RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 IFFO2Q5TF58 517 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 PTPRKQ15262 1439 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 PKD2Q13563 968 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-225ENST00000551253 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 ABCA8O94911 1581 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 CPS1P31327 1500 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 ATP10AO60312 1499 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 ALKQ9UM73 1620 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 C3P01024 1663 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-225ENST00000551253 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 PLA2R1Q13018 1463 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 HECW1Q76N89 1606 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 KIF27Q86VH2 1401 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 ATP10BO94823 1461 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 ARID3CA6NKF2 412 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-225ENST00000551253 CFAP74Q9C0B2 1584 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-225ENST00000551253 NPATQ14207 1427 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-225ENST00000551253 FOXD1Q16676 465 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-225ENST00000551253 TRIM52Q96A61 297 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-225ENST00000551253 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-225ENST00000551253 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-225ENST00000551253 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-225ENST00000551253 GOLGA3Q08378 1498 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-225ENST00000551253 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-225ENST00000551253 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-225ENST00000551253 AGLP35573 1532 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-225ENST00000551253 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-225ENST00000551253 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-225ENST00000551253 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-225ENST00000551253 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 ZMYM3Q14202 1370 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 RXRBP28702 533 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 REREQ9P2R6 1566 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-225ENST00000551253 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP12.58□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 MROH2AA6NES4 1674 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 AFAP1Q8N556 730 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 PLCH2O75038 1416 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
CS-225ENST00000551253 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 JCADQ9P266 1359 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 SYNMO15061 1565 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 YY1P25490 414 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 KDM5CP41229 1560 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 MED14O60244 1454 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 P3H3Q8IVL6 736 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 ABCA6Q8N139 1617 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 LRP5O75197 1615 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-225ENST00000551253 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 LRP6O75581 1613 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 DEPDC5O75140 1603 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 RGS12O14924 1447 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 CCDC125Q86Z20 511 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
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