RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567943.1

FANCA-228, Transcript of FA complementation group A, humanhuman

TSL 3

Gene FANCA, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCA-228ENST00000567943 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.47■■■■■ 4.07
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FANCA-228ENST00000567943 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.43■■■■■ 4.06
FANCA-228ENST00000567943 PREX2Q70Z35 1606 aa40.42■■■■■ 4.06
FANCA-228ENST00000567943 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.4■■■■■ 4.06
FANCA-228ENST00000567943 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.36■■■■■ 4.05
FANCA-228ENST00000567943 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.32■■■■■ 4.05
FANCA-228ENST00000567943 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.32■■■■■ 4.04
FANCA-228ENST00000567943 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.31■■■■■ 4.04
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FANCA-228ENST00000567943 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.28■■■■■ 4.04
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FANCA-228ENST00000567943 ABCC1P33527 1531 aa40.25■■■■■ 4.03
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FANCA-228ENST00000567943 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.92■■■■□ 3.98
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FANCA-228ENST00000567943 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.51■■■■□ 3.92
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FANCA-228ENST00000567943 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
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FANCA-228ENST00000567943 DAPK1P53355 1430 aa39.14■■■■□ 3.86
FANCA-228ENST00000567943 STRCQ7RTU9 1775 aa39.14■■■■□ 3.86
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