJA3-210ENST00000574895 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.32■■■■■ 4.04
DNAJA3-210ENST00000574895 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.24■■■■■ 4.03
DNAJA3-210ENST00000574895 PBRM1Q86U86 1689 aa40.23■■■■■ 4.03
DNAJA3-210ENST00000574895 TOP2BQ02880 1626 aa40.2■■■■■ 4.03
DNAJA3-210ENST00000574895 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.13■■■■■ 4.02
DNAJA3-210ENST00000574895 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
DNAJA3-210ENST00000574895 GRIN2AQ12879 1464 aa40.03■■■■■ 4
DNAJA3-210ENST00000574895 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.98■■■■□ 3.99
DNAJA3-210ENST00000574895 ADAMTS12P58397 1594 aa39.94■■■■□ 3.98
DNAJA3-210ENST00000574895 NUP160Q12769 1436 aa39.91■■■■□ 3.98
DNAJA3-210ENST00000574895 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.9■■■■□ 3.98
DNAJA3-210ENST00000574895 CEP170Q5SW79 1584 aa39.82■■■■□ 3.97
DNAJA3-210ENST00000574895 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.71■■■■□ 3.95
DNAJA3-210ENST00000574895 JPH4Q96JJ6 628 aa39.63■■■■□ 3.93
DNAJA3-210ENST00000574895 SHROOM2Q13796 1616 aa39.6■■■■□ 3.93
DNAJA3-210ENST00000574895 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
DNAJA3-210ENST00000574895 IGF1RP08069 1367 aa39.55■■■■□ 3.92
DNAJA3-210ENST00000574895 KIF27Q86VH2 1401 aa39.55■■■■□ 3.92
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