RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-204ENST00000555690 KIF14Q15058 1648 aa39.99■■■■□ 3.99
PPP4R4-204ENST00000555690 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.99■■■■□ 3.99
PPP4R4-204ENST00000555690 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.98■■■■□ 3.99
PPP4R4-204ENST00000555690 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.96■■■■□ 3.99
PPP4R4-204ENST00000555690 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP4R4-204ENST00000555690 CLIP1P30622 1438 aa39.93■■■■□ 3.98
PPP4R4-204ENST00000555690 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.89■■■■□ 3.98
PPP4R4-204ENST00000555690 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
PPP4R4-204ENST00000555690 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.88■■■■□ 3.97
PPP4R4-204ENST00000555690 MLECQ14165 292 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP4R4-204ENST00000555690 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP4R4-204ENST00000555690 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
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PPP4R4-204ENST00000555690 ATP10AO60312 1499 aa39.81■■■■□ 3.96
PPP4R4-204ENST00000555690 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.81■■■■□ 3.96
PPP4R4-204ENST00000555690 AFAP1Q8N556 730 aa39.8■■■■□ 3.96
PPP4R4-204ENST00000555690 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP4R4-204ENST00000555690 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.75■■■■□ 3.95
PPP4R4-204ENST00000555690 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP4R4-204ENST00000555690 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.71■■■■□ 3.95
PPP4R4-204ENST00000555690 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4R4-204ENST00000555690 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.69■■■■□ 3.94
PPP4R4-204ENST00000555690 KDM5CP41229 1560 aa39.67■■■■□ 3.94
PPP4R4-204ENST00000555690 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4R4-204ENST00000555690 PREX2Q70Z35 1606 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4R4-204ENST00000555690 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.62■■■■□ 3.93
PPP4R4-204ENST00000555690 HSPA2P54652 639 aa39.62■■■■□ 3.93
PPP4R4-204ENST00000555690 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.59■■■■□ 3.93
PPP4R4-204ENST00000555690 ABCC1P33527 1531 aa39.57■■■■□ 3.93
PPP4R4-204ENST00000555690 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.56■■■■□ 3.92
PPP4R4-204ENST00000555690 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.55■■■■□ 3.92
PPP4R4-204ENST00000555690 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP4R4-204ENST00000555690 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
PPP4R4-204ENST00000555690 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
PPP4R4-204ENST00000555690 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.5■■■■□ 3.91
PPP4R4-204ENST00000555690 ABCA6Q8N139 1617 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP4R4-204ENST00000555690 REREQ9P2R6 1566 aa39.46■■■■□ 3.91
PPP4R4-204ENST00000555690 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
PPP4R4-204ENST00000555690 FBXO41Q8TF61 875 aa39.42■■■■□ 3.9
PPP4R4-204ENST00000555690 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.38■■■■□ 3.9
PPP4R4-204ENST00000555690 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.38■■■■□ 3.89
PPP4R4-204ENST00000555690 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.38■■■■□ 3.89
PPP4R4-204ENST00000555690 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.36■■■■□ 3.89
PPP4R4-204ENST00000555690 AGLP35573 1532 aa39.36■■■■□ 3.89
PPP4R4-204ENST00000555690 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
PPP4R4-204ENST00000555690 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.35■■■■□ 3.89
PPP4R4-204ENST00000555690 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.34■■■■□ 3.89
PPP4R4-204ENST00000555690 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
PPP4R4-204ENST00000555690 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
PPP4R4-204ENST00000555690 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.31■■■■□ 3.88
PPP4R4-204ENST00000555690 CEP162Q5TB80 1403 aa39.28■■■■□ 3.88
PPP4R4-204ENST00000555690 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.26■■■■□ 3.88
PPP4R4-204ENST00000555690 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4R4-204ENST00000555690 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.23■■■■□ 3.87
PPP4R4-204ENST00000555690 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
PPP4R4-204ENST00000555690 C3P01024 1663 aa39.2■■■■□ 3.87
PPP4R4-204ENST00000555690 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
PPP4R4-204ENST00000555690 ATP7AQ04656 1500 aa39.16■■■■□ 3.86
PPP4R4-204ENST00000555690 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.16■■■■□ 3.86
PPP4R4-204ENST00000555690 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.14■■■■□ 3.86
PPP4R4-204ENST00000555690 TIAM1Q13009 1591 aa39.14■■■■□ 3.86
PPP4R4-204ENST00000555690 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PPP4R4-204ENST00000555690 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
PPP4R4-204ENST00000555690 CERKQ8TCT0 537 aa39.09■■■■□ 3.85
PPP4R4-204ENST00000555690 A2MP01023 1474 aa39.07■■■■□ 3.85
PPP4R4-204ENST00000555690 STRCQ7RTU9 1775 aa39.06■■■■□ 3.84
PPP4R4-204ENST00000555690 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.06■■■■□ 3.84
PPP4R4-204ENST00000555690 MBD5Q9P267 1494 aa39.04■■■■□ 3.84
PPP4R4-204ENST00000555690 ZMYM3Q14202 1370 aa39.03■■■■□ 3.84
PPP4R4-204ENST00000555690 PLXNC1O60486 1568 aa39.03■■■■□ 3.84
PPP4R4-204ENST00000555690 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.02■■■■□ 3.84
PPP4R4-204ENST00000555690 GGT6Q6P531 493 aa39■■■■□ 3.83
PPP4R4-204ENST00000555690 MROH2AA6NES4 1674 aa38.97■■■■□ 3.83
PPP4R4-204ENST00000555690 NCOA2Q15596 1464 aa38.97■■■■□ 3.83
PPP4R4-204ENST00000555690 NPATQ14207 1427 aa38.96■■■■□ 3.83
PPP4R4-204ENST00000555690 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.92■■■■□ 3.82
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PPP4R4-204ENST00000555690 PTPRTO14522 1441 aa38.88■■■■□ 3.81
PPP4R4-204ENST00000555690 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.87■■■■□ 3.81
PPP4R4-204ENST00000555690 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.86■■■■□ 3.81
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PPP4R4-204ENST00000555690 NCOA1Q15788 1441 aa38.84■■■■□ 3.81
PPP4R4-204ENST00000555690 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.84■■■■□ 3.81
PPP4R4-204ENST00000555690 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.82■■■■□ 3.8
PPP4R4-204ENST00000555690 PTPRKQ15262 1439 aa38.81■■■■□ 3.8
PPP4R4-204ENST00000555690 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.78■■■■□ 3.8
PPP4R4-204ENST00000555690 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.78■■■■□ 3.8
PPP4R4-204ENST00000555690 KIF3BO15066 747 aa38.76■■■■□ 3.8
PPP4R4-204ENST00000555690 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.72■■■■□ 3.79
PPP4R4-204ENST00000555690 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
PPP4R4-204ENST00000555690 TSPY4P0CV99 314 aa38.71■■■■□ 3.79
PPP4R4-204ENST00000555690 TSPY10P0CW01 314 aa38.71■■■■□ 3.79
PPP4R4-204ENST00000555690 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.71■■■■□ 3.79
PPP4R4-204ENST00000555690 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.67■■■■□ 3.78
PPP4R4-204ENST00000555690 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
PPP4R4-204ENST00000555690 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
PPP4R4-204ENST00000555690 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.63■■■■□ 3.78
PPP4R4-204ENST00000555690 MAP3K1Q13233 1512 aa38.62■■■■□ 3.77
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