RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.68■■■■■ 4.1
HERC2-208ENST00000566635 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.59■■■■□ 3.29
HERC2-208ENST00000566635 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
HERC2-208ENST00000566635 ABCC9O60706 1549 aa33.86■■■■□ 3.01
HERC2-208ENST00000566635 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.63■■■□□ 2.97
HERC2-208ENST00000566635 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.6■■■□□ 2.97
HERC2-208ENST00000566635 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.25■■■□□ 2.91
HERC2-208ENST00000566635 NACADO15069 1562 aa33.15■■■□□ 2.9
HERC2-208ENST00000566635 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.1■■■□□ 2.89
HERC2-208ENST00000566635 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.94■■■□□ 2.86
HERC2-208ENST00000566635 SCRIBQ14160 1630 aa32.76■■■□□ 2.84
HERC2-208ENST00000566635 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.37■■■□□ 2.77
HERC2-208ENST00000566635 BICRAQ9NZM4 1560 aa32■■■□□ 2.71
HERC2-208ENST00000566635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.86■■■□□ 2.69
HERC2-208ENST00000566635 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
HERC2-208ENST00000566635 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.66■■■□□ 2.66
HERC2-208ENST00000566635 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
HERC2-208ENST00000566635 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.45■■■□□ 2.63
HERC2-208ENST00000566635 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
HERC2-208ENST00000566635 SMARCA4P51532 1647 aa31.36■■■□□ 2.61
HERC2-208ENST00000566635 WIZO95785 1651 aa31.22■■■□□ 2.59
HERC2-208ENST00000566635 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
HERC2-208ENST00000566635 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.94■■■□□ 2.54
HERC2-208ENST00000566635 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.85■■■□□ 2.53
HERC2-208ENST00000566635 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
HERC2-208ENST00000566635 SMARCA2P51531 1590 aa30.82■■■□□ 2.52
HERC2-208ENST00000566635 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
HERC2-208ENST00000566635 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.64■■■□□ 2.5
HERC2-208ENST00000566635 NCAPD3P42695 1498 aa30.58■■■□□ 2.49
HERC2-208ENST00000566635 HMGXB3Q12766 1538 aa30.57■■■□□ 2.48
HERC2-208ENST00000566635 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.52■■■□□ 2.48
HERC2-208ENST00000566635 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.2■■■□□ 2.42
HERC2-208ENST00000566635 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.02■■■□□ 2.4
HERC2-208ENST00000566635 ABCC8Q09428 1581 aa29.88■■■□□ 2.37
HERC2-208ENST00000566635 CFTRP13569 1480 aa29.87■■■□□ 2.37
HERC2-208ENST00000566635 PRDM2Q13029 1718 aa29.78■■■□□ 2.36
HERC2-208ENST00000566635 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.78■■■□□ 2.36
HERC2-208ENST00000566635 TRIM41Q8WV44 630 aa29.76■■■□□ 2.35
HERC2-208ENST00000566635 NESP48681 1621 aa29.68■■■□□ 2.34
HERC2-208ENST00000566635 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
HERC2-208ENST00000566635 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.61■■■□□ 2.33
HERC2-208ENST00000566635 SYNJ1O43426 1573 aa29.59■■■□□ 2.33
HERC2-208ENST00000566635 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.5■■■□□ 2.31
HERC2-208ENST00000566635 TOP2BQ02880 1626 aa29.44■■■□□ 2.3
HERC2-208ENST00000566635 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.43■■■□□ 2.3
HERC2-208ENST00000566635 CUX1P39880 1505 aa29.43■■■□□ 2.3
HERC2-208ENST00000566635 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.35■■■□□ 2.29
HERC2-208ENST00000566635 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.34■■■□□ 2.29
HERC2-208ENST00000566635 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.33■■■□□ 2.29
HERC2-208ENST00000566635 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HERC2-208ENST00000566635 SOGA1O94964 1423 aa29.23■■■□□ 2.27
HERC2-208ENST00000566635 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.21■■■□□ 2.27
HERC2-208ENST00000566635 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
HERC2-208ENST00000566635 TOPBP1Q92547 1522 aa29.17■■■□□ 2.26
HERC2-208ENST00000566635 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.16■■■□□ 2.26
HERC2-208ENST00000566635 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.13■■■□□ 2.25
HERC2-208ENST00000566635 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.06■■■□□ 2.24
HERC2-208ENST00000566635 EEA1Q15075 1411 aa29.04■■■□□ 2.24
HERC2-208ENST00000566635 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.03■■■□□ 2.24
HERC2-208ENST00000566635 ERCC6Q03468 1493 aa29.02■■■□□ 2.24
HERC2-208ENST00000566635 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HERC2-208ENST00000566635 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.94■■■□□ 2.22
HERC2-208ENST00000566635 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.91■■■□□ 2.22
HERC2-208ENST00000566635 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HERC2-208ENST00000566635 WDR62O43379 1518 aa28.91■■■□□ 2.22
HERC2-208ENST00000566635 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.9■■■□□ 2.22
HERC2-208ENST00000566635 CUX2O14529 1486 aa28.89■■■□□ 2.22
HERC2-208ENST00000566635 KIF27Q86VH2 1401 aa28.88■■■□□ 2.21
HERC2-208ENST00000566635 WDR97A6NE52 1622 aa28.85■■■□□ 2.21
HERC2-208ENST00000566635 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.84■■■□□ 2.21
HERC2-208ENST00000566635 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
HERC2-208ENST00000566635 KIF21BO75037 1637 aa28.76■■■□□ 2.19
HERC2-208ENST00000566635 GOLGA3Q08378 1498 aa28.69■■■□□ 2.18
HERC2-208ENST00000566635 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.68■■■□□ 2.18
HERC2-208ENST00000566635 PRXQ9BXM0 1461 aa28.65■■■□□ 2.18
HERC2-208ENST00000566635 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.64■■■□□ 2.18
HERC2-208ENST00000566635 IGF1RP08069 1367 aa28.64■■■□□ 2.17
HERC2-208ENST00000566635 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
HERC2-208ENST00000566635 IFT140Q96RY7 1462 aa28.62■■■□□ 2.17
HERC2-208ENST00000566635 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.58■■■□□ 2.17
HERC2-208ENST00000566635 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.57■■■□□ 2.16
HERC2-208ENST00000566635 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HERC2-208ENST00000566635 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
HERC2-208ENST00000566635 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.52■■■□□ 2.16
HERC2-208ENST00000566635 PBRM1Q86U86 1689 aa28.51■■■□□ 2.15
HERC2-208ENST00000566635 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.159e-7■■■■■ 31
HERC2-208ENST00000566635 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.49■■■□□ 2.15
HERC2-208ENST00000566635 CUL7Q14999 1698 aa28.49■■■□□ 2.15
HERC2-208ENST00000566635 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HERC2-208ENST00000566635 CEP162Q5TB80 1403 aa28.41■■■□□ 2.14
HERC2-208ENST00000566635 GRIN2BQ13224 1484 aa28.37■■■□□ 2.13
HERC2-208ENST00000566635 ADAMTS12P58397 1594 aa28.32■■■□□ 2.12
HERC2-208ENST00000566635 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.26■■■□□ 2.11
HERC2-208ENST00000566635 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.24■■■□□ 2.11
HERC2-208ENST00000566635 CLIP1P30622 1438 aa28.22■■■□□ 2.11
HERC2-208ENST00000566635 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
HERC2-208ENST00000566635 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.18■■■□□ 2.1
HERC2-208ENST00000566635 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
HERC2-208ENST00000566635 SYNJ2O15056 1496 aa28.05■■■□□ 2.08
HERC2-208ENST00000566635 GRIN2AQ12879 1464 aa28.05■■■□□ 2.08
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