RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
ACVR1B-204ENST00000536420 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF14Q15058 1648 aa39.48■■■■□ 3.91
ACVR1B-204ENST00000536420 CLIP1P30622 1438 aa39.47■■■■□ 3.91
ACVR1B-204ENST00000536420 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.43■■■■□ 3.9
ACVR1B-204ENST00000536420 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.4■■■■□ 3.9
ACVR1B-204ENST00000536420 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
ACVR1B-204ENST00000536420 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.36■■■■□ 3.89
ACVR1B-204ENST00000536420 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.36■■■■□ 3.89
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.33■■■■□ 3.89
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP10AO60312 1499 aa39.32■■■■□ 3.89
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.31■■■■□ 3.88
ACVR1B-204ENST00000536420 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
ACVR1B-204ENST00000536420 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.31■■■■□ 3.88
ACVR1B-204ENST00000536420 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.26■■■■□ 3.88
ACVR1B-204ENST00000536420 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.25■■■■□ 3.87
ACVR1B-204ENST00000536420 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.24■■■■□ 3.87
ACVR1B-204ENST00000536420 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.23■■■■□ 3.87
ACVR1B-204ENST00000536420 KDM5CP41229 1560 aa39.22■■■■□ 3.87
ACVR1B-204ENST00000536420 MLECQ14165 292 aa39.21■■■■□ 3.87
ACVR1B-204ENST00000536420 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.2■■■■□ 3.87
ACVR1B-204ENST00000536420 AFAP1Q8N556 730 aa39.19■■■■□ 3.86
ACVR1B-204ENST00000536420 PREX2Q70Z35 1606 aa39.18■■■■□ 3.86
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.14■■■■□ 3.86
ACVR1B-204ENST00000536420 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.12■■■■□ 3.85
ACVR1B-204ENST00000536420 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.11■■■■□ 3.85
ACVR1B-204ENST00000536420 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.09■■■■□ 3.85
ACVR1B-204ENST00000536420 REREQ9P2R6 1566 aa39.08■■■■□ 3.85
ACVR1B-204ENST00000536420 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.07■■■■□ 3.85
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCC1P33527 1531 aa39.07■■■■□ 3.84
ACVR1B-204ENST00000536420 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.05■■■■□ 3.84
ACVR1B-204ENST00000536420 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.03■■■■□ 3.84
ACVR1B-204ENST00000536420 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39■■■■□ 3.83
ACVR1B-204ENST00000536420 FBXO41Q8TF61 875 aa39■■■■□ 3.83
ACVR1B-204ENST00000536420 HSPA2P54652 639 aa38.99■■■■□ 3.83
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCA6Q8N139 1617 aa38.97■■■■□ 3.83
ACVR1B-204ENST00000536420 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
ACVR1B-204ENST00000536420 AGLP35573 1532 aa38.94■■■■□ 3.82
ACVR1B-204ENST00000536420 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.94■■■■□ 3.82
ACVR1B-204ENST00000536420 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
ACVR1B-204ENST00000536420 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.9■■■■□ 3.82
ACVR1B-204ENST00000536420 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
ACVR1B-204ENST00000536420 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
ACVR1B-204ENST00000536420 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
ACVR1B-204ENST00000536420 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.83■■■■□ 3.81
ACVR1B-204ENST00000536420 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.82■■■■□ 3.81
ACVR1B-204ENST00000536420 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.82■■■■□ 3.8
ACVR1B-204ENST00000536420 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.81■■■■□ 3.8
ACVR1B-204ENST00000536420 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
ACVR1B-204ENST00000536420 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.79■■■■□ 3.8
ACVR1B-204ENST00000536420 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
ACVR1B-204ENST00000536420 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.77■■■■□ 3.8
ACVR1B-204ENST00000536420 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.76■■■■□ 3.8
ACVR1B-204ENST00000536420 C3P01024 1663 aa38.75■■■■□ 3.79
ACVR1B-204ENST00000536420 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.75■■■■□ 3.79
ACVR1B-204ENST00000536420 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.72■■■■□ 3.79
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP7AQ04656 1500 aa38.68■■■■□ 3.78
ACVR1B-204ENST00000536420 CEP162Q5TB80 1403 aa38.67■■■■□ 3.78
ACVR1B-204ENST00000536420 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.67■■■■□ 3.78
ACVR1B-204ENST00000536420 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
ACVR1B-204ENST00000536420 MROH2AA6NES4 1674 aa38.62■■■■□ 3.77
ACVR1B-204ENST00000536420 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
ACVR1B-204ENST00000536420 STRCQ7RTU9 1775 aa38.62■■■■□ 3.77
ACVR1B-204ENST00000536420 CERKQ8TCT0 537 aa38.61■■■■□ 3.77
ACVR1B-204ENST00000536420 TIAM1Q13009 1591 aa38.6■■■■□ 3.77
ACVR1B-204ENST00000536420 A2MP01023 1474 aa38.58■■■■□ 3.77
ACVR1B-204ENST00000536420 PLXNC1O60486 1568 aa38.57■■■■□ 3.76
ACVR1B-204ENST00000536420 NPATQ14207 1427 aa38.55■■■■□ 3.76
ACVR1B-204ENST00000536420 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.53■■■■□ 3.76
ACVR1B-204ENST00000536420 ZMYM3Q14202 1370 aa38.52■■■■□ 3.76
ACVR1B-204ENST00000536420 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.51■■■■□ 3.76
ACVR1B-204ENST00000536420 MBD5Q9P267 1494 aa38.5■■■■□ 3.75
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
ACVR1B-204ENST00000536420 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.49■■■■□ 3.75
ACVR1B-204ENST00000536420 PTPRTO14522 1441 aa38.46■■■■□ 3.75
ACVR1B-204ENST00000536420 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
ACVR1B-204ENST00000536420 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.44■■■■□ 3.74
ACVR1B-204ENST00000536420 GGT6Q6P531 493 aa38.42■■■■□ 3.74
ACVR1B-204ENST00000536420 NCOA2Q15596 1464 aa38.41■■■■□ 3.74
ACVR1B-204ENST00000536420 NCOA1Q15788 1441 aa38.36■■■■□ 3.73
ACVR1B-204ENST00000536420 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
ACVR1B-204ENST00000536420 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.35■■■■□ 3.73
ACVR1B-204ENST00000536420 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.32■■■■□ 3.72
ACVR1B-204ENST00000536420 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.31■■■■□ 3.72
ACVR1B-204ENST00000536420 PTPRKQ15262 1439 aa38.3■■■■□ 3.72
ACVR1B-204ENST00000536420 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.3■■■■□ 3.72
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
ACVR1B-204ENST00000536420 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.25■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.23■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.23■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.23■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 TSPY4P0CV99 314 aa38.22■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 TSPY10P0CW01 314 aa38.22■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.22■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 PLA2R1Q13018 1463 aa38.21■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF3BO15066 747 aa38.2■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 MAP3K1Q13233 1512 aa38.2■■■■□ 3.71
ACVR1B-204ENST00000536420 PKD2Q13563 968 aa38.18■■■■□ 3.7
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