RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3-210ENST00000533686 PREX2Q70Z35 1606 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-210ENST00000533686 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.58■■□□□ 1.69
PACSIN3-210ENST00000533686 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
PACSIN3-210ENST00000533686 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3-210ENST00000533686 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM6BO15054 1643 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-210ENST00000533686 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-210ENST00000533686 ADGRL1O94910 1474 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 MIA2Q96PC5 1412 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-210ENST00000533686 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 RAPGEF3O95398 923 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCC1P33527 1531 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.39■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
PACSIN3-210ENST00000533686 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 AFAP1Q8N556 730 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 RICTORQ6R327 1708 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 MBD5Q9P267 1494 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM5CP41229 1560 aa25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-210ENST00000533686 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-210ENST00000533686 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3-210ENST00000533686 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-210ENST00000533686 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPY4P0CV99 314 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPY10P0CW01 314 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCC5O15440 1437 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP10AO60312 1499 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 DAPK1P53355 1430 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP7AQ04656 1500 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-210ENST00000533686 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-210ENST00000533686 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-210ENST00000533686 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-210ENST00000533686 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCA6Q8N139 1617 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-210ENST00000533686 REREQ9P2R6 1566 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-210ENST00000533686 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 A2MP01023 1474 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 PTPRKQ15262 1439 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 ADGRL2O95490 1459 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 AGLP35573 1532 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-210ENST00000533686 PLXNC1O60486 1568 aa25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 NCOA1Q15788 1441 aa25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 ITGAEP38570 1179 aa24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 ROCK1Q13464 1354 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 KIF15Q9NS87 1388 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-210ENST00000533686 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-210ENST00000533686 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-210ENST00000533686 ERBINQ96RT1 1412 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-210ENST00000533686 KIF3BO15066 747 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-210ENST00000533686 MLECQ14165 292 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-210ENST00000533686 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-210ENST00000533686 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-210ENST00000533686 GGT6Q6P531 493 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-210ENST00000533686 HFM1A2PYH4 1435 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-210ENST00000533686 NAIPQ13075 1403 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-210ENST00000533686 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
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