RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540011.2

EPHA10-211, Transcript of EPH receptor A10, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHA10, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA10-211ENST00000540011 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
EPHA10-211ENST00000540011 PREX2Q70Z35 1606 aa36.26■■■■□ 3.39
EPHA10-211ENST00000540011 NCOA2Q15596 1464 aa36.24■■■■□ 3.39
EPHA10-211ENST00000540011 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.21■■■■□ 3.39
EPHA10-211ENST00000540011 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
EPHA10-211ENST00000540011 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
EPHA10-211ENST00000540011 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.19■■■■□ 3.38
EPHA10-211ENST00000540011 ADGRL1O94910 1474 aa36.18■■■■□ 3.38
EPHA10-211ENST00000540011 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
EPHA10-211ENST00000540011 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.17■■■■□ 3.38
EPHA10-211ENST00000540011 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
EPHA10-211ENST00000540011 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
EPHA10-211ENST00000540011 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.13■■■■□ 3.37
EPHA10-211ENST00000540011 RAPGEF3O95398 923 aa36.1■■■■□ 3.37
EPHA10-211ENST00000540011 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.05■■■■□ 3.36
EPHA10-211ENST00000540011 ABCC1P33527 1531 aa36.01■■■■□ 3.36
EPHA10-211ENST00000540011 POGZQ7Z3K3 1410 aa36■■■■□ 3.35
EPHA10-211ENST00000540011 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36■■■■□ 3.35
EPHA10-211ENST00000540011 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.99■■■■□ 3.35
EPHA10-211ENST00000540011 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.99■■■■□ 3.35
EPHA10-211ENST00000540011 RICTORQ6R327 1708 aa35.97■■■■□ 3.35
EPHA10-211ENST00000540011 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.95■■■■□ 3.35
EPHA10-211ENST00000540011 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.95■■■■□ 3.35
EPHA10-211ENST00000540011 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.94■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 MIA2Q96PC5 1412 aa35.93■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 AFAP1Q8N556 730 aa35.91■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.89■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.89■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
EPHA10-211ENST00000540011 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.88■■■■□ 3.33
EPHA10-211ENST00000540011 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.88■■■■□ 3.33
EPHA10-211ENST00000540011 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.86■■■■□ 3.33
EPHA10-211ENST00000540011 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.83■■■■□ 3.33
EPHA10-211ENST00000540011 KDM5CP41229 1560 aa35.82■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.82■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.81■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.78■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.77■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 MBD5Q9P267 1494 aa35.76■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.76■■■■□ 3.32
EPHA10-211ENST00000540011 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.75■■■■□ 3.31
EPHA10-211ENST00000540011 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.74■■■■□ 3.31
EPHA10-211ENST00000540011 TSPY4P0CV99 314 aa35.72■■■■□ 3.31
EPHA10-211ENST00000540011 TSPY10P0CW01 314 aa35.72■■■■□ 3.31
EPHA10-211ENST00000540011 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.72■■■■□ 3.31
EPHA10-211ENST00000540011 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.71■■■■□ 3.31
EPHA10-211ENST00000540011 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
EPHA10-211ENST00000540011 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
EPHA10-211ENST00000540011 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
EPHA10-211ENST00000540011 ATP10AO60312 1499 aa35.67■■■■□ 3.3
EPHA10-211ENST00000540011 ATP7AQ04656 1500 aa35.64■■■■□ 3.3
EPHA10-211ENST00000540011 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.63■■■■□ 3.29
EPHA10-211ENST00000540011 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.61■■■■□ 3.29
EPHA10-211ENST00000540011 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.61■■■■□ 3.29
EPHA10-211ENST00000540011 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
EPHA10-211ENST00000540011 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.59■■■■□ 3.29
EPHA10-211ENST00000540011 ABCA6Q8N139 1617 aa35.58■■■■□ 3.29
EPHA10-211ENST00000540011 DAPK1P53355 1430 aa35.52■■■■□ 3.28
EPHA10-211ENST00000540011 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
EPHA10-211ENST00000540011 REREQ9P2R6 1566 aa35.51■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 ABCC5O15440 1437 aa35.5■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.5■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.48■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 A2MP01023 1474 aa35.47■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.46■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.46■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.46■■■■□ 3.27
EPHA10-211ENST00000540011 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
EPHA10-211ENST00000540011 MLECQ14165 292 aa35.41■■■■□ 3.26
EPHA10-211ENST00000540011 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.4■■■■□ 3.26
EPHA10-211ENST00000540011 AGLP35573 1532 aa35.4■■■■□ 3.26
EPHA10-211ENST00000540011 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.26
EPHA10-211ENST00000540011 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.38■■■■□ 3.26
EPHA10-211ENST00000540011 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.38■■■■□ 3.25
EPHA10-211ENST00000540011 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.38■■■■□ 3.25
EPHA10-211ENST00000540011 ITGAEP38570 1179 aa35.37■■■■□ 3.25
EPHA10-211ENST00000540011 PLXNC1O60486 1568 aa35.37■■■■□ 3.25
EPHA10-211ENST00000540011 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.35■■■■□ 3.25
EPHA10-211ENST00000540011 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.33■■■■□ 3.25
EPHA10-211ENST00000540011 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
EPHA10-211ENST00000540011 KIF15Q9NS87 1388 aa35.32■■■■□ 3.24
EPHA10-211ENST00000540011 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
EPHA10-211ENST00000540011 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.29■■■■□ 3.24
EPHA10-211ENST00000540011 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.27■■■■□ 3.24
EPHA10-211ENST00000540011 KIF3BO15066 747 aa35.26■■■■□ 3.24
EPHA10-211ENST00000540011 ADGRL2O95490 1459 aa35.26■■■■□ 3.23
EPHA10-211ENST00000540011 NCOA1Q15788 1441 aa35.25■■■■□ 3.23
EPHA10-211ENST00000540011 GGT6Q6P531 493 aa35.24■■■■□ 3.23
EPHA10-211ENST00000540011 MADDQ8WXG6 1647 aa35.22■■■■□ 3.23
EPHA10-211ENST00000540011 ROCK1Q13464 1354 aa35.2■■■■□ 3.23
EPHA10-211ENST00000540011 PTPRKQ15262 1439 aa35.2■■■■□ 3.23
EPHA10-211ENST00000540011 ERBINQ96RT1 1412 aa35.19■■■■□ 3.22
EPHA10-211ENST00000540011 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.18■■■■□ 3.22
EPHA10-211ENST00000540011 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
EPHA10-211ENST00000540011 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.17■■■■□ 3.22
EPHA10-211ENST00000540011 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms