RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
PKP3-210ENST00000533249 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.52■■■■□ 3.6
PKP3-210ENST00000533249 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.51■■■■□ 3.59
PKP3-210ENST00000533249 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.5■■■■□ 3.59
PKP3-210ENST00000533249 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
PKP3-210ENST00000533249 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.48■■■■□ 3.59
PKP3-210ENST00000533249 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.48■■■■□ 3.59
PKP3-210ENST00000533249 CLIP1P30622 1438 aa37.44■■■■□ 3.58
PKP3-210ENST00000533249 MLECQ14165 292 aa37.41■■■■□ 3.58
PKP3-210ENST00000533249 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.41■■■■□ 3.58
PKP3-210ENST00000533249 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
PKP3-210ENST00000533249 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.4■■■■□ 3.58
PKP3-210ENST00000533249 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.37■■■■□ 3.57
PKP3-210ENST00000533249 ATP10AO60312 1499 aa37.34■■■■□ 3.57
PKP3-210ENST00000533249 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.34■■■■□ 3.57
PKP3-210ENST00000533249 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.31■■■■□ 3.56
PKP3-210ENST00000533249 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.3■■■■□ 3.56
PKP3-210ENST00000533249 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.3■■■■□ 3.56
PKP3-210ENST00000533249 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.3■■■■□ 3.56
PKP3-210ENST00000533249 AFAP1Q8N556 730 aa37.28■■■■□ 3.56
PKP3-210ENST00000533249 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.27■■■■□ 3.56
PKP3-210ENST00000533249 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.25■■■■□ 3.55
PKP3-210ENST00000533249 KDM5CP41229 1560 aa37.24■■■■□ 3.55
PKP3-210ENST00000533249 HSPA2P54652 639 aa37.22■■■■□ 3.55
PKP3-210ENST00000533249 PREX2Q70Z35 1606 aa37.21■■■■□ 3.55
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.2■■■■□ 3.55
PKP3-210ENST00000533249 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.19■■■■□ 3.54
PKP3-210ENST00000533249 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.14■■■■□ 3.54
PKP3-210ENST00000533249 ABCC1P33527 1531 aa37.13■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.11■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.1■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 FBXO41Q8TF61 875 aa37.1■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.09■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.09■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 ABCA6Q8N139 1617 aa37.09■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PKP3-210ENST00000533249 REREQ9P2R6 1566 aa37.04■■■■□ 3.52
PKP3-210ENST00000533249 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PKP3-210ENST00000533249 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.99■■■■□ 3.51
PKP3-210ENST00000533249 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.96■■■■□ 3.51
PKP3-210ENST00000533249 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PKP3-210ENST00000533249 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.95■■■■□ 3.51
PKP3-210ENST00000533249 AGLP35573 1532 aa36.93■■■■□ 3.5
PKP3-210ENST00000533249 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.91■■■■□ 3.5
PKP3-210ENST00000533249 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
PKP3-210ENST00000533249 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.88■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.87■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 C3P01024 1663 aa36.86■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.85■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.85■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
PKP3-210ENST00000533249 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.78■■■■□ 3.48
PKP3-210ENST00000533249 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.77■■■■□ 3.48
PKP3-210ENST00000533249 ATP7AQ04656 1500 aa36.75■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 CERKQ8TCT0 537 aa36.74■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.74■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 STRCQ7RTU9 1775 aa36.73■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 CEP162Q5TB80 1403 aa36.73■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.7■■■■□ 3.47
PKP3-210ENST00000533249 TIAM1Q13009 1591 aa36.7■■■■□ 3.46
PKP3-210ENST00000533249 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.68■■■■□ 3.46
PKP3-210ENST00000533249 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
PKP3-210ENST00000533249 A2MP01023 1474 aa36.65■■■■□ 3.46
PKP3-210ENST00000533249 MROH2AA6NES4 1674 aa36.63■■■■□ 3.45
PKP3-210ENST00000533249 PLXNC1O60486 1568 aa36.62■■■■□ 3.45
PKP3-210ENST00000533249 ZMYM3Q14202 1370 aa36.59■■■■□ 3.45
PKP3-210ENST00000533249 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
PKP3-210ENST00000533249 GGT6Q6P531 493 aa36.56■■■■□ 3.44
PKP3-210ENST00000533249 NPATQ14207 1427 aa36.56■■■■□ 3.44
PKP3-210ENST00000533249 MBD5Q9P267 1494 aa36.56■■■■□ 3.44
PKP3-210ENST00000533249 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.54■■■■□ 3.44
PKP3-210ENST00000533249 PTPRTO14522 1441 aa36.52■■■■□ 3.44
PKP3-210ENST00000533249 NCOA2Q15596 1464 aa36.49■■■■□ 3.43
PKP3-210ENST00000533249 NCOA1Q15788 1441 aa36.48■■■■□ 3.43
PKP3-210ENST00000533249 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.46■■■■□ 3.43
PKP3-210ENST00000533249 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.45■■■■□ 3.42
PKP3-210ENST00000533249 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.43■■■■□ 3.42
PKP3-210ENST00000533249 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.41■■■■□ 3.42
PKP3-210ENST00000533249 PTPRKQ15262 1439 aa36.41■■■■□ 3.42
PKP3-210ENST00000533249 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.4■■■■□ 3.42
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PKP3-210ENST00000533249 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.39■■■■□ 3.42
PKP3-210ENST00000533249 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.39■■■■□ 3.42
PKP3-210ENST00000533249 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
PKP3-210ENST00000533249 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.34■■■■□ 3.41
PKP3-210ENST00000533249 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.34■■■■□ 3.41
PKP3-210ENST00000533249 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
PKP3-210ENST00000533249 KIF3BO15066 747 aa36.32■■■■□ 3.4
PKP3-210ENST00000533249 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.32■■■■□ 3.4
PKP3-210ENST00000533249 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.31■■■■□ 3.4
PKP3-210ENST00000533249 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.29■■■■□ 3.4
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.25■■■■□ 3.39
PKP3-210ENST00000533249 PLA2R1Q13018 1463 aa36.24■■■■□ 3.39
PKP3-210ENST00000533249 TSPY4P0CV99 314 aa36.23■■■■□ 3.39
PKP3-210ENST00000533249 TSPY10P0CW01 314 aa36.23■■■■□ 3.39
PKP3-210ENST00000533249 PKD2Q13563 968 aa36.21■■■■□ 3.39
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