RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
HERC2-208ENST00000566635 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HERC2-208ENST00000566635 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HERC2-208ENST00000566635 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 DAPK1P53355 1430 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 HRCP23327 699 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.49■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 ABCC5O15440 1437 aa26.48■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.47■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.47■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.47■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HERC2-208ENST00000566635 PLCH2O75038 1416 aa26.45■■□□□ 1.82
HERC2-208ENST00000566635 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.44■■□□□ 1.82
HERC2-208ENST00000566635 MAPKBP1O60336 1514 aa26.43■■□□□ 1.82
HERC2-208ENST00000566635 HFM1A2PYH4 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC2-208ENST00000566635 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.4■■□□□ 1.82
HERC2-208ENST00000566635 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.4■■□□□ 1.82
HERC2-208ENST00000566635 NAIPQ13075 1403 aa26.39■■□□□ 1.82
HERC2-208ENST00000566635 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.39■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 MBD5Q9P267 1494 aa26.37■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 AKNAQ7Z591 1439 aa26.37■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.36■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 ABCC1P33527 1531 aa26.33■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 ROCK1Q13464 1354 aa26.33■■□□□ 1.81
HERC2-208ENST00000566635 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.33■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.32■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.32■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.32■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 KDM6BO15054 1643 aa26.31■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.31■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 FANCAO15360 1455 aa26.3■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 ADGRL2O95490 1459 aa26.3■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.29■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.29■■□□□ 1.8
HERC2-208ENST00000566635 CD109Q6YHK3 1445 aa26.26■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 NCOA1Q15788 1441 aa26.25■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 DIP2BQ9P265 1576 aa26.23■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.22■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 GLI2P10070 1586 aa26.21■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.21■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.21■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 TSPY4P0CV99 314 aa26.21■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 TSPY10P0CW01 314 aa26.21■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.2■■□□□ 1.79
HERC2-208ENST00000566635 ADGRL1O94910 1474 aa26.19■■□□□ 1.78
HERC2-208ENST00000566635 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.19■■□□□ 1.78
HERC2-208ENST00000566635 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.19■■□□□ 1.78
HERC2-208ENST00000566635 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.13■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 KIF15Q9NS87 1388 aa26.13■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 PLXNC1O60486 1568 aa26.13■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.11■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 AFAP1Q8N556 730 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC2-208ENST00000566635 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.07■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 NEO1Q92859 1461 aa26.07■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 TSPOAP1O95153 1857 aa26.06■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 TRIM52Q96A61 297 aa26.05■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 ATP7AQ04656 1500 aa26.03■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.02■■□□□ 1.76
HERC2-208ENST00000566635 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HERC2-208ENST00000566635 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.01■■□□□ 1.75
HERC2-208ENST00000566635 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26■■□□□ 1.75
HERC2-208ENST00000566635 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.99■■□□□ 1.75
HERC2-208ENST00000566635 KDM5CP41229 1560 aa25.99■■□□□ 1.75
HERC2-208ENST00000566635 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.97■■□□□ 1.75
HERC2-208ENST00000566635 PZPP20742 1482 aa25.95■■□□□ 1.75
HERC2-208ENST00000566635 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.95■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 RICTORQ6R327 1708 aa25.94■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.93■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.93■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 ERBINQ96RT1 1412 aa25.92■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.92■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 UNC13BO14795 1591 aa25.91■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.91■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.9■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.9■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 RAPGEF3O95398 923 aa25.89■■□□□ 1.74
HERC2-208ENST00000566635 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.88■■□□□ 1.73
HERC2-208ENST00000566635 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.88■■□□□ 1.73
HERC2-208ENST00000566635 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
HERC2-208ENST00000566635 NUP155O75694 1391 aa25.87■■□□□ 1.73
HERC2-208ENST00000566635 ABCA6Q8N139 1617 aa25.85■■□□□ 1.73
HERC2-208ENST00000566635 FOXD1Q16676 465 aa25.85■■□□□ 1.73
HERC2-208ENST00000566635 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.82■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.81■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 NEUROD1Q13562 356 aa25.81■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.8■■□□□ 1.72
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