RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-215	ENST00000526116	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		34.22	■■■■□ 3.07
EML3-215	ENST00000526116	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		34.22	■■■■□ 3.07
EML3-215	ENST00000526116	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		34.22	■■■■□ 3.07
EML3-215	ENST00000526116	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.2	■■■■□ 3.06
EML3-215	ENST00000526116	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		34.2	■■■■□ 3.06
EML3-215	ENST00000526116	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.18	■■■■□ 3.06
EML3-215	ENST00000526116	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		34.14	■■■■□ 3.06
EML3-215	ENST00000526116	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		34.11	■■■■□ 3.05
EML3-215	ENST00000526116	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.07	■■■■□ 3.05
EML3-215	ENST00000526116	KDM5C	P41229	1560 aa		34.06	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		34.06	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	ABCC1	P33527	1531 aa		34.06	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		34.06	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		34.05	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		34.04	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		34.04	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		34.03	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		34.02	■■■■□ 3.04
EML3-215	ENST00000526116	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		34	■■■■□ 3.03
EML3-215	ENST00000526116	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.99	■■■■□ 3.03
EML3-215	ENST00000526116	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.97	■■■■□ 3.03
EML3-215	ENST00000526116	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.96	■■■■□ 3.03
EML3-215	ENST00000526116	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.95	■■■■□ 3.03
EML3-215	ENST00000526116	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.93	■■■■□ 3.02
EML3-215	ENST00000526116	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
EML3-215	ENST00000526116	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.92	■■■■□ 3.02
EML3-215	ENST00000526116	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.92	■■■■□ 3.02
EML3-215	ENST00000526116	ATP10A	O60312	1499 aa		33.92	■■■■□ 3.02
EML3-215	ENST00000526116	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.9	■■■■□ 3.02
EML3-215	ENST00000526116	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.9	■■■■□ 3.02
EML3-215	ENST00000526116	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.88	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.87	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.87	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	PTPRM	P28827	1452 aa		33.85	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.85	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.84	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.83	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.83	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.83	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.83	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.83	■■■■□ 3.01
EML3-215	ENST00000526116	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.81	■■■■□ 3
EML3-215	ENST00000526116	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.79	■■■■□ 3
EML3-215	ENST00000526116	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
EML3-215	ENST00000526116	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.75	■■■□□ 2.99
EML3-215	ENST00000526116	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.73	■■■□□ 2.99
EML3-215	ENST00000526116	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.72	■■■□□ 2.99
EML3-215	ENST00000526116	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
EML3-215	ENST00000526116	AGL	P35573	1532 aa		33.69	■■■□□ 2.98
EML3-215	ENST00000526116	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.68	■■■□□ 2.98
EML3-215	ENST00000526116	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
EML3-215	ENST00000526116	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.67	■■■□□ 2.98
EML3-215	ENST00000526116	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
EML3-215	ENST00000526116	MLEC	Q14165	292 aa		33.65	■■■□□ 2.98
EML3-215	ENST00000526116	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
EML3-215	ENST00000526116	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.62	■■■□□ 2.97
EML3-215	ENST00000526116	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EML3-215	ENST00000526116	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.55	■■■□□ 2.96
EML3-215	ENST00000526116	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.53	■■■□□ 2.96
EML3-215	ENST00000526116	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.53	■■■□□ 2.96
EML3-215	ENST00000526116	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.52	■■■□□ 2.96
EML3-215	ENST00000526116	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.5	■■■□□ 2.95
EML3-215	ENST00000526116	A2M	P01023	1474 aa		33.5	■■■□□ 2.95
EML3-215	ENST00000526116	APLP2	Q06481	763 aa		33.48	■■■□□ 2.95
EML3-215	ENST00000526116	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.48	■■■□□ 2.95
EML3-215	ENST00000526116	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.47	■■■□□ 2.95
EML3-215	ENST00000526116	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.46	■■■□□ 2.95
EML3-215	ENST00000526116	C3	P01024	1663 aa		33.42	■■■□□ 2.94
EML3-215	ENST00000526116	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.39	■■■□□ 2.94
EML3-215	ENST00000526116	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.38	■■■□□ 2.93
EML3-215	ENST00000526116	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.38	■■■□□ 2.93
EML3-215	ENST00000526116	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.37	■■■□□ 2.93
EML3-215	ENST00000526116	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.36	■■■□□ 2.93
EML3-215	ENST00000526116	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
EML3-215	ENST00000526116	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
EML3-215	ENST00000526116	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
EML3-215	ENST00000526116	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
EML3-215	ENST00000526116	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.31	■■■□□ 2.92
EML3-215	ENST00000526116	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.29	■■■□□ 2.92
EML3-215	ENST00000526116	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.29	■■■□□ 2.92
EML3-215	ENST00000526116	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
EML3-215	ENST00000526116	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.26	■■■□□ 2.91
EML3-215	ENST00000526116	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.26	■■■□□ 2.91
EML3-215	ENST00000526116	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
EML3-215	ENST00000526116	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.23	■■■□□ 2.91
EML3-215	ENST00000526116	GGT6	Q6P531	493 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-215	ENST00000526116	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.2	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.19	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	HSPA2	P54652	639 aa		33.19	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.19	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	NPAT	Q14207	1427 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	ABCC5	O15440	1437 aa		33.16	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	KIF3B	O15066	747 aa		33.15	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
EML3-215	ENST00000526116	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89

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