RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562441.5

INO80E-205, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 1,412 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-205ENST00000562441 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.32■■■□□ 2.12
INO80E-205ENST00000562441 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
INO80E-205ENST00000562441 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.31■■■□□ 2.12
INO80E-205ENST00000562441 KDM6BO15054 1643 aa28.31■■■□□ 2.12
INO80E-205ENST00000562441 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.28■■■□□ 2.12
INO80E-205ENST00000562441 AKNAQ7Z591 1439 aa28.25■■■□□ 2.11
INO80E-205ENST00000562441 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.24■■■□□ 2.11
INO80E-205ENST00000562441 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.23■■■□□ 2.11
INO80E-205ENST00000562441 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.22■■■□□ 2.11
INO80E-205ENST00000562441 ABCC1P33527 1531 aa28.21■■■□□ 2.11
INO80E-205ENST00000562441 RICTORQ6R327 1708 aa28.2■■■□□ 2.1
INO80E-205ENST00000562441 ADGRL1O94910 1474 aa28.2■■■□□ 2.1
INO80E-205ENST00000562441 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.19■■■□□ 2.1
INO80E-205ENST00000562441 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.17■■■□□ 2.1
INO80E-205ENST00000562441 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.16■■■□□ 2.1
INO80E-205ENST00000562441 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
INO80E-205ENST00000562441 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.12■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.12■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.11■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.1■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 MIA2Q96PC5 1412 aa28.08■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 RAPGEF3O95398 923 aa28.08■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
INO80E-205ENST00000562441 KDM5CP41229 1560 aa28.06■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.06■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.06■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.05■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.05■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.05■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.05■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 MBD5Q9P267 1494 aa28.04■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.03■■■□□ 2.08
INO80E-205ENST00000562441 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
INO80E-205ENST00000562441 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.97■■■□□ 2.07
INO80E-205ENST00000562441 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
INO80E-205ENST00000562441 AFAP1Q8N556 730 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80E-205ENST00000562441 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80E-205ENST00000562441 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.9■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 ABCA6Q8N139 1617 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80E-205ENST00000562441 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
INO80E-205ENST00000562441 ATP7AQ04656 1500 aa27.87■■■□□ 2.05
INO80E-205ENST00000562441 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80E-205ENST00000562441 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80E-205ENST00000562441 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
INO80E-205ENST00000562441 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.83■■■□□ 2.05
INO80E-205ENST00000562441 ABCC5O15440 1437 aa27.82■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 DAPK1P53355 1430 aa27.81■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.79■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.79■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.78■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.77■■■□□ 2.04
INO80E-205ENST00000562441 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.76■■■□□ 2.03
INO80E-205ENST00000562441 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.033e-8■■■■■ 27.7
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INO80E-205ENST00000562441 ATP10AO60312 1499 aa27.75■■■□□ 2.03
INO80E-205ENST00000562441 PLXNC1O60486 1568 aa27.73■■■□□ 2.03
INO80E-205ENST00000562441 PTPRKQ15262 1439 aa27.72■■■□□ 2.03
INO80E-205ENST00000562441 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.69■■■□□ 2.02
INO80E-205ENST00000562441 TSPY4P0CV99 314 aa27.67■■■□□ 2.02
INO80E-205ENST00000562441 TSPY10P0CW01 314 aa27.67■■■□□ 2.02
INO80E-205ENST00000562441 ADGRL2O95490 1459 aa27.65■■■□□ 2.02
INO80E-205ENST00000562441 A2MP01023 1474 aa27.64■■■□□ 2.02
INO80E-205ENST00000562441 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.63■■■□□ 2.01
INO80E-205ENST00000562441 AGLP35573 1532 aa27.63■■■□□ 2.01
INO80E-205ENST00000562441 NCOA1Q15788 1441 aa27.59■■■□□ 2.01
INO80E-205ENST00000562441 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.58■■■□□ 2.01
INO80E-205ENST00000562441 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.56■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 KIF15Q9NS87 1388 aa27.56■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.56■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 ITGAEP38570 1179 aa27.55■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.54■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 ROCK1Q13464 1354 aa27.53■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
INO80E-205ENST00000562441 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.51■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 MADDQ8WXG6 1647 aa27.51■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 ERBINQ96RT1 1412 aa27.48■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.48■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.48■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.46■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.45■■□□□ 1.99
INO80E-205ENST00000562441 DEPDC5O75140 1603 aa27.44■■□□□ 1.98
INO80E-205ENST00000562441 MLECQ14165 292 aa27.43■■□□□ 1.98
INO80E-205ENST00000562441 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
INO80E-205ENST00000562441 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.4■■□□□ 1.98
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