RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
E2F4-210ENST00000568485 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
E2F4-210ENST00000568485 KIF14Q15058 1648 aa36.41■■■■□ 3.42
E2F4-210ENST00000568485 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.39■■■■□ 3.42
E2F4-210ENST00000568485 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
E2F4-210ENST00000568485 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
E2F4-210ENST00000568485 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.37■■■■□ 3.41
E2F4-210ENST00000568485 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.35■■■■□ 3.41
E2F4-210ENST00000568485 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.34■■■■□ 3.41
E2F4-210ENST00000568485 CLIP1P30622 1438 aa36.3■■■■□ 3.4
E2F4-210ENST00000568485 ATP10AO60312 1499 aa36.26■■■■□ 3.4
E2F4-210ENST00000568485 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.25■■■■□ 3.39
E2F4-210ENST00000568485 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.25■■■■□ 3.39
E2F4-210ENST00000568485 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.24■■■■□ 3.39
E2F4-210ENST00000568485 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.23■■■■□ 3.39
E2F4-210ENST00000568485 MLECQ14165 292 aa36.22■■■■□ 3.39
E2F4-210ENST00000568485 KDM5CP41229 1560 aa36.22■■■■□ 3.39
E2F4-210ENST00000568485 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.2■■■■□ 3.39
E2F4-210ENST00000568485 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.2■■■■□ 3.38
E2F4-210ENST00000568485 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.18■■■■□ 3.38
E2F4-210ENST00000568485 AFAP1Q8N556 730 aa36.16■■■■□ 3.38
E2F4-210ENST00000568485 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.15■■■■□ 3.38
E2F4-210ENST00000568485 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.15■■■■□ 3.38
E2F4-210ENST00000568485 PREX2Q70Z35 1606 aa36.12■■■■□ 3.37
E2F4-210ENST00000568485 HSPA2P54652 639 aa36.11■■■■□ 3.37
E2F4-210ENST00000568485 FBXO41Q8TF61 875 aa36.09■■■■□ 3.37
E2F4-210ENST00000568485 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.08■■■■□ 3.37
E2F4-210ENST00000568485 ABCC1P33527 1531 aa36.08■■■■□ 3.37
E2F4-210ENST00000568485 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.07■■■■□ 3.37
E2F4-210ENST00000568485 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.05■■■■□ 3.36
E2F4-210ENST00000568485 REREQ9P2R6 1566 aa36.05■■■■□ 3.36
E2F4-210ENST00000568485 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.03■■■■□ 3.36
E2F4-210ENST00000568485 ABCA6Q8N139 1617 aa36.02■■■■□ 3.36
E2F4-210ENST00000568485 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36■■■■□ 3.35
E2F4-210ENST00000568485 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.98■■■■□ 3.35
E2F4-210ENST00000568485 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.97■■■■□ 3.35
E2F4-210ENST00000568485 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
E2F4-210ENST00000568485 AGLP35573 1532 aa35.93■■■■□ 3.34
E2F4-210ENST00000568485 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.92■■■■□ 3.34
E2F4-210ENST00000568485 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.89■■■■□ 3.34
E2F4-210ENST00000568485 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
E2F4-210ENST00000568485 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.87■■■■□ 3.33
E2F4-210ENST00000568485 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.82■■■■□ 3.32
E2F4-210ENST00000568485 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
E2F4-210ENST00000568485 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.79■■■■□ 3.32
E2F4-210ENST00000568485 C3P01024 1663 aa35.78■■■■□ 3.32
E2F4-210ENST00000568485 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.74■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 STRCQ7RTU9 1775 aa35.71■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.7■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 CERKQ8TCT0 537 aa35.7■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.7■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.7■■■■□ 3.31
E2F4-210ENST00000568485 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.69■■■■□ 3.3
E2F4-210ENST00000568485 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
E2F4-210ENST00000568485 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
E2F4-210ENST00000568485 ATP7AQ04656 1500 aa35.67■■■■□ 3.3
E2F4-210ENST00000568485 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
E2F4-210ENST00000568485 PLXNC1O60486 1568 aa35.63■■■■□ 3.29
E2F4-210ENST00000568485 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.61■■■■□ 3.29
E2F4-210ENST00000568485 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.61■■■■□ 3.29
E2F4-210ENST00000568485 TIAM1Q13009 1591 aa35.6■■■■□ 3.29
E2F4-210ENST00000568485 MROH2AA6NES4 1674 aa35.59■■■■□ 3.29
E2F4-210ENST00000568485 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
E2F4-210ENST00000568485 A2MP01023 1474 aa35.57■■■■□ 3.28
E2F4-210ENST00000568485 CEP162Q5TB80 1403 aa35.57■■■■□ 3.28
E2F4-210ENST00000568485 NPATQ14207 1427 aa35.55■■■■□ 3.28
E2F4-210ENST00000568485 PTPRTO14522 1441 aa35.54■■■■□ 3.28
E2F4-210ENST00000568485 ZMYM3Q14202 1370 aa35.53■■■■□ 3.28
E2F4-210ENST00000568485 MBD5Q9P267 1494 aa35.53■■■■□ 3.28
E2F4-210ENST00000568485 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
E2F4-210ENST00000568485 NCOA1Q15788 1441 aa35.49■■■■□ 3.27
E2F4-210ENST00000568485 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
E2F4-210ENST00000568485 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.45■■■■□ 3.27
E2F4-210ENST00000568485 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.42■■■■□ 3.26
E2F4-210ENST00000568485 GGT6Q6P531 493 aa35.4■■■■□ 3.26
E2F4-210ENST00000568485 PTPRKQ15262 1439 aa35.4■■■■□ 3.26
E2F4-210ENST00000568485 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.39■■■■□ 3.26
E2F4-210ENST00000568485 NCOA2Q15596 1464 aa35.38■■■■□ 3.25
E2F4-210ENST00000568485 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.36■■■■□ 3.25
E2F4-210ENST00000568485 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.35■■■■□ 3.25
E2F4-210ENST00000568485 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.35■■■■□ 3.25
E2F4-210ENST00000568485 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
E2F4-210ENST00000568485 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
E2F4-210ENST00000568485 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.32■■■■□ 3.24
E2F4-210ENST00000568485 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.32■■■■□ 3.24
E2F4-210ENST00000568485 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
E2F4-210ENST00000568485 PLA2R1Q13018 1463 aa35.28■■■■□ 3.24
E2F4-210ENST00000568485 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.24■■■■□ 3.23
E2F4-210ENST00000568485 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.23■■■■□ 3.23
E2F4-210ENST00000568485 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.23■■■■□ 3.23
E2F4-210ENST00000568485 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.22■■■■□ 3.23
E2F4-210ENST00000568485 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
E2F4-210ENST00000568485 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.21■■■■□ 3.23
E2F4-210ENST00000568485 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.18■■■■□ 3.22
E2F4-210ENST00000568485 KIF3BO15066 747 aa35.18■■■■□ 3.22
E2F4-210ENST00000568485 PKD2Q13563 968 aa35.18■■■■□ 3.22
E2F4-210ENST00000568485 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.17■■■■□ 3.22
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