RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa12.52□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 MIA2Q96PC5 1412 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 CD109Q6YHK3 1445 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 ARAP3Q8WWN8 1544 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 FANCAO15360 1455 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-216ENST00000549221 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa12.46□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.45□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 ABCC1P33527 1531 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 PTPRKQ15262 1439 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 TSPOAP1O95153 1857 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 MBD5Q9P267 1494 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 ITGAEP38570 1179 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 ABCC5O15440 1437 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 AKNAQ7Z591 1439 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 NEO1Q92859 1461 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.41□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 DAPK1P53355 1430 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 ADGRL1O94910 1474 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 CFAP74Q9C0B2 1584 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-216ENST00000549221 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.4□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 FBXO41Q8TF61 875 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 KDM6BO15054 1643 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 TEX14Q8IWB6 1497 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 POGZQ7Z3K3 1410 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 AFAP1Q8N556 730 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 KDM5CP41229 1560 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 RICTORQ6R327 1708 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-216ENST00000549221 RAPGEF3O95398 923 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ADGRL2O95490 1459 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 SOCS7O14512 581 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ROCK1Q13464 1354 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 NAIPQ13075 1403 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 NCOA1Q15788 1441 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ATP7AQ04656 1500 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 HFM1A2PYH4 1435 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 PLXNC1O60486 1568 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 TSPY4P0CV99 314 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 TSPY10P0CW01 314 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-216ENST00000549221 ILDR2Q71H61 639 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 KIF15Q9NS87 1388 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 ABCA6Q8N139 1617 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-216ENST00000549221 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa12.21□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.21□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 A2MP01023 1474 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 ERBINQ96RT1 1412 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 ATP10AO60312 1499 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.15□□□□□ -0.46
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