RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.15■■□□□ 1.94
PACS1-208ENST00000529677 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
PACS1-208ENST00000529677 HECW1Q76N89 1606 aa27.13■■□□□ 1.93
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.13■■□□□ 1.93
PACS1-208ENST00000529677 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.13■■□□□ 1.93
PACS1-208ENST00000529677 CEP162Q5TB80 1403 aa27.1■■□□□ 1.93
PACS1-208ENST00000529677 MLECQ14165 292 aa27.08■■□□□ 1.93
PACS1-208ENST00000529677 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.07■■□□□ 1.92
PACS1-208ENST00000529677 CLIP1P30622 1438 aa27.07■■□□□ 1.92
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
PACS1-208ENST00000529677 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PACS1-208ENST00000529677 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PACS1-208ENST00000529677 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PACS1-208ENST00000529677 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.01■■□□□ 1.91
PACS1-208ENST00000529677 ATP10AO60312 1499 aa26.94■■□□□ 1.9
PACS1-208ENST00000529677 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.93■■□□□ 1.9
PACS1-208ENST00000529677 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.93■■□□□ 1.9
PACS1-208ENST00000529677 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PACS1-208ENST00000529677 PTPRTO14522 1441 aa26.91■■□□□ 1.9
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.9■■□□□ 1.9
PACS1-208ENST00000529677 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.89■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.88■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 PLCH2O75038 1416 aa26.87■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 C3P01024 1663 aa26.86■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.84■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 FMN1Q68DA7 1419 aa26.83■■□□□ 1.89
PACS1-208ENST00000529677 KDM5CP41229 1560 aa26.8■■□□□ 1.88
PACS1-208ENST00000529677 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.8■■□□□ 1.88
PACS1-208ENST00000529677 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.77■■□□□ 1.88
PACS1-208ENST00000529677 REREQ9P2R6 1566 aa26.76■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 NCOA1Q15788 1441 aa26.76■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.76■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 ABCA6Q8N139 1617 aa26.75■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 KIF14Q15058 1648 aa26.72■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.72■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.71■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.7■■□□□ 1.87
PACS1-208ENST00000529677 AFAP1Q8N556 730 aa26.67■■□□□ 1.86
PACS1-208ENST00000529677 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.65■■□□□ 1.86
PACS1-208ENST00000529677 AGLP35573 1532 aa26.65■■□□□ 1.86
PACS1-208ENST00000529677 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.64■■□□□ 1.85
PACS1-208ENST00000529677 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.63■■□□□ 1.85
PACS1-208ENST00000529677 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.6■■□□□ 1.85
PACS1-208ENST00000529677 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.6■■□□□ 1.85
PACS1-208ENST00000529677 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PACS1-208ENST00000529677 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.58■■□□□ 1.85
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.57■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.55■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.54■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.53■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 MROH2AA6NES4 1674 aa26.53■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 ABCC1P33527 1531 aa26.52■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K1Q13233 1512 aa26.52■■□□□ 1.84
PACS1-208ENST00000529677 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.51■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.51■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 NPATQ14207 1427 aa26.49■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.48■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.47■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 TIAM1Q13009 1591 aa26.47■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 PREX2Q70Z35 1606 aa26.47■■□□□ 1.83
PACS1-208ENST00000529677 PLA2R1Q13018 1463 aa26.44■■□□□ 1.82
PACS1-208ENST00000529677 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.41■■□□□ 1.82
PACS1-208ENST00000529677 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PACS1-208ENST00000529677 HSPA1LP34931 641 aa26.4■■□□□ 1.82
PACS1-208ENST00000529677 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PACS1-208ENST00000529677 ZMYM3Q14202 1370 aa26.39■■□□□ 1.82
PACS1-208ENST00000529677 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.36■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 ALKQ9UM73 1620 aa26.36■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.34■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 PTPRKQ15262 1439 aa26.34■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.33■■□□□ 1.81
PACS1-208ENST00000529677 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.32■■□□□ 1.8
PACS1-208ENST00000529677 PLXNC1O60486 1568 aa26.32■■□□□ 1.8
PACS1-208ENST00000529677 PKD2Q13563 968 aa26.31■■□□□ 1.8
PACS1-208ENST00000529677 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PACS1-208ENST00000529677 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.29■■□□□ 1.8
PACS1-208ENST00000529677 APLP2Q06481 763 aa26.28■■□□□ 1.8
PACS1-208ENST00000529677 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.25■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.24■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 PIP4K2BP78356 416 aa26.24■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 CPS1P31327 1500 aa26.21■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
PACS1-208ENST00000529677 ATP7AQ04656 1500 aa26.19■■□□□ 1.78
PACS1-208ENST00000529677 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.19■■□□□ 1.78
PACS1-208ENST00000529677 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.19■■□□□ 1.78
PACS1-208ENST00000529677 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.18■■□□□ 1.78
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