RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 TIAM1Q13009 1591 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTA-207ENST00000558936 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.27■□□□□ 0.83
RABGGTA-207ENST00000558936 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-207ENST00000558936 ADGRL1O94910 1474 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-207ENST00000558936 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-207ENST00000558936 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTA-207ENST00000558936 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-207ENST00000558936 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-207ENST00000558936 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.23■□□□□ 0.83
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RABGGTA-207ENST00000558936 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTA-207ENST00000558936 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 MAP3K1Q13233 1512 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 AFAP1Q8N556 730 aa20.19■□□□□ 0.82
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RABGGTA-207ENST00000558936 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.13■□□□□ 0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.12■□□□□ 0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.09■□□□□ 0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.07■□□□□ 0.8
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RABGGTA-207ENST00000558936 A2MP01023 1474 aa19.85■□□□□ 0.77
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RABGGTA-207ENST00000558936 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.84■□□□□ 0.77
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RABGGTA-207ENST00000558936 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.82■□□□□ 0.76
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RABGGTA-207ENST00000558936 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.71■□□□□ 0.75
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RABGGTA-207ENST00000558936 MROH2AA6NES4 1674 aa19.68■□□□□ 0.74
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RABGGTA-207ENST00000558936 KIF3BO15066 747 aa19.66■□□□□ 0.74
RABGGTA-207ENST00000558936 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.66■□□□□ 0.74
RABGGTA-207ENST00000558936 NCOA1Q15788 1441 aa19.66■□□□□ 0.74
RABGGTA-207ENST00000558936 ZMYM3Q14202 1370 aa19.65■□□□□ 0.74
RABGGTA-207ENST00000558936 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.64■□□□□ 0.73
RABGGTA-207ENST00000558936 ADGRL2O95490 1459 aa19.64■□□□□ 0.73
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
RABGGTA-207ENST00000558936 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.63■□□□□ 0.73
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