RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 HFM1A2PYH4 1435 aa7.07□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.07□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 UACAQ9BZF9 1416 aa7.07□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 SAMD9Q5K651 1589 aa7.07□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.06□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 GRIN2BQ13224 1484 aa7.05□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 IFT140Q96RY7 1462 aa7.05□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.05□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.04□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.04□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 POTEMA6NI47 508 aa7.04□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 ITGAEP38570 1179 aa7.04□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 TONSLQ96HA7 1378 aa7.04□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 HECW1Q76N89 1606 aa7.03□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 ANP32CO43423 234 aa7.03□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 P3H3Q8IVL6 736 aa7.03□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
AC024909.1-201ENST00000549278 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.02□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.02□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 NESP48681 1621 aa7.02□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 ROCK1Q13464 1354 aa7.02□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 NCOA2Q15596 1464 aa7.02□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 IQGAP2Q13576 1575 aa7.02□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 MAPKBP1O60336 1514 aa7.01□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 ARHGEF11O15085 1522 aa7.01□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 CD44P16070 742 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 DCBLD2Q96PD2 775 aa7□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 CLCN6P51797 869 aa6.99□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.99□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 POTEGQ6S5H5 508 aa6.99□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 OTUD5Q96G74 571 aa6.99□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 NAIPQ13075 1403 aa6.99□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.99□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 FBLN2P98095 1184 aa6.98□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.98□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.98□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 NEFLP07196 543 aa6.97□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 ADAMTS12P58397 1594 aa6.96□□□□□ -1.29
AC024909.1-201ENST00000549278 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 PBRM1Q86U86 1689 aa6.96□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 WDR62O43379 1518 aa6.96□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 PRR29P0C7W0 189 aa6.95□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.95□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 TRIM52Q96A61 297 aa6.94□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.94□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.94□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.93□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.93□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.93□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 GRIN2AQ12879 1464 aa6.92□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 SYNJ2O15056 1496 aa6.92□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 POTEB2H3BUK9 544 aa6.91□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.91□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 TSPY4P0CV99 314 aa6.9□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 TSPY10P0CW01 314 aa6.9□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 JPH4Q96JJ6 628 aa6.9□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC024909.1-201ENST00000549278 DAPK1P53355 1430 aa6.9□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 PTPRKQ15262 1439 aa6.9□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 KIAA0556O60303 1618 aa6.9□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 STAC3Q96MF2 364 aa6.89□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ADGRL2O95490 1459 aa6.89□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.89□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.89□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 DISP1Q96F81 1524 aa6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ERCC6Q03468 1493 aa6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 NUP160Q12769 1436 aa6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 SLC24A1O60721 1099 aa6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ABCC5O15440 1437 aa6.87□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.86□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 NCOA1Q15788 1441 aa6.86□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.86□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.85□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.85□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.85□□□□□ -1.31
AC024909.1-201ENST00000549278 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms