RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, human

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CCNDBP1-208	ENST00000566515	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ABCC1	P33527	1531 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CCNDBP1-208	ENST00000566515	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.64	■■■□□ 2.81
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.57	■■■□□ 2.81
CCNDBP1-208	ENST00000566515	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.57	■■■□□ 2.8
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KDM5C	P41229	1560 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CCNDBP1-208	ENST00000566515	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CCNDBP1-208	ENST00000566515	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.37	■■■□□ 2.77
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ATP10A	O60312	1499 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
CCNDBP1-208	ENST00000566515	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.21	■■■□□ 2.75
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ABCC5	O15440	1437 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DAPK1	P53355	1430 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CCNDBP1-208	ENST00000566515	A2M	P01023	1474 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MLEC	Q14165	292 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AGL	P35573	1532 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.03	■■■□□ 2.72
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ITGAE	P38570	1179 aa		32.01	■■■□□ 2.72
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PTPRK	Q15262	1439 aa		32	■■■□□ 2.71
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32	■■■□□ 2.71
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.96	■■■□□ 2.71
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.96	■■■□□ 2.71
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.96	■■■□□ 2.71
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.94	■■■□□ 2.7
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KIF3B	O15066	747 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CCNDBP1-208	ENST00000566515	GGT6	Q6P531	493 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PTPRM	P28827	1452 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ROCK1	Q13464	1354 aa		31.82	■■■□□ 2.68

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