RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.24■■■■■ 6.75
PKP3-210ENST00000533249 ABCC9O60706 1549 aa51.43■■■■■ 5.82
PKP3-210ENST00000533249 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.35■■■■■ 5.81
PKP3-210ENST00000533249 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.9■■■■■ 5.42
PKP3-210ENST00000533249 NACADO15069 1562 aa48.54■■■■■ 5.36
PKP3-210ENST00000533249 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.42■■■■■ 5.34
PKP3-210ENST00000533249 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.21■■■■■ 5.31
PKP3-210ENST00000533249 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.89■■■■■ 5.26
PKP3-210ENST00000533249 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.82■■■■■ 5.25
PKP3-210ENST00000533249 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.81■■■■■ 5.24
PKP3-210ENST00000533249 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.47■■■■■ 5.19
PKP3-210ENST00000533249 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
PKP3-210ENST00000533249 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.23■■■■■ 5.15
PKP3-210ENST00000533249 SCRIBQ14160 1630 aa46.86■■■■■ 5.09
PKP3-210ENST00000533249 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.76■■■■■ 5.08
PKP3-210ENST00000533249 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.42■■■■■ 5.02
PKP3-210ENST00000533249 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
PKP3-210ENST00000533249 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.29■■■■■ 5
PKP3-210ENST00000533249 NCAPD3P42695 1498 aa44.8■■■■■ 4.76
PKP3-210ENST00000533249 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.7■■■■■ 4.75
PKP3-210ENST00000533249 SMARCA4P51532 1647 aa44.66■■■■■ 4.74
PKP3-210ENST00000533249 SMARCA2P51531 1590 aa44.56■■■■■ 4.72
PKP3-210ENST00000533249 HMGXB3Q12766 1538 aa44.48■■■■■ 4.71
PKP3-210ENST00000533249 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
PKP3-210ENST00000533249 ERCC6Q03468 1493 aa44.4■■■■■ 4.7
PKP3-210ENST00000533249 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
PKP3-210ENST00000533249 CUX2O14529 1486 aa44.25■■■■■ 4.67
PKP3-210ENST00000533249 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.24■■■■■ 4.67
PKP3-210ENST00000533249 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.18■■■■■ 4.66
PKP3-210ENST00000533249 NESP48681 1621 aa44.17■■■■■ 4.66
PKP3-210ENST00000533249 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.13■■■■■ 4.65
PKP3-210ENST00000533249 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.81■■■■■ 4.6
PKP3-210ENST00000533249 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
PKP3-210ENST00000533249 WIZO95785 1651 aa43.61■■■■■ 4.57
PKP3-210ENST00000533249 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.59■■■■■ 4.57
PKP3-210ENST00000533249 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.56■■■■■ 4.56
PKP3-210ENST00000533249 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.46■■■■■ 4.55
PKP3-210ENST00000533249 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.2■■■■■ 4.51
PKP3-210ENST00000533249 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
PKP3-210ENST00000533249 WDR62O43379 1518 aa43.07■■■■■ 4.49
PKP3-210ENST00000533249 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.04■■■■■ 4.48
PKP3-210ENST00000533249 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
PKP3-210ENST00000533249 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43■■■■■ 4.47
PKP3-210ENST00000533249 CFTRP13569 1480 aa42.96■■■■■ 4.47
PKP3-210ENST00000533249 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
PKP3-210ENST00000533249 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.55■■■■■ 4.4
PKP3-210ENST00000533249 PRDM2Q13029 1718 aa42.54■■■■■ 4.4
PKP3-210ENST00000533249 TRIM41Q8WV44 630 aa42.39■■■■■ 4.38
PKP3-210ENST00000533249 OSCARQ8IYS5 282 aa42.26■■■■■ 4.36
PKP3-210ENST00000533249 TOPBP1Q92547 1522 aa42.18■■■■■ 4.34
PKP3-210ENST00000533249 IFT140Q96RY7 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
PKP3-210ENST00000533249 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
PKP3-210ENST00000533249 ABCC8Q09428 1581 aa42.05■■■■■ 4.32
PKP3-210ENST00000533249 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.01■■■■■ 4.32
PKP3-210ENST00000533249 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
PKP3-210ENST00000533249 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
PKP3-210ENST00000533249 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.75■■■■■ 4.272e-6■■■■■ 27.4
PKP3-210ENST00000533249 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
PKP3-210ENST00000533249 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
PKP3-210ENST00000533249 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
PKP3-210ENST00000533249 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
PKP3-210ENST00000533249 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.62■■■■■ 4.25
PKP3-210ENST00000533249 CHD1O14646 1710 aa41.59■■■■■ 4.25
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF11O15085 1522 aa41.59■■■■■ 4.25
PKP3-210ENST00000533249 SOGA1O94964 1423 aa41.57■■■■■ 4.25
PKP3-210ENST00000533249 FBLN2P98095 1184 aa41.52■■■■■ 4.24
PKP3-210ENST00000533249 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
PKP3-210ENST00000533249 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.5■■■■■ 4.23
PKP3-210ENST00000533249 CUX1P39880 1505 aa41.45■■■■■ 4.23
PKP3-210ENST00000533249 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
PKP3-210ENST00000533249 WDR97A6NE52 1622 aa41.33■■■■■ 4.21
PKP3-210ENST00000533249 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.32■■■■■ 4.2
PKP3-210ENST00000533249 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.31■■■■■ 4.2
PKP3-210ENST00000533249 GRIN2BQ13224 1484 aa41.2■■■■■ 4.19
PKP3-210ENST00000533249 ARAP1Q96P48 1450 aa41.18■■■■■ 4.18
PKP3-210ENST00000533249 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
PKP3-210ENST00000533249 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
PKP3-210ENST00000533249 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.08■■■■■ 4.17
PKP3-210ENST00000533249 SYNJ1O43426 1573 aa41.07■■■■■ 4.16
PKP3-210ENST00000533249 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.06■■■■■ 4.16
PKP3-210ENST00000533249 PBRM1Q86U86 1689 aa41.05■■■■■ 4.16
PKP3-210ENST00000533249 SYNJ2O15056 1496 aa41.05■■■■■ 4.16
PKP3-210ENST00000533249 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41■■■■■ 4.15
PKP3-210ENST00000533249 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.95■■■■■ 4.15
PKP3-210ENST00000533249 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
PKP3-210ENST00000533249 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
PKP3-210ENST00000533249 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.78■■■■■ 4.12
PKP3-210ENST00000533249 TOP2BQ02880 1626 aa40.78■■■■■ 4.12
PKP3-210ENST00000533249 GRIN2AQ12879 1464 aa40.67■■■■■ 4.1
PKP3-210ENST00000533249 ADAMTS12P58397 1594 aa40.65■■■■■ 4.1
PKP3-210ENST00000533249 CEP170Q5SW79 1584 aa40.53■■■■■ 4.08
PKP3-210ENST00000533249 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.52■■■■■ 4.08
PKP3-210ENST00000533249 NUP160Q12769 1436 aa40.5■■■■■ 4.07
PKP3-210ENST00000533249 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.48■■■■■ 4.07
PKP3-210ENST00000533249 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.48■■■■■ 4.07
PKP3-210ENST00000533249 SHROOM2Q13796 1616 aa40.33■■■■■ 4.05
PKP3-210ENST00000533249 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
PKP3-210ENST00000533249 JPH4Q96JJ6 628 aa40.12■■■■■ 4.01
PKP3-210ENST00000533249 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.07■■■■■ 4.01
PKP3-210ENST00000533249 KIF27Q86VH2 1401 aa39.99■■■■□ 3.99
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