RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.74■□□□□ 0.91
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USP15-217ENST00000551206 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.69■□□□□ 0.9
USP15-217ENST00000551206 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.68■□□□□ 0.9
USP15-217ENST00000551206 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.67■□□□□ 0.9
USP15-217ENST00000551206 ADGRL1O94910 1474 aa20.66■□□□□ 0.9
USP15-217ENST00000551206 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.66■□□□□ 0.9
USP15-217ENST00000551206 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.65■□□□□ 0.9
USP15-217ENST00000551206 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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USP15-217ENST00000551206 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
USP15-217ENST00000551206 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
USP15-217ENST00000551206 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.6■□□□□ 0.89
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USP15-217ENST00000551206 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
USP15-217ENST00000551206 RICTORQ6R327 1708 aa20.57■□□□□ 0.88
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USP15-217ENST00000551206 PREX2Q70Z35 1606 aa20.54■□□□□ 0.88
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USP15-217ENST00000551206 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.53■□□□□ 0.88
USP15-217ENST00000551206 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.53■□□□□ 0.88
USP15-217ENST00000551206 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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USP15-217ENST00000551206 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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USP15-217ENST00000551206 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.5■□□□□ 0.87
USP15-217ENST00000551206 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.5■□□□□ 0.87
USP15-217ENST00000551206 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.5■□□□□ 0.87
USP15-217ENST00000551206 MLECQ14165 292 aa20.47■□□□□ 0.87
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USP15-217ENST00000551206 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.47■□□□□ 0.87
USP15-217ENST00000551206 ABCC1P33527 1531 aa20.47■□□□□ 0.87
USP15-217ENST00000551206 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.47■□□□□ 0.87
USP15-217ENST00000551206 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.45■□□□□ 0.86
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USP15-217ENST00000551206 MAP3K1Q13233 1512 aa20.43■□□□□ 0.86
USP15-217ENST00000551206 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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USP15-217ENST00000551206 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.39■□□□□ 0.85
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USP15-217ENST00000551206 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.35■□□□□ 0.85
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USP15-217ENST00000551206 PTPRMP28827 1452 aa20.32■□□□□ 0.84
USP15-217ENST00000551206 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.31■□□□□ 0.84
USP15-217ENST00000551206 ABCA6Q8N139 1617 aa20.31■□□□□ 0.84
USP15-217ENST00000551206 MADDQ8WXG6 1647 aa20.31■□□□□ 0.84
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USP15-217ENST00000551206 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.3■□□□□ 0.84
USP15-217ENST00000551206 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.28■□□□□ 0.84
USP15-217ENST00000551206 TSPY4P0CV99 314 aa20.28■□□□□ 0.84
USP15-217ENST00000551206 TSPY10P0CW01 314 aa20.28■□□□□ 0.84
USP15-217ENST00000551206 ATP7AQ04656 1500 aa20.27■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 MIA2Q96PC5 1412 aa20.25■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.24■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 REREQ9P2R6 1566 aa20.22■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 A2MP01023 1474 aa20.22■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.21■□□□□ 0.83
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USP15-217ENST00000551206 AGLP35573 1532 aa20.21■□□□□ 0.83
USP15-217ENST00000551206 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.18■□□□□ 0.82
USP15-217ENST00000551206 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP15-217ENST00000551206 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.17■□□□□ 0.82
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USP15-217ENST00000551206 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.16■□□□□ 0.82
USP15-217ENST00000551206 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.13■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.11■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.11■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 PLXNC1O60486 1568 aa20.11■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 ABCC5O15440 1437 aa20.1■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.1■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 HSPA2P54652 639 aa20.09■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 ZMYM3Q14202 1370 aa20.08■□□□□ 0.81
USP15-217ENST00000551206 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.08■□□□□ 0.8
USP15-217ENST00000551206 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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