RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541102.1

LTBR-209, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LTBR, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-209ENST00000541102 RICTORQ6R327 1708 aa22.69■■□□□ 1.22
LTBR-209ENST00000541102 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.65■■□□□ 1.22
LTBR-209ENST00000541102 AFAP1Q8N556 730 aa22.63■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.63■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.59■■□□□ 1.21
LTBR-209ENST00000541102 PREX2Q70Z35 1606 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.55■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.54■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.54■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 MLECQ14165 292 aa22.54■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-209ENST00000541102 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 ATP10AO60312 1499 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 ABCC1P33527 1531 aa22.5■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.48■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.47■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 PTPRMP28827 1452 aa22.47■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 KDM5CP41229 1560 aa22.46■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.46■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 MADDQ8WXG6 1647 aa22.46■■□□□ 1.19
LTBR-209ENST00000541102 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.45■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.45■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.45■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.43■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.43■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 TIAM1Q13009 1591 aa22.42■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.41■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 NCOA2Q15596 1464 aa22.4■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.4■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.39■■□□□ 1.18
LTBR-209ENST00000541102 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.39■■□□□ 1.17
LTBR-209ENST00000541102 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LTBR-209ENST00000541102 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LTBR-209ENST00000541102 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-209ENST00000541102 ABCA6Q8N139 1617 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-209ENST00000541102 APLP2Q06481 763 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-209ENST00000541102 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.35■■□□□ 1.17
LTBR-209ENST00000541102 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.3■■□□□ 1.16
LTBR-209ENST00000541102 MAP3K1Q13233 1512 aa22.3■■□□□ 1.16
LTBR-209ENST00000541102 REREQ9P2R6 1566 aa22.29■■□□□ 1.16
LTBR-209ENST00000541102 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LTBR-209ENST00000541102 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LTBR-209ENST00000541102 MBD5Q9P267 1494 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-209ENST00000541102 ATP7AQ04656 1500 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-209ENST00000541102 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.26■■□□□ 1.15
LTBR-209ENST00000541102 AGLP35573 1532 aa22.26■■□□□ 1.15
LTBR-209ENST00000541102 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.23■■□□□ 1.15
LTBR-209ENST00000541102 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LTBR-209ENST00000541102 A2MP01023 1474 aa22.22■■□□□ 1.15
LTBR-209ENST00000541102 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.2■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 TSPY4P0CV99 314 aa22.19■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 TSPY10P0CW01 314 aa22.19■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 HSPA2P54652 639 aa22.19■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 GGT6Q6P531 493 aa22.19■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.18■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.18■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.18■■□□□ 1.14
LTBR-209ENST00000541102 MIA2Q96PC5 1412 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.13■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.13■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 PLXNC1O60486 1568 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 KIF3BO15066 747 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 ZMYM3Q14202 1370 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 C3P01024 1663 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-209ENST00000541102 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LTBR-209ENST00000541102 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LTBR-209ENST00000541102 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-209ENST00000541102 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-209ENST00000541102 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-209ENST00000541102 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LTBR-209ENST00000541102 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.02■■□□□ 1.12
LTBR-209ENST00000541102 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.02■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.99■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 ABCC5O15440 1437 aa21.99■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 MROH2AA6NES4 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.98■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.97■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.97■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 NPATQ14207 1427 aa21.97■■□□□ 1.11
LTBR-209ENST00000541102 PTPRKQ15262 1439 aa21.95■■□□□ 1.1
LTBR-209ENST00000541102 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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