RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 PLCH2O75038 1416 aa26.46■■□□□ 1.83
LGMN-216ENST00000557434 DIP2BQ9P265 1576 aa26.45■■□□□ 1.83
LGMN-216ENST00000557434 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
LGMN-216ENST00000557434 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.44■■□□□ 1.82
LGMN-216ENST00000557434 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.43■■□□□ 1.82
LGMN-216ENST00000557434 GLI2P10070 1586 aa26.42■■□□□ 1.82
LGMN-216ENST00000557434 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.41■■□□□ 1.82
LGMN-216ENST00000557434 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.41■■□□□ 1.82
LGMN-216ENST00000557434 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.4■■□□□ 1.82
LGMN-216ENST00000557434 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.39■■□□□ 1.81
LGMN-216ENST00000557434 PTPRKQ15262 1439 aa26.38■■□□□ 1.81
LGMN-216ENST00000557434 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
LGMN-216ENST00000557434 CD109Q6YHK3 1445 aa26.35■■□□□ 1.81
LGMN-216ENST00000557434 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
LGMN-216ENST00000557434 ITGAEP38570 1179 aa26.34■■□□□ 1.81
LGMN-216ENST00000557434 MBD5Q9P267 1494 aa26.32■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.31■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.31■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 FANCAO15360 1455 aa26.31■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 ABCC5O15440 1437 aa26.31■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.3■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 DAPK1P53355 1430 aa26.29■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 ABCC1P33527 1531 aa26.29■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.28■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.27■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.27■■□□□ 1.8
LGMN-216ENST00000557434 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
LGMN-216ENST00000557434 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.25■■□□□ 1.79
LGMN-216ENST00000557434 TSPOAP1O95153 1857 aa26.24■■□□□ 1.79
LGMN-216ENST00000557434 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.22■■□□□ 1.79
LGMN-216ENST00000557434 AKNAQ7Z591 1439 aa26.2■■□□□ 1.79
LGMN-216ENST00000557434 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.2■■□□□ 1.79
LGMN-216ENST00000557434 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.19■■□□□ 1.78
LGMN-216ENST00000557434 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.18■■□□□ 1.78
LGMN-216ENST00000557434 ADGRL1O94910 1474 aa26.18■■□□□ 1.78
LGMN-216ENST00000557434 NEO1Q92859 1461 aa26.17■■□□□ 1.78
LGMN-216ENST00000557434 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.17■■□□□ 1.78
LGMN-216ENST00000557434 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.16■■□□□ 1.78
LGMN-216ENST00000557434 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.14■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.14■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.13■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 ADGRL2O95490 1459 aa26.12■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 HFM1A2PYH4 1435 aa26.11■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.11■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 NAIPQ13075 1403 aa26.11■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 ROCK1Q13464 1354 aa26.1■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.1■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.09■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 AFAP1Q8N556 730 aa26.09■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 NCOA1Q15788 1441 aa26.09■■□□□ 1.77
LGMN-216ENST00000557434 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.07■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.07■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 KDM6BO15054 1643 aa26.06■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.06■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.06■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 RICTORQ6R327 1708 aa26.05■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.04■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 KDM5CP41229 1560 aa26.04■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.03■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 TSPY4P0CV99 314 aa26.03■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 TSPY10P0CW01 314 aa26.03■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.03■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.02■■□□□ 1.76
LGMN-216ENST00000557434 PLXNC1O60486 1568 aa26■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.99■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 RAPGEF3O95398 923 aa25.99■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 ATP7AQ04656 1500 aa25.97■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.97■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
LGMN-216ENST00000557434 KIF15Q9NS87 1388 aa25.95■■□□□ 1.74
LGMN-216ENST00000557434 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.93■■□□□ 1.74
LGMN-216ENST00000557434 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.92■■□□□ 1.74
LGMN-216ENST00000557434 HRCP23327 699 aa25.9■■□□□ 1.74
LGMN-216ENST00000557434 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.89■■□□□ 1.74
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.89■■□□□ 1.73
LGMN-216ENST00000557434 ABCA6Q8N139 1617 aa25.87■■□□□ 1.73
LGMN-216ENST00000557434 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.86■■□□□ 1.73
LGMN-216ENST00000557434 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.83■■□□□ 1.73
LGMN-216ENST00000557434 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.82■■□□□ 1.72
LGMN-216ENST00000557434 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
LGMN-216ENST00000557434 ERBINQ96RT1 1412 aa25.79■■□□□ 1.72
LGMN-216ENST00000557434 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.77■■□□□ 1.72
LGMN-216ENST00000557434 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.76■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 A2MP01023 1474 aa25.75■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 UNC13BO14795 1591 aa25.74■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 PZPP20742 1482 aa25.71■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.71■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 DEPDC5O75140 1603 aa25.71■■□□□ 1.71
LGMN-216ENST00000557434 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.7■■□□□ 1.7
LGMN-216ENST00000557434 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.7■■□□□ 1.7
LGMN-216ENST00000557434 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.69■■□□□ 1.7
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