RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.44■■■■□ 3.9
ACER3-211ENST00000531461 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.44■■■■□ 3.9
ACER3-211ENST00000531461 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.4■■■■□ 3.9
ACER3-211ENST00000531461 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.4■■■■□ 3.9
ACER3-211ENST00000531461 CLIP1P30622 1438 aa39.38■■■■□ 3.89
ACER3-211ENST00000531461 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.35■■■■□ 3.89
ACER3-211ENST00000531461 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
ACER3-211ENST00000531461 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.33■■■■□ 3.89
ACER3-211ENST00000531461 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
ACER3-211ENST00000531461 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.31■■■■□ 3.88
ACER3-211ENST00000531461 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.26■■■■□ 3.88
ACER3-211ENST00000531461 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.26■■■■□ 3.88
ACER3-211ENST00000531461 ATP10AO60312 1499 aa39.24■■■■□ 3.87
ACER3-211ENST00000531461 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.23■■■■□ 3.87
ACER3-211ENST00000531461 KDM5CP41229 1560 aa39.22■■■■□ 3.87
ACER3-211ENST00000531461 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.21■■■■□ 3.87
ACER3-211ENST00000531461 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.21■■■■□ 3.87
ACER3-211ENST00000531461 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.18■■■■□ 3.86
ACER3-211ENST00000531461 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.17■■■■□ 3.86
ACER3-211ENST00000531461 PREX2Q70Z35 1606 aa39.17■■■■□ 3.86
ACER3-211ENST00000531461 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.13■■■■□ 3.85
ACER3-211ENST00000531461 AFAP1Q8N556 730 aa39.11■■■■□ 3.85
ACER3-211ENST00000531461 MLECQ14165 292 aa39.07■■■■□ 3.85
ACER3-211ENST00000531461 ABCC1P33527 1531 aa39.07■■■■□ 3.84
ACER3-211ENST00000531461 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.06■■■■□ 3.84
ACER3-211ENST00000531461 REREQ9P2R6 1566 aa39.06■■■■□ 3.84
ACER3-211ENST00000531461 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.06■■■■□ 3.84
ACER3-211ENST00000531461 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.04■■■■□ 3.84
ACER3-211ENST00000531461 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.02■■■■□ 3.84
ACER3-211ENST00000531461 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.97■■■■□ 3.83
ACER3-211ENST00000531461 ABCA6Q8N139 1617 aa38.97■■■■□ 3.83
ACER3-211ENST00000531461 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.92■■■■□ 3.82
ACER3-211ENST00000531461 AGLP35573 1532 aa38.91■■■■□ 3.82
ACER3-211ENST00000531461 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.91■■■■□ 3.82
ACER3-211ENST00000531461 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.89■■■■□ 3.82
ACER3-211ENST00000531461 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
ACER3-211ENST00000531461 HSPA2P54652 639 aa38.88■■■■□ 3.81
ACER3-211ENST00000531461 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.87■■■■□ 3.81
ACER3-211ENST00000531461 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
ACER3-211ENST00000531461 FBXO41Q8TF61 875 aa38.85■■■■□ 3.81
ACER3-211ENST00000531461 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
ACER3-211ENST00000531461 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
ACER3-211ENST00000531461 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.78■■■■□ 3.8
ACER3-211ENST00000531461 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.78■■■■□ 3.8
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.75■■■■□ 3.79
ACER3-211ENST00000531461 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
ACER3-211ENST00000531461 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.74■■■■□ 3.79
ACER3-211ENST00000531461 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.72■■■■□ 3.79
ACER3-211ENST00000531461 C3P01024 1663 aa38.71■■■■□ 3.79
ACER3-211ENST00000531461 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
ACER3-211ENST00000531461 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.67■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 CEP162Q5TB80 1403 aa38.66■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.66■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.66■■■■□ 3.781e-6■■■■■ 27.5
ACER3-211ENST00000531461 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.66■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 ATP7AQ04656 1500 aa38.64■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
ACER3-211ENST00000531461 TIAM1Q13009 1591 aa38.61■■■■□ 3.77
ACER3-211ENST00000531461 PLXNC1O60486 1568 aa38.58■■■■□ 3.77
ACER3-211ENST00000531461 STRCQ7RTU9 1775 aa38.58■■■■□ 3.77
ACER3-211ENST00000531461 MROH2AA6NES4 1674 aa38.58■■■■□ 3.77
ACER3-211ENST00000531461 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
ACER3-211ENST00000531461 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.52■■■■□ 3.76
ACER3-211ENST00000531461 A2MP01023 1474 aa38.52■■■■□ 3.76
ACER3-211ENST00000531461 MBD5Q9P267 1494 aa38.5■■■■□ 3.75
ACER3-211ENST00000531461 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.49■■■■□ 3.75
ACER3-211ENST00000531461 NPATQ14207 1427 aa38.48■■■■□ 3.75
ACER3-211ENST00000531461 CERKQ8TCT0 537 aa38.47■■■■□ 3.75
ACER3-211ENST00000531461 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
ACER3-211ENST00000531461 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.44■■■■□ 3.74
ACER3-211ENST00000531461 ZMYM3Q14202 1370 aa38.44■■■■□ 3.74
ACER3-211ENST00000531461 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.39■■■■□ 3.74
ACER3-211ENST00000531461 NCOA2Q15596 1464 aa38.39■■■■□ 3.74
ACER3-211ENST00000531461 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
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ACER3-211ENST00000531461 NCOA1Q15788 1441 aa38.31■■■■□ 3.72
ACER3-211ENST00000531461 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.31■■■■□ 3.72
ACER3-211ENST00000531461 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.3■■■■□ 3.72
ACER3-211ENST00000531461 GGT6Q6P531 493 aa38.3■■■■□ 3.72
ACER3-211ENST00000531461 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.29■■■■□ 3.72
ACER3-211ENST00000531461 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.29■■■■□ 3.72
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ACER3-211ENST00000531461 PTPRKQ15262 1439 aa38.27■■■■□ 3.72
ACER3-211ENST00000531461 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.71
ACER3-211ENST00000531461 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.23■■■■□ 3.71
ACER3-211ENST00000531461 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.23■■■■□ 3.71
ACER3-211ENST00000531461 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.23■■■■□ 3.71
ACER3-211ENST00000531461 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.22■■■■□ 3.71
ACER3-211ENST00000531461 MAP3K1Q13233 1512 aa38.19■■■■□ 3.7
ACER3-211ENST00000531461 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.19■■■■□ 3.7
ACER3-211ENST00000531461 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.18■■■■□ 3.7
ACER3-211ENST00000531461 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
ACER3-211ENST00000531461 PLA2R1Q13018 1463 aa38.15■■■■□ 3.7
ACER3-211ENST00000531461 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.14■■■■□ 3.7
ACER3-211ENST00000531461 KIF3BO15066 747 aa38.1■■■■□ 3.69
ACER3-211ENST00000531461 TSPY4P0CV99 314 aa38.08■■■■□ 3.69
ACER3-211ENST00000531461 TSPY10P0CW01 314 aa38.08■■■■□ 3.69
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