RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.77■■■■□ 3.32
CCDC189-211ENST00000545825 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.75■■■■□ 3.31
CCDC189-211ENST00000545825 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.74■■■■□ 3.31
CCDC189-211ENST00000545825 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.73■■■■□ 3.31
CCDC189-211ENST00000545825 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.71■■■■□ 3.31
CCDC189-211ENST00000545825 TIAM1Q13009 1591 aa35.71■■■■□ 3.31
CCDC189-211ENST00000545825 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.7■■■■□ 3.31
CCDC189-211ENST00000545825 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CCDC189-211ENST00000545825 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.67■■■■□ 3.3
CCDC189-211ENST00000545825 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CCDC189-211ENST00000545825 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.63■■■■□ 3.29
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.61■■■■□ 3.29
CCDC189-211ENST00000545825 ABCC1P33527 1531 aa35.6■■■■□ 3.29
CCDC189-211ENST00000545825 MAP3K1Q13233 1512 aa35.6■■■■□ 3.29
CCDC189-211ENST00000545825 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.58■■■■□ 3.29
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.57■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.57■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.56■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.55■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.55■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.55■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 AFAP1Q8N556 730 aa35.54■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 NCOA2Q15596 1464 aa35.54■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 KDM5CP41229 1560 aa35.53■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.52■■■■□ 3.28
CCDC189-211ENST00000545825 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.5■■■■□ 3.27
CCDC189-211ENST00000545825 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
CCDC189-211ENST00000545825 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.45■■■■□ 3.27
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.43■■■■□ 3.26
CCDC189-211ENST00000545825 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.42■■■■□ 3.26
CCDC189-211ENST00000545825 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.42■■■■□ 3.26
CCDC189-211ENST00000545825 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.41■■■■□ 3.26
CCDC189-211ENST00000545825 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.26
CCDC189-211ENST00000545825 APLP2Q06481 763 aa35.39■■■■□ 3.26
CCDC189-211ENST00000545825 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 ATP10AO60312 1499 aa35.38■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.37■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.34■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.34■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.33■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.33■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.33■■■■□ 3.25
CCDC189-211ENST00000545825 ABCA6Q8N139 1617 aa35.31■■■■□ 3.24
CCDC189-211ENST00000545825 MBD5Q9P267 1494 aa35.29■■■■□ 3.24
CCDC189-211ENST00000545825 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.29■■■■□ 3.24
CCDC189-211ENST00000545825 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.27■■■■□ 3.24
CCDC189-211ENST00000545825 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
CCDC189-211ENST00000545825 REREQ9P2R6 1566 aa35.25■■■■□ 3.23
CCDC189-211ENST00000545825 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.23■■■■□ 3.23
CCDC189-211ENST00000545825 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
CCDC189-211ENST00000545825 MADDQ8WXG6 1647 aa35.21■■■■□ 3.23
CCDC189-211ENST00000545825 ATP7AQ04656 1500 aa35.21■■■■□ 3.23
CCDC189-211ENST00000545825 MIA2Q96PC5 1412 aa35.17■■■■□ 3.22
CCDC189-211ENST00000545825 PTPRMP28827 1452 aa35.16■■■■□ 3.22
CCDC189-211ENST00000545825 MLECQ14165 292 aa35.15■■■■□ 3.22
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.15■■■■□ 3.22
CCDC189-211ENST00000545825 AGLP35573 1532 aa35.12■■■■□ 3.21
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.12■■■■□ 3.21
CCDC189-211ENST00000545825 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.11■■■■□ 3.21
CCDC189-211ENST00000545825 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.09■■■■□ 3.21
CCDC189-211ENST00000545825 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CCDC189-211ENST00000545825 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.04■■■■□ 3.2
CCDC189-211ENST00000545825 PLXNC1O60486 1568 aa35.04■■■■□ 3.2
CCDC189-211ENST00000545825 A2MP01023 1474 aa35.03■■■■□ 3.2
CCDC189-211ENST00000545825 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.01■■■■□ 3.2
CCDC189-211ENST00000545825 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35■■■■□ 3.19
CCDC189-211ENST00000545825 ADGBQ8N7X0 1667 aa35■■■■□ 3.19
CCDC189-211ENST00000545825 TSPY4P0CV99 314 aa34.96■■■■□ 3.19
CCDC189-211ENST00000545825 TSPY10P0CW01 314 aa34.96■■■■□ 3.19
CCDC189-211ENST00000545825 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
CCDC189-211ENST00000545825 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.93■■■■□ 3.18
CCDC189-211ENST00000545825 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
CCDC189-211ENST00000545825 ABCC5O15440 1437 aa34.87■■■■□ 3.17
CCDC189-211ENST00000545825 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.86■■■■□ 3.17
CCDC189-211ENST00000545825 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
CCDC189-211ENST00000545825 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.83■■■■□ 3.17
CCDC189-211ENST00000545825 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.82■■■■□ 3.17
CCDC189-211ENST00000545825 DAPK1P53355 1430 aa34.82■■■■□ 3.17
CCDC189-211ENST00000545825 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CCDC189-211ENST00000545825 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CCDC189-211ENST00000545825 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CCDC189-211ENST00000545825 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.8■■■■□ 3.16
CCDC189-211ENST00000545825 GGT6Q6P531 493 aa34.78■■■■□ 3.16
CCDC189-211ENST00000545825 KIF3BO15066 747 aa34.75■■■■□ 3.15
CCDC189-211ENST00000545825 C3P01024 1663 aa34.74■■■■□ 3.15
CCDC189-211ENST00000545825 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CCDC189-211ENST00000545825 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.72■■■■□ 3.15
CCDC189-211ENST00000545825 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.72■■■■□ 3.15
CCDC189-211ENST00000545825 MROH2AA6NES4 1674 aa34.71■■■■□ 3.15
CCDC189-211ENST00000545825 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.14
CCDC189-211ENST00000545825 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.68■■■■□ 3.14
CCDC189-211ENST00000545825 ZMYM3Q14202 1370 aa34.67■■■■□ 3.14
CCDC189-211ENST00000545825 KIF15Q9NS87 1388 aa34.67■■■■□ 3.14
CCDC189-211ENST00000545825 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CCDC189-211ENST00000545825 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.64■■■■□ 3.14
CCDC189-211ENST00000545825 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.64■■■■□ 3.14
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