RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		35.12	■■■■□ 3.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		35.11	■■■■□ 3.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		35.1	■■■■□ 3.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		35.07	■■■■□ 3.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PREX2	Q70Z35	1606 aa		35.07	■■■■□ 3.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		35.04	■■■■□ 3.2
PPP4C-205	ENST00000563200	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		35.04	■■■■□ 3.2
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		35.03	■■■■□ 3.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		35.03	■■■■□ 3.2
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		35.01	■■■■□ 3.2
PPP4C-205	ENST00000563200	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		35	■■■■□ 3.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.97	■■■■□ 3.19
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		34.96	■■■■□ 3.19
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM5C	P41229	1560 aa		34.96	■■■■□ 3.19
PPP4C-205	ENST00000563200	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	34.94	■■■■□ 3.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC1	P33527	1531 aa		34.92	■■■■□ 3.18
PPP4C-205	ENST00000563200	AFAP1	Q8N556	730 aa		34.91	■■■■□ 3.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		34.91	■■■■□ 3.18
PPP4C-205	ENST00000563200	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.91	■■■■□ 3.18
PPP4C-205	ENST00000563200	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		34.88	■■■■□ 3.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MADD	Q8WXG6	1647 aa		34.88	■■■■□ 3.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRM	P28827	1452 aa		34.87	■■■■□ 3.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP10A	O60312	1499 aa		34.87	■■■■□ 3.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		34.86	■■■■□ 3.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		34.85	■■■■□ 3.17
PPP4C-205	ENST00000563200	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		34.83	■■■■□ 3.17
PPP4C-205	ENST00000563200	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		34.82	■■■■□ 3.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		34.82	■■■■□ 3.16
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.82	■■■■□ 3.16
PPP4C-205	ENST00000563200	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		34.81	■■■■□ 3.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		34.78	■■■■□ 3.16
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		34.78	■■■■□ 3.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		34.76	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TIAM1	Q13009	1591 aa		34.75	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	34.74	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	34.74	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	34.73	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA6	Q8N139	1617 aa		34.73	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		34.72	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RERE	Q9P2R6	1566 aa		34.72	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		34.71	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		34.71	■■■■□ 3.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		34.68	■■■■□ 3.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MLEC	Q14165	292 aa		34.66	■■■■□ 3.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		34.66	■■■■□ 3.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	34.65	■■■■□ 3.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		34.65	■■■■□ 3.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	34.63	■■■■□ 3.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NCOA2	Q15596	1464 aa		34.63	■■■■□ 3.13
PPP4C-205	ENST00000563200	AGL	P35573	1532 aa		34.59	■■■■□ 3.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	34.59	■■■■□ 3.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K1	Q13233	1512 aa		34.58	■■■■□ 3.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		34.58	■■■■□ 3.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	34.56	■■■■□ 3.12
PPP4C-205	ENST00000563200	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	34.55	■■■■□ 3.12
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD5	Q9P267	1494 aa		34.55	■■■■□ 3.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP7A	Q04656	1500 aa		34.53	■■■■□ 3.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		34.5	■■■■□ 3.11
PPP4C-205	ENST00000563200	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	34.47	■■■■□ 3.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		34.43	■■■■□ 3.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		34.43	■■■■□ 3.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PLXNC1	O60486	1568 aa		34.43	■■■■□ 3.1
PPP4C-205	ENST00000563200	A2M	P01023	1474 aa		34.39	■■■■□ 3.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		34.38	■■■■□ 3.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	34.38	■■■■□ 3.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		34.36	■■■■□ 3.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		34.36	■■■■□ 3.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		34.33	■■■■□ 3.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		34.33	■■■■□ 3.09
PPP4C-205	ENST00000563200	C3	P01024	1663 aa		34.32	■■■■□ 3.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		34.29	■■■■□ 3.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		34.29	■■■■□ 3.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	34.29	■■■■□ 3.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		34.29	■■■■□ 3.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MIA2	Q96PC5	1412 aa		34.27	■■■■□ 3.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA2	P54652	639 aa		34.26	■■■■□ 3.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	34.26	■■■■□ 3.07
PPP4C-205	ENST00000563200	APLP2	Q06481	763 aa		34.24	■■■■□ 3.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MROH2A	A6NES4	1674 aa		34.24	■■■■□ 3.07
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	34.23	■■■■□ 3.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	34.16	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPY4	P0CV99	314 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPY10	P0CW01	314 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYM3	Q14202	1370 aa		34.16	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	GGT6	Q6P531	493 aa		34.15	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		34.14	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		34.14	■■■■□ 3.06
PPP4C-205	ENST00000563200	NPAT	Q14207	1427 aa		34.1	■■■■□ 3.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		34.07	■■■■□ 3.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF3B	O15066	747 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRK	Q15262	1439 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	34.01	■■■■□ 3.04
PPP4C-205	ENST00000563200	STRC	Q7RTU9	1775 aa		34.01	■■■■□ 3.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC5	O15440	1437 aa		34	■■■■□ 3.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		34	■■■■□ 3.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03

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