RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530721.5

RPS3-216, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 796 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-216ENST00000530721 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS3-216ENST00000530721 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.83■□□□□ 0.92
RPS3-216ENST00000530721 PTPRMP28827 1452 aa20.81■□□□□ 0.92
RPS3-216ENST00000530721 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.81■□□□□ 0.92
RPS3-216ENST00000530721 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.8■□□□□ 0.92
RPS3-216ENST00000530721 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.79■□□□□ 0.92
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RPS3-216ENST00000530721 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.75■□□□□ 0.91
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RPS3-216ENST00000530721 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.72■□□□□ 0.91
RPS3-216ENST00000530721 ATP10AO60312 1499 aa20.71■□□□□ 0.91
RPS3-216ENST00000530721 KDM5CP41229 1560 aa20.71■□□□□ 0.91
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RPS3-216ENST00000530721 AFAP1Q8N556 730 aa20.7■□□□□ 0.9
RPS3-216ENST00000530721 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.7■□□□□ 0.9
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RPS3-216ENST00000530721 ABCC1P33527 1531 aa20.66■□□□□ 0.9
RPS3-216ENST00000530721 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.66■□□□□ 0.9
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RPS3-216ENST00000530721 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 CEP162Q5TB80 1403 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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RPS3-216ENST00000530721 REREQ9P2R6 1566 aa20.59■□□□□ 0.89
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RPS3-216ENST00000530721 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS3-216ENST00000530721 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.57■□□□□ 0.88
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RPS3-216ENST00000530721 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.54■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 AGLP35573 1532 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS3-216ENST00000530721 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.872e-6■□□□□ 10
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RPS3-216ENST00000530721 TIAM1Q13009 1591 aa20.48■□□□□ 0.87
RPS3-216ENST00000530721 HSPA2P54652 639 aa20.47■□□□□ 0.87
RPS3-216ENST00000530721 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.46■□□□□ 0.87
RPS3-216ENST00000530721 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RPS3-216ENST00000530721 ATP7AQ04656 1500 aa20.45■□□□□ 0.86
RPS3-216ENST00000530721 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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RPS3-216ENST00000530721 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RPS3-216ENST00000530721 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.42■□□□□ 0.86
RPS3-216ENST00000530721 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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RPS3-216ENST00000530721 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.4■□□□□ 0.86
RPS3-216ENST00000530721 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RPS3-216ENST00000530721 MBD5Q9P267 1494 aa20.39■□□□□ 0.85
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RPS3-216ENST00000530721 A2MP01023 1474 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS3-216ENST00000530721 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS3-216ENST00000530721 PLXNC1O60486 1568 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS3-216ENST00000530721 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.34■□□□□ 0.85
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RPS3-216ENST00000530721 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.33■□□□□ 0.85
RPS3-216ENST00000530721 MROH2AA6NES4 1674 aa20.32■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.32■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 FBXO41Q8TF61 875 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 MAP3K1Q13233 1512 aa20.3■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 ZMYM3Q14202 1370 aa20.3■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 NPATQ14207 1427 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 GGT6Q6P531 493 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS3-216ENST00000530721 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.26■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.25■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 STRCQ7RTU9 1775 aa20.25■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 TSPY4P0CV99 314 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 TSPY10P0CW01 314 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS3-216ENST00000530721 PTPRKQ15262 1439 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 MIA2Q96PC5 1412 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 KIF3BO15066 747 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 CERKQ8TCT0 537 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 PTPRTO14522 1441 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 APLP2Q06481 763 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 NCOA1Q15788 1441 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS3-216ENST00000530721 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.15■□□□□ 0.82
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