RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565666.5

CMTM3-210, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-210ENST00000565666 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.68■■■□□ 2.34
CMTM3-210ENST00000565666 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.67■■■□□ 2.34
CMTM3-210ENST00000565666 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CMTM3-210ENST00000565666 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.66■■■□□ 2.34
CMTM3-210ENST00000565666 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.64■■■□□ 2.34
CMTM3-210ENST00000565666 TIAM1Q13009 1591 aa29.63■■■□□ 2.33
CMTM3-210ENST00000565666 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.58■■■□□ 2.33
CMTM3-210ENST00000565666 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.57■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.56■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.53■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.53■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 ABCC1P33527 1531 aa29.52■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CMTM3-210ENST00000565666 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.51■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.5■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.5■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 MAP3K1Q13233 1512 aa29.5■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.48■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.47■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 APLP2Q06481 763 aa29.47■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 NCOA2Q15596 1464 aa29.46■■■□□ 2.31
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.44■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.44■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 KDM5CP41229 1560 aa29.43■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 AFAP1Q8N556 730 aa29.43■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.42■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.41■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.4■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CMTM3-210ENST00000565666 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
CMTM3-210ENST00000565666 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.34■■■□□ 2.29
CMTM3-210ENST00000565666 ATP10AO60312 1499 aa29.33■■■□□ 2.29
CMTM3-210ENST00000565666 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.33■■■□□ 2.29
CMTM3-210ENST00000565666 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.33■■■□□ 2.29
CMTM3-210ENST00000565666 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.31■■■□□ 2.28
CMTM3-210ENST00000565666 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CMTM3-210ENST00000565666 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.3■■■□□ 2.28
CMTM3-210ENST00000565666 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.29■■■□□ 2.28
CMTM3-210ENST00000565666 ABCA6Q8N139 1617 aa29.29■■■□□ 2.28
CMTM3-210ENST00000565666 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.28■■■□□ 2.28
CMTM3-210ENST00000565666 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.27■■■□□ 2.28
CMTM3-210ENST00000565666 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.26■■■□□ 2.27
CMTM3-210ENST00000565666 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CMTM3-210ENST00000565666 MADDQ8WXG6 1647 aa29.22■■■□□ 2.27
CMTM3-210ENST00000565666 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.21■■■□□ 2.27
CMTM3-210ENST00000565666 ATP7AQ04656 1500 aa29.21■■■□□ 2.27
CMTM3-210ENST00000565666 MLECQ14165 292 aa29.2■■■□□ 2.26
CMTM3-210ENST00000565666 MBD5Q9P267 1494 aa29.2■■■□□ 2.26
CMTM3-210ENST00000565666 REREQ9P2R6 1566 aa29.2■■■□□ 2.26
CMTM3-210ENST00000565666 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CMTM3-210ENST00000565666 MIA2Q96PC5 1412 aa29.16■■■□□ 2.26
CMTM3-210ENST00000565666 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.16■■■□□ 2.26
CMTM3-210ENST00000565666 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CMTM3-210ENST00000565666 PTPRMP28827 1452 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM3-210ENST00000565666 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM3-210ENST00000565666 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.12■■■□□ 2.25
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.12■■■□□ 2.25
CMTM3-210ENST00000565666 AGLP35573 1532 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM3-210ENST00000565666 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.08■■■□□ 2.25
CMTM3-210ENST00000565666 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.08■■■□□ 2.25
CMTM3-210ENST00000565666 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.06■■■□□ 2.24
CMTM3-210ENST00000565666 A2MP01023 1474 aa29.05■■■□□ 2.24
CMTM3-210ENST00000565666 TSPY4P0CV99 314 aa29.04■■■□□ 2.24
CMTM3-210ENST00000565666 TSPY10P0CW01 314 aa29.04■■■□□ 2.24
CMTM3-210ENST00000565666 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.03■■■□□ 2.24
CMTM3-210ENST00000565666 PLXNC1O60486 1568 aa29.01■■■□□ 2.24
CMTM3-210ENST00000565666 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.01■■■□□ 2.23
CMTM3-210ENST00000565666 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CMTM3-210ENST00000565666 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.96■■■□□ 2.23
CMTM3-210ENST00000565666 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CMTM3-210ENST00000565666 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.93■■■□□ 2.22
CMTM3-210ENST00000565666 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CMTM3-210ENST00000565666 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CMTM3-210ENST00000565666 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CMTM3-210ENST00000565666 ABCC5O15440 1437 aa28.87■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 DAPK1P53355 1430 aa28.87■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 GGT6Q6P531 493 aa28.87■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.86■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.86■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 C3P01024 1663 aa28.84■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 KIF3BO15066 747 aa28.83■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CMTM3-210ENST00000565666 MROH2AA6NES4 1674 aa28.82■■■□□ 2.2
CMTM3-210ENST00000565666 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.78■■■□□ 2.2
CMTM3-210ENST00000565666 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.77■■■□□ 2.2
CMTM3-210ENST00000565666 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.76■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 KIF15Q9NS87 1388 aa28.75■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.75■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.74■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.74■■■□□ 2.19
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