RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542156.5

MTMR1-214, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MTMR1, Length 1,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-214ENST00000542156 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.46■■■■■ 4.39
MTMR1-214ENST00000542156 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
MTMR1-214ENST00000542156 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.45■■■■■ 4.39
MTMR1-214ENST00000542156 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
MTMR1-214ENST00000542156 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
MTMR1-214ENST00000542156 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.39■■■■■ 4.38
MTMR1-214ENST00000542156 CLIP1P30622 1438 aa42.37■■■■■ 4.37
MTMR1-214ENST00000542156 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.36■■■■■ 4.37
MTMR1-214ENST00000542156 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.35■■■■■ 4.37
MTMR1-214ENST00000542156 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.32■■■■■ 4.37
MTMR1-214ENST00000542156 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
MTMR1-214ENST00000542156 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.29■■■■■ 4.36
MTMR1-214ENST00000542156 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.25■■■■■ 4.35
MTMR1-214ENST00000542156 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.2■■■■■ 4.35
MTMR1-214ENST00000542156 ATP10AO60312 1499 aa42.19■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.19■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 MLECQ14165 292 aa42.19■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 PREX2Q70Z35 1606 aa42.19■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 KDM5CP41229 1560 aa42.18■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.17■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.16■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.16■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.15■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 AFAP1Q8N556 730 aa42.14■■■■■ 4.34
MTMR1-214ENST00000542156 ABCC1P33527 1531 aa42.08■■■■■ 4.33
MTMR1-214ENST00000542156 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.08■■■■■ 4.33
MTMR1-214ENST00000542156 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.07■■■■■ 4.33
MTMR1-214ENST00000542156 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.05■■■■■ 4.32
MTMR1-214ENST00000542156 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.04■■■■■ 4.32
MTMR1-214ENST00000542156 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.02■■■■■ 4.32
MTMR1-214ENST00000542156 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.01■■■■■ 4.32
MTMR1-214ENST00000542156 ABCA6Q8N139 1617 aa42.01■■■■■ 4.32
MTMR1-214ENST00000542156 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.97■■■■■ 4.31
MTMR1-214ENST00000542156 HSPA2P54652 639 aa41.94■■■■■ 4.3
MTMR1-214ENST00000542156 REREQ9P2R6 1566 aa41.93■■■■■ 4.3
MTMR1-214ENST00000542156 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.89■■■■■ 4.3
MTMR1-214ENST00000542156 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
MTMR1-214ENST00000542156 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.86■■■■■ 4.29
MTMR1-214ENST00000542156 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
MTMR1-214ENST00000542156 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
MTMR1-214ENST00000542156 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.83■■■■■ 4.29
MTMR1-214ENST00000542156 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.78■■■■■ 4.28
MTMR1-214ENST00000542156 AGLP35573 1532 aa41.78■■■■■ 4.28
MTMR1-214ENST00000542156 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.76■■■■■ 4.27
MTMR1-214ENST00000542156 CEP162Q5TB80 1403 aa41.75■■■■■ 4.27
MTMR1-214ENST00000542156 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.27
MTMR1-214ENST00000542156 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.72■■■■■ 4.27
MTMR1-214ENST00000542156 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
MTMR1-214ENST00000542156 C3P01024 1663 aa41.68■■■■■ 4.26
MTMR1-214ENST00000542156 FBXO41Q8TF61 875 aa41.66■■■■■ 4.26
MTMR1-214ENST00000542156 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.65■■■■■ 4.26
MTMR1-214ENST00000542156 TIAM1Q13009 1591 aa41.65■■■■■ 4.26
MTMR1-214ENST00000542156 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
MTMR1-214ENST00000542156 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.63■■■■■ 4.26
MTMR1-214ENST00000542156 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.63■■■■■ 4.25
MTMR1-214ENST00000542156 ATP7AQ04656 1500 aa41.62■■■■■ 4.25
MTMR1-214ENST00000542156 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
MTMR1-214ENST00000542156 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
MTMR1-214ENST00000542156 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
MTMR1-214ENST00000542156 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.57■■■■■ 4.25
MTMR1-214ENST00000542156 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
MTMR1-214ENST00000542156 PLXNC1O60486 1568 aa41.51■■■■■ 4.24
MTMR1-214ENST00000542156 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
MTMR1-214ENST00000542156 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.5■■■■■ 4.23
MTMR1-214ENST00000542156 STRCQ7RTU9 1775 aa41.49■■■■■ 4.23
MTMR1-214ENST00000542156 A2MP01023 1474 aa41.47■■■■■ 4.23
MTMR1-214ENST00000542156 MBD5Q9P267 1494 aa41.44■■■■■ 4.22
MTMR1-214ENST00000542156 MROH2AA6NES4 1674 aa41.44■■■■■ 4.22
MTMR1-214ENST00000542156 NCOA2Q15596 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
MTMR1-214ENST00000542156 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.39■■■■■ 4.22
MTMR1-214ENST00000542156 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.39■■■■■ 4.22
MTMR1-214ENST00000542156 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
MTMR1-214ENST00000542156 ZMYM3Q14202 1370 aa41.34■■■■■ 4.21
MTMR1-214ENST00000542156 CERKQ8TCT0 537 aa41.33■■■■■ 4.21
MTMR1-214ENST00000542156 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.31■■■■■ 4.2
MTMR1-214ENST00000542156 NPATQ14207 1427 aa41.29■■■■■ 4.2
MTMR1-214ENST00000542156 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.29■■■■■ 4.2
MTMR1-214ENST00000542156 GGT6Q6P531 493 aa41.29■■■■■ 4.2
MTMR1-214ENST00000542156 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.28■■■■■ 4.2
MTMR1-214ENST00000542156 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.27■■■■■ 4.2
MTMR1-214ENST00000542156 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.24■■■■■ 4.19
MTMR1-214ENST00000542156 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.21■■■■■ 4.19
MTMR1-214ENST00000542156 NCOA1Q15788 1441 aa41.19■■■■■ 4.18
MTMR1-214ENST00000542156 PTPRTO14522 1441 aa41.18■■■■■ 4.18
MTMR1-214ENST00000542156 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.18■■■■■ 4.18
MTMR1-214ENST00000542156 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
MTMR1-214ENST00000542156 PTPRKQ15262 1439 aa41.17■■■■■ 4.18
MTMR1-214ENST00000542156 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.16■■■■■ 4.18
MTMR1-214ENST00000542156 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
MTMR1-214ENST00000542156 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.12■■■■■ 4.17
MTMR1-214ENST00000542156 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.09■■■■■ 4.17
MTMR1-214ENST00000542156 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
MTMR1-214ENST00000542156 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.07■■■■■ 4.17
MTMR1-214ENST00000542156 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
MTMR1-214ENST00000542156 KIF3BO15066 747 aa41.05■■■■■ 4.16
MTMR1-214ENST00000542156 MAP3K1Q13233 1512 aa41.03■■■■■ 4.16
MTMR1-214ENST00000542156 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41■■■■■ 4.15
MTMR1-214ENST00000542156 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.99■■■■■ 4.15
MTMR1-214ENST00000542156 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.98■■■■■ 4.15
MTMR1-214ENST00000542156 TSPY4P0CV99 314 aa40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms