RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 NCOA2Q15596 1464 aa28.04■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.03■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 PREX2Q70Z35 1606 aa28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.01■■■□□ 2.07
SPNS1-208ENST00000566059 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SPNS1-208ENST00000566059 RAPGEF3O95398 923 aa27.96■■■□□ 2.07
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRL1O94910 1474 aa27.95■■■□□ 2.06
SPNS1-208ENST00000566059 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.93■■■□□ 2.06
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SPNS1-208ENST00000566059 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SPNS1-208ENST00000566059 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.89■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC1P33527 1531 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 RICTORQ6R327 1708 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-208ENST00000566059 AFAP1Q8N556 730 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.8■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.79■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.79■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.78■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 MIA2Q96PC5 1412 aa27.78■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.77■■■□□ 2.04
SPNS1-208ENST00000566059 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.75■■■□□ 2.03
SPNS1-208ENST00000566059 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.74■■■□□ 2.03
SPNS1-208ENST00000566059 MBD5Q9P267 1494 aa27.73■■■□□ 2.03
SPNS1-208ENST00000566059 KDM5CP41229 1560 aa27.72■■■□□ 2.03
SPNS1-208ENST00000566059 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.7■■■□□ 2.03
SPNS1-208ENST00000566059 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.7■■■□□ 2.02
SPNS1-208ENST00000566059 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.68■■■□□ 2.02
SPNS1-208ENST00000566059 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.66■■■□□ 2.02
SPNS1-208ENST00000566059 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.65■■■□□ 2.02
SPNS1-208ENST00000566059 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-208ENST00000566059 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-208ENST00000566059 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-208ENST00000566059 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-208ENST00000566059 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-208ENST00000566059 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.61■■■□□ 2.01
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.6■■■□□ 2.01
SPNS1-208ENST00000566059 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.57■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 ATP10AO60312 1499 aa27.56■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 ATP7AQ04656 1500 aa27.55■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 TSPY4P0CV99 314 aa27.54■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 TSPY10P0CW01 314 aa27.54■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.53■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 ABCA6Q8N139 1617 aa27.53■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.53■■■□□ 2
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC5O15440 1437 aa27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-208ENST00000566059 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-208ENST00000566059 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SPNS1-208ENST00000566059 DAPK1P53355 1430 aa27.48■■□□□ 1.99
SPNS1-208ENST00000566059 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.47■■□□□ 1.99
SPNS1-208ENST00000566059 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SPNS1-208ENST00000566059 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.45■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 REREQ9P2R6 1566 aa27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 A2MP01023 1474 aa27.41■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.4■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.39■■□□□ 1.98
SPNS1-208ENST00000566059 AGLP35573 1532 aa27.37■■□□□ 1.97
SPNS1-208ENST00000566059 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.37■■□□□ 1.97
SPNS1-208ENST00000566059 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-208ENST00000566059 MLECQ14165 292 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-208ENST00000566059 PTPRKQ15262 1439 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-208ENST00000566059 PLXNC1O60486 1568 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-208ENST00000566059 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.35■■□□□ 1.97
SPNS1-208ENST00000566059 ITGAEP38570 1179 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS1-208ENST00000566059 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.31■■□□□ 1.96
SPNS1-208ENST00000566059 NCOA1Q15788 1441 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS1-208ENST00000566059 KIF15Q9NS87 1388 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRL2O95490 1459 aa27.29■■□□□ 1.96
SPNS1-208ENST00000566059 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-208ENST00000566059 KIF3BO15066 747 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-208ENST00000566059 MADDQ8WXG6 1647 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS1-208ENST00000566059 GGT6Q6P531 493 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS1-208ENST00000566059 ROCK1Q13464 1354 aa27.22■■□□□ 1.95
SPNS1-208ENST00000566059 ERBINQ96RT1 1412 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-208ENST00000566059 PTPRMP28827 1452 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS1-208ENST00000566059 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SPNS1-208ENST00000566059 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.15■■□□□ 1.94
SPNS1-208ENST00000566059 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-208ENST00000566059 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-208ENST00000566059 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.13■■□□□ 1.93
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