RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 PREX2Q70Z35 1606 aa29.47■■■□□ 2.31
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GCSHP2-201ENST00000560971 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.45■■■□□ 2.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TIAM1Q13009 1591 aa29.45■■■□□ 2.31
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.44■■■□□ 2.3
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.44■■■□□ 2.3
GCSHP2-201ENST00000560971 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
GCSHP2-201ENST00000560971 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GCSHP2-201ENST00000560971 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.42■■■□□ 2.3
GCSHP2-201ENST00000560971 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.41■■■□□ 2.3
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
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GCSHP2-201ENST00000560971 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
GCSHP2-201ENST00000560971 AFAP1Q8N556 730 aa29.35■■■□□ 2.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.35■■■□□ 2.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.34■■■□□ 2.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC1P33527 1531 aa29.33■■■□□ 2.29
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K1Q13233 1512 aa29.33■■■□□ 2.29
GCSHP2-201ENST00000560971 NCOA2Q15596 1464 aa29.32■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.32■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.31■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.3■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.3■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.29■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.29■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.29■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 APLP2Q06481 763 aa29.27■■■□□ 2.28
GCSHP2-201ENST00000560971 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.26■■■□□ 2.27
GCSHP2-201ENST00000560971 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM5CP41229 1560 aa29.25■■■□□ 2.27
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
GCSHP2-201ENST00000560971 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
GCSHP2-201ENST00000560971 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.23■■■□□ 2.27
GCSHP2-201ENST00000560971 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.22■■■□□ 2.27
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.2■■■□□ 2.26
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.19■■■□□ 2.26
GCSHP2-201ENST00000560971 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.18■■■□□ 2.26
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP10AO60312 1499 aa29.17■■■□□ 2.26
GCSHP2-201ENST00000560971 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.17■■■□□ 2.26
GCSHP2-201ENST00000560971 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.15■■■□□ 2.26
GCSHP2-201ENST00000560971 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.11■■■□□ 2.25
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GCSHP2-201ENST00000560971 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.1■■■□□ 2.25
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GCSHP2-201ENST00000560971 MBD5Q9P267 1494 aa29.1■■■□□ 2.25
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCA6Q8N139 1617 aa29.09■■■□□ 2.25
GCSHP2-201ENST00000560971 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.09■■■□□ 2.25
GCSHP2-201ENST00000560971 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.08■■■□□ 2.25
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.07■■■□□ 2.24
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GCSHP2-201ENST00000560971 MIA2Q96PC5 1412 aa29■■■□□ 2.23
GCSHP2-201ENST00000560971 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
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GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.97■■■□□ 2.23
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GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.93■■■□□ 2.22
GCSHP2-201ENST00000560971 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.92■■■□□ 2.22
GCSHP2-201ENST00000560971 AGLP35573 1532 aa28.91■■■□□ 2.22
GCSHP2-201ENST00000560971 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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GCSHP2-201ENST00000560971 A2MP01023 1474 aa28.89■■■□□ 2.22
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPY4P0CV99 314 aa28.88■■■□□ 2.21
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPY10P0CW01 314 aa28.88■■■□□ 2.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.87■■■□□ 2.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.85■■■□□ 2.21
GCSHP2-201ENST00000560971 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.85■■■□□ 2.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PLXNC1O60486 1568 aa28.84■■■□□ 2.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.83■■■□□ 2.21
GCSHP2-201ENST00000560971 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
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GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC5O15440 1437 aa28.78■■■□□ 2.2
GCSHP2-201ENST00000560971 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.77■■■□□ 2.2
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GCSHP2-201ENST00000560971 GGT6Q6P531 493 aa28.74■■■□□ 2.19
GCSHP2-201ENST00000560971 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
GCSHP2-201ENST00000560971 DAPK1P53355 1430 aa28.73■■■□□ 2.19
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GCSHP2-201ENST00000560971 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.69■■■□□ 2.18
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GCSHP2-201ENST00000560971 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.67■■■□□ 2.18
GCSHP2-201ENST00000560971 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.66■■■□□ 2.18
GCSHP2-201ENST00000560971 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.65■■■□□ 2.18
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF15Q9NS87 1388 aa28.62■■■□□ 2.17
GCSHP2-201ENST00000560971 C3P01024 1663 aa28.61■■■□□ 2.17
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.6■■■□□ 2.17
GCSHP2-201ENST00000560971 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
GCSHP2-201ENST00000560971 ZMYM3Q14202 1370 aa28.6■■■□□ 2.17
GCSHP2-201ENST00000560971 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.59■■■□□ 2.17
GCSHP2-201ENST00000560971 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.59■■■□□ 2.17
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.57■■■□□ 2.16
GCSHP2-201ENST00000560971 MROH2AA6NES4 1674 aa28.56■■■□□ 2.16
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